Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
SEC125500148663479 YP 001285002.1 hypothe340VGMGGMHPSDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4
SEC125502148663479 YP 001285002.1 hypothe342MGGMHPSSGDRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 4
SEC125536148663479 YP 001285002.1 hypothe376VEADAGGGQDRB1_1107 1
SEC125544148663749 YP 001285272.1 hypothe1MRNPLGLRFDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5
SEC125548148663749 YP 001285272.1 hypothe5LGLRFSTGHDRB1_0402, DRB1_0806, DRB1_0813 3
SEC125550148663749 YP 001285272.1 hypothe7LRFSTGHALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 9
SEC125569148663749 YP 001285272.1 hypothe26IAFLETRYWDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 8
SEC125576148663749 YP 001285272.1 hypothe33YWWAGIALADRB1_1307 1
SEC125583148663749 YP 001285272.1 hypothe40LASLGVIVADRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 10
SEC125586148663749 YP 001285272.1 hypothe43LGVIVATVTDRB1_0101, DRB1_0102 2
SEC125588148663749 YP 001285272.1 hypothe45VIVATVTFYDRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 5
SEC125589148663749 YP 001285272.1 hypothe46IVATVTFYGDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 14
SEC125593148663749 YP 001285272.1 hypothe50VTFYGRRITDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 13
SEC125595148663749 YP 001285272.1 hypothe52FYGRRITGWDRB1_0813 1
SEC125596148663749 YP 001285272.1 hypothe53YGRRITGWVDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6
SEC125603148663749 YP 001285272.1 hypothe60WVAAVYAWLDRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 5
SEC125604148663749 YP 001285272.1 hypothe61VAAVYAWLRDRB5_0101, DRB5_0105 2
SEC125607148663749 YP 001285272.1 hypothe64VYAWLRRRRDRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11
SEC125608148663749 YP 001285272.1 hypothe65YAWLRRRRRDRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 8
SEC125610148663749 YP 001285272.1 hypothe67WLRRRRRPPDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 16
SEC125611148663749 YP 001285272.1 hypothe68LRRRRRPPDDRB1_0301, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 15
SEC125625148663749 YP 001285272.1 hypothe82VVGATVKPGDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 29
SEC125644148663749 YP 001285272.1 hypothe101FLVAVIELIDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703 4
SEC125646148663749 YP 001285272.1 hypothe103VAVIELIPRDRB5_0101, DRB5_0105 2
SEC125648148663749 YP 001285272.1 hypothe105VIELIPRPFDRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3
SEC125649148663749 YP 001285272.1 hypothe106IELIPRPFTDRB1_1107 1
SEC125660148663749 YP 001285272.1 hypothe117VIVDGQAHTDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6
SEC125680148663749 YP 001285272.1 hypothe137LLSVHCPDLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4
SEC125688148663749 YP 001285272.1 hypothe145LEADIVSAGDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
SEC125697148663749 YP 001285272.1 hypothe154YRVGNTAAPDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0802 6
SEC125707148663749 YP 001285272.1 hypothe164VVSLYQQVIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 8
SEC125715148663749 YP 001285272.1 hypothe172IGTDPAPANDRB1_1107 1
SEC125727148663749 YP 001285272.1 hypothe184WIVLRADPEDRB1_0405 1
SEC125729148663749 YP 001285272.1 hypothe186VLRADPERTDRB1_0102 1
SEC125751148663749 YP 001285272.1 hypothe208LARYLVASADRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 11
SEC125754148663749 YP 001285272.1 hypothe211YLVASATRIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 7
SEC125755148663749 YP 001285272.1 hypothe212LVASATRIADRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25
SEC125790148663749 YP 001285272.1 hypothe247FVREKWSMIDRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 6
SEC125791148663749 YP 001285272.1 hypothe248VREKWSMIKDRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813 4
