Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR964137395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]258LASFAVITA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.20
VIR964140395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]261FAVITAIAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.26
VIR964146395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]267IAVIAAAAA DRB1_0102 1 0.22
VIR964222395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]343WQAIIASVP DRB1_0101, DRB1_0408 2 0.28
VIR964225395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]346IIASVPASA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.47
VIR964265395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]386VVVRGHFFV DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 20 0.35
VIR964266395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]387VVRGHFFVH DRB1_1107 1 0.29
VIR964267395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]388VRGHFFVHS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 16 0.99
VIR964271395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]392FFVHSLVVA DRB1_0305, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323 8 0.27
VIR964272395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]393FVHSLVVAG DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 25 0.27
VIR964277395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]398VVAGLITTV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.20
VIR964278395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]399VAGLITTVC DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 7 0.25
VIR964281395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]402LITTVCGFR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.26
VIR964285395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]406VCGFRSRLY DRB1_0402 1 0.26
VIR964293395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]414YAERWCAWA DRB1_0802 1 0.27
VIR964297395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]418WCAWALLAA DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323 3 0.27
VIR964300395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]421WALLAATVA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0813 7 0.27
VIR964313395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]434LTAKLIIWY DRB1_0817 1 0.27
VIR964317395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]438LIIWYPHYA DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28 0.28
VIR964320395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]441WYPHYAWLL DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502 9 0.28
VIR964321395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]442YPHYAWLLL DRB1_1502, DRB1_1506 2 0.28
VIR964329395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]450LSVYLTVAL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.22
VIR964337395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]458LVALVVVGS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 44 0.28
VIR964338395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]459VALVVVGSM DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307 7 0.21
VIR964349395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]470VRRVSPVVK DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.41
VIR964355395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]476VVKRTLELI DRB1_0804, DRB1_0813 2 0.46
VIR964360395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]481LELIDGAMI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.28
VIR964368395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]489IAAIIPMLL DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.23
VIR964374395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]495MLLWITGVY DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0806 3 0.25
VIR964376395140747 AFN51906.1 ESX-1secretionsystemproteineccD1[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]497LWITGVYDT DRB1_0703 1 0.24
VIR964383395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]1MHRIFLITV DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.27
VIR964396395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]14LTASPASAI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.32
VIR964452395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]70LGVADAHKF DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.39
VIR964468395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]86VAVIDTGVD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.30
VIR