Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
SEC147274121639788 YP 980012.1 hypothetic371FRQVTSVTDDRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1321 9
SEC147292121639788 YP 980012.1 hypothetic389IARKLAGWSDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4
SEC147299121639788 YP 980012.1 hypothetic396WSITGTILDDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1321 6
SEC147305121639788 YP 980012.1 hypothetic402ILDKTSRVQDRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 7
SEC147312121639788 YP 980012.1 hypothetic409VQKKVATDWDRB1_0813 1
SEC147320121639788 YP 980012.1 hypothetic417WHQLVGAQSDRB1_0101, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307 6
SEC147323121639788 YP 980012.1 hypothetic420LVGAQSVEEDRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0806, DRB1_1304 5
SEC147337121639788 YP 980012.1 hypothetic434WRMYTDTDRDRB1_0408, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 7
SEC147348121639788 YP 980012.1 hypothetic445LKIPFGHELDRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 7
SEC147356121639788 YP 980012.1 hypothetic453LKTGNVMYLDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 10
SEC147361121639788 YP 980012.1 hypothetic458VMYLDIKEGDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 19
SEC147362121639788 YP 980012.1 hypothetic459MYLDIKEGADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
SEC147379121639788 YP 980012.1 hypothetic476MLIGTTGSGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
SEC147380121639788 YP 980012.1 hypothetic477LIGTTGSGKDRB5_0101, DRB5_0105 2
SEC147391121639788 YP 980012.1 hypothetic488FLRTLILSLDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 13
SEC147392121639788 YP 980012.1 hypothetic489LRTLILSLVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 7
SEC147395121639788 YP 980012.1 hypothetic492LILSLVAMTDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
SEC147396121639788 YP 980012.1 hypothetic493ILSLVAMTHDRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 24
SEC147399121639788 YP 980012.1 hypothetic496LVAMTHPDQDRB1_0305, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 23
SEC147408121639788 YP 980012.1 hypothetic505VNLLLTDFKDRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 6
SEC147411121639788 YP 980012.1 hypothetic508LLTDFKGGSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
SEC147415121639788 YP 980012.1 hypothetic512FKGGSTFLGDRB1_0305, DRB1_0309 2
SEC147421121639788 YP 980012.1 hypothetic518FLGMEKLPHDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 30
SEC147433121639788 YP 980012.1 hypothetic530VVTNMAEEADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 9
SEC147461121639788 YP 980012.1 hypothetic558ILRQAGMKVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4
SEC147478121639788 YP 980012.1 hypothetic575VAEYEKYREDRB1_0806 1
SEC147491121639788 YP 980012.1 hypothetic588LPPLPTLFVDRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311 12
SEC147498121639788 YP 980012.1 hypothetic595FVVVDEFAEDRB1_0801, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 4
SEC147499121639788 YP 980012.1 hypothetic596VVVDEFAELDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
SEC147515121639788 YP 980012.1 hypothetic612IGLFDRICRDRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 19
SEC147524121639788 YP 980012.1 hypothetic621VGRSLRVHLDRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 4
SEC147528121639788 YP 980012.1 hypothetic625LRVHLLLATDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 26
SEC147530121639788 YP 980012.1 hypothetic627VHLLLATQSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 26
SEC147532121639788 YP 980012.1 hypothetic629LLLATQSLQDRB1_1107 1
SEC147533121639788 YP 980012.1 hypothetic630LLATQSLQTDRB1_0701, DRB1_0703 2
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SEC147544121639788 YP 980012.1 hypothetic641VRIDKLEPNDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
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SEC147553121639788 YP 980012.1 hypothetic650LTYRIALRTDRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 3
SEC147555121639788 YP 980012.1 hypothetic652YRIALRTTSDRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 43
SEC147557121639788 YP 980012.1 hypothetic654IALRTTSSHDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 7
SEC147559121639788 YP 980012.1 hypothetic656LRTTSSHESDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 16
SEC147579121639788 YP 980012.1 hypothetic676ITNKESGVGDRB1_0806 1
SEC147586121639788 YP 980012.1 hypothetic683VGFLRVGMEDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 7
SEC147591121639788 YP 980012.1 hypothetic688VGMEDPVKFDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421 4
SEC147602121639788 YP 980012.1 hypothetic699FYISGPYMPDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 8
SEC147635121639788 YP 980012.1 hypothetic732IHRFTAAPVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 9
SEC147638121639788 YP 980012.1 hypothetic735FTAAPVLEEDRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 6
SEC147642121639787 YP 980011.1 hypothetic1MGLRLTTKVDRB1_0402, DRB1_0813 2
SEC147644121639787 YP 980011.1 hypothetic3LRLTTKVQVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 32
SEC147650121639787 YP 980011.1 hypothetic9VQVSGWRFLDRB1_0701, DRB1_0703 2
SEC147655121639787 YP 980011.1 hypothetic14WRFLLRRLEDRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 29
SEC147657121639787 YP 980011.1 hypothetic16FLLRRLEHADRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1323 6
SEC147659121639787 YP 980011.1 hypothetic18LRRLEHAIVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 34
SEC147662121639787 YP 980011.1 hypothetic21LEHAIVRRDDRB1_1304 1
SEC147666121639787 YP 980011.1 hypothetic25IVRRDTRMFDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20
SEC147667121639787 YP 980011.1 hypothetic26VRRDTRMFDDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 15
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SEC150607224992032 YP 002646721.1 hypothe264LAHADSLASDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 10
SEC150613224992032 YP 002646721.1 hypothe270LASSASLPADRB1_0401, DRB1_0426 2
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SEC151156224992287 YP 002646977.1 hypothe430LRHNVIGTPDRB1_0301, DRB1_1107 2
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SEC151169224992287 YP 002646977.1 hypothe443LPIRRVSPPDRB1_0804, DRB1_0813 2
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SEC151208224992283 YP 002646973.1 hypothe29LGIDIPPSGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
SEC151212224992283 YP 002646973.1 hypothe33IPPSGVQKIDRB1_0701, DRB1_0703 2
SEC151217224992283 YP 002646973.1 hypothe38VQKILPYVMDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 11
SEC151220224992283 YP 002646973.1 hypothe41ILPYVMGGADRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1501, DRB1_1506 4
SEC151223224992283 YP 002646973.1 hypothe44YVMGGAMLGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 29
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SEC151911224992283 YP 002646973.1 hypothe732IHRFTAAPVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 9
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SEC151918224992282 YP 002646972.1 hypothe1MGLRLTTKVDRB1_0402, DRB1_0813 2
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SEC151933224992282 YP 002646972.1 hypothe16FLLRRLEHADRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1323 6
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