SEC125795148663749 YP 001285272.1 hypothe252WSMIKGRDADRB1_0101, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 4
SEC125798148663749 YP 001285272.1 hypothe255IKGRDAYTADRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 5
SEC125826148663749 YP 001285272.1 hypothe283ITRVRVAPGDRB1_0806 1
SEC125829148663749 YP 001285272.1 hypothe286VRVAPGMAPDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 7
SEC125831148663749 YP 001285272.1 hypothe288VAPGMAPQSDRB1_1107 1
SEC125855148663749 YP 001285272.1 hypothe312FARLFGGQRDRB5_0101, DRB5_0105 2
SEC125858148663749 YP 001285272.1 hypothe315LFGGQRPALDRB1_0301, DRB1_1107 2
SEC125859148663749 YP 001285272.1 hypothe316FGGQRPALQDRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 9
SEC125866148663749 YP 001285272.1 hypothe323LQGQHLVANDRB1_1304 1
SEC125881148663749 YP 001285272.1 hypothe338IGSAGVLVGDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 11
SEC125886148663749 YP 001285272.1 hypothe343VLVGETVNRDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0402 3
SEC125887148663749 YP 001285272.1 hypothe344LVGETVNRCDRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 19
SEC125892148663749 YP 001285272.1 hypothe349VNRCPVYMPDRB1_0402 1
SEC125898148663749 YP 001285272.1 hypothe355YMPFDDVDIDRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 6
SEC125899148663749 YP 001285272.1 hypothe356MPFDDVDIADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 7
SEC125904148663749 YP 001285272.1 hypothe361VDIALNLGDDRB1_0410 1
SEC125908148663749 YP 001285272.1 hypothe365LNLGDAQTFDRB1_0102, DRB1_0301 2
SEC125910148663749 YP 001285272.1 hypothe367LGDAQTFTQDRB1_0402 1
SEC125916148663749 YP 001285272.1 hypothe373FTQFVVRAADRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323 11
SEC125919148663749 YP 001285272.1 hypothe376FVVRAAAAGDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 14
SEC125920148663749 YP 001285272.1 hypothe377VVRAAAAGADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 33
SEC125921148663749 YP 001285272.1 hypothe378VRAAAAGAMDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0806, DRB5_0101, DRB5_0105 7
SEC125929148663749 YP 001285272.1 hypothe386MVTVGPQFEDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 8
SEC125936148663749 YP 001285272.1 hypothe393FEEFARLIGDRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1502 3
SEC125939148663749 YP 001285272.1 hypothe396FARLIGAHIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1307 3
SEC125942148663749 YP 001285272.1 hypothe399LIGAHIGQEDRB1_0801, DRB1_0806 2
SEC125951148663749 YP 001285272.1 hypothe408VKVAWPNATDRB1_0101, DRB1_0102 2
SEC125955148663749 YP 001285272.1 hypothe412WPNATTYLGDRB1_0405 1
SEC125971148663749 YP 001285272.1 hypothe428VILRHNVIGDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806 4
SEC125972148663749 YP 001285272.1 hypothe429ILRHNVIGTDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 16
SEC125973148663749 YP 001285272.1 hypothe430LRHNVIGTPDRB1_0301, DRB1_1107 2
SEC125977148663749 YP 001285272.1 hypothe434VIGTPRHRQDRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322 7
SEC125986148663749 YP 001285272.1 hypothe443LPIRRVSPPDRB1_0804, DRB1_0813 2
SEC125988148663749 YP 001285272.1 hypothe445IRRVSPPEEDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 16
SEC126003148663738 YP 001285261.1 hypothe7VRTLREVVLDRB1_0101, DRB1_0102 2
SEC126009148663738 YP 001285261.1 hypothe13VVLDQLGTADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1107 9
SEC126011148663738 YP 001285261.1 hypothe15LDQLGTAESDRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 3
SEC126014148663738 YP 001285261.1 hypothe18LGTAESRAYDRB1_0402 1
SEC126022148663738 YP 001285261.1 hypothe26YKMWLPPLTDRB1_0101, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 9
SEC126025148663738 YP 001285261.1 hypothe29WLPPLTNPVDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421 4
SEC126035148663738 YP 001285261.1 hypothe39LNELIARDRDRB5_0101, DRB5_0105 2
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