Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR000001169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]1MQRRIMGIEDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3
VIR000005169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]5IMGIETEFGDRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 8
VIR000012169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]12FGVTCTFHGDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR000018169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]18FHGHRRLSPDRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502 11
VIR000024169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]24LSPDEVARYDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR000032169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]32YLFRRVVSWDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 11
VIR000033169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]33LFRRVVSWGDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 7
VIR000034169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]34FRRVVSWGRDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 20
VIR000037169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]37VVSWGRSSNDRB1_0806, DRB1_1304 2
VIR000040169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]40WGRSSNVFLDRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 6
VIR000046169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]46VFLRNGARLDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4
VIR000047169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]47FLRNGARLYDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR000048169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]48LRNGARLYLDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 24
VIR000054169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]54LYLDVGSHPDRB1_0301, DRB1_1107 2
VIR000055169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]55YLDVGSHPEDRB1_0405 1
VIR000072169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]72LVQLVTHDRDRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 31
VIR000075169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]75LVTHDRAGEDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14
VIR000076169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]76VTHDRAGERDRB1_0301 1
VIR000085169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]85VLEDLLVDADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5
VIR000090169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]90LVDAEQRLSDRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 8
VIR000106169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]106IYLFKNNTDDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1304, DRB1_1501, DRB1_1506 9
VIR000107169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]107YLFKNNTDSDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 15
VIR000108169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]108LFKNNTDSADRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR000120169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]120YGCHENYLIDRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502 5
VIR000126169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]126YLIVRAGEFDRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 13
VIR000127169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]127LIVRAGEFSDRB1_0813 1
VIR000128169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]128IVRAGEFSRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR000134169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]134FSRISDVLLDRB1_0703 1
VIR000141169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]141LLPFLVTRQDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323 17
VIR000142169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]142LPFLVTRQLDRB1_0402, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 5
VIR000144169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]144FLVTRQLICDRB1_0703, DRB1_1101 2
VIR000145169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]145LVTRQLICGDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1506 7
VIR000146169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]146VTRQLICGADRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3
VIR000151169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]151ICGAGKVLQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 9
VIR000166169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]166YCLSQRAEHDRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 8
VIR000179169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]179VSSATTRSRDRB1_0402 1
VIR000203169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]203YRRLHVIVGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 47
VIR000208169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]208VIVGDSNMADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402 5
VIR000209169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]209IVGDSNMAEDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 13
VIR000221169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]221MLKVGTAALDRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 7
VIR000222169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]222LKVGTAALVDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR000229169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]229LVLEMIESGDRB1_0301, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4
VIR000231169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]231LEMIESGVADRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1307 4
VIR000243169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]243FSLDNPIRADRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 9
VIR000255169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]255VSHDLTGRRDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3
VIR000265169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]265VRLAGGRQADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 23
VIR000282169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]282YHARAVEHLDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817 5
VIR000287169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]287VEHLNTREPDRB1_0402 1
VIR000290169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]290LNTREPNEQDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 11
VIR000302169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]302VVELWGRTLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR000303169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]303VELWGRTLDDRB1_1304 1
VIR000318169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]318FSKVDTEIDDRB1_0405 1
VIR000327169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]327WVIKRKLFQDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 33
VIR000328169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]328VIKRKLFQRDRB1_0804, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4
VIR000337169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]337YQDRYNMELDRB1_0817 1
VIR000341169629269 YP 001702918.1 hypotheticalproteinMAB 2183[MycobacteriumabscessusATCC19977]341YNMELSDPKDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
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