Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR027497339632132 YP 004723774.1 hypotheticalproteinMAF 21110[MycobacteriumafricanumGM041182]432VLCKDPFRADRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14
VIR027503339632132 YP 004723774.1 hypotheticalproteinMAF 21110[MycobacteriumafricanumGM041182]438FRAVDERVKDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR027521339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]12IPRDSPLSSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR027538339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]29LRREAAVLRDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB5_0101, DRB5_0105 7
VIR027553339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]44VGSHAPTRSDRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 9
VIR027565339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]56IHQLEARIDDRB1_1304 1
VIR027610339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]101YGVLLATHDDRB1_0405 1
VIR027625339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]116FTSGRKMRLDRB1_0305, DRB1_0309 2
VIR027631339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]122MRLTCSPNIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 22
VIR027650339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]141VRLNEALTVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 44
VIR027652339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]143LNEALTVVEDRB1_0410 1
VIR027656339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]147LTVVEAGTFDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR027658339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]149VVEAGTFEADRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 11
VIR027667339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]158VGEISTLREDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3
VIR027694339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]185VVWLADPLIDRB1_0102, DRB1_1506 2
VIR027695339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]186VWLADPLIADRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322 13
VIR027696339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]187WLADPLIAEDRB1_0305, DRB1_0309 2
VIR027714339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]205LNDDTRPRKDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_1107 3
VIR027723339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]214LRPGDSLLVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 15
VIR027729339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]220LLVDTKAGYDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR027737339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]228YAFERIPKADRB1_0401 1
VIR027739339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]230FERIPKAEVDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 9
VIR027750339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]241LVLEEVPDVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 15
VIR027760339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]251YADIGGLSRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR027763339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]254IGGLSRQIEDRB1_0806, DRB1_1304 2
VIR027781339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]272FLHKELYREDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3
VIR027786339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]277LYREYSLRPDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR027787339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]278YREYSLRPPDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 6
VIR027790339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]281YSLRPPKGVDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817 3
VIR027792339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]283LRPPKGVLLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR027798339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]289VLLYGPPGCDRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 16
VIR027799339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]290LLYGPPGCGDRB1_0301 1
VIR027810339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]301LIAKAVANSDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 23
VIR027826339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]317VRGDDAHEADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR027837339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]328YFLNIKGPEDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 9
VIR027838339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]329FLNIKGPELDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 7
VIR027839339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]330LNIKGPELLDRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304 5
VIR027846339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]337LLNKFVGETDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5
VIR027850339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]341FVGETERHIDRB1_0101 1
VIR027858339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]349IRLIFQRARDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 23
VIR027860339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]351LIFQRAREKDRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 14
VIR027861339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]352IFQRAREKADRB1_0804, DRB1_0813 2
VIR027876339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]367IVFFDEMDSDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33
VIR027877339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]368VFFDEMDSIDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6
VIR027879339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]370FDEMDSIFRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR027885339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]376IFRTRGTGVDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR027886339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]377FRTRGTGVSDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 21
VIR027901339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]392VVPQLLSEIDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 13
VIR027912339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]403VEGLENVIVDRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423 3
VIR027915339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]406LENVIVIGADRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 7
VIR027918339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]409VIVIGASNRDRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR027919339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]410IVIGASNREDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1304 13
VIR027920339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]411VIGASNREDDRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_1304 3
VIR027921339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]412IGASNREDMDRB1_0301 1
VIR027934339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]425ILRPGRLDVDRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3
VIR027935339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]426LRPGRLDVKDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5
VIR027942339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]433VKIKIERPDDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 7
VIR027944339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]435IKIERPDAEDRB1_0421 1
VIR027957339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]448IYSKYLTEFDRB1_0813 1
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VIR027968339632148 YP 004723790.1 ATPase[MycobacteriumafricanumGM041182]459VHADDLAEFDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
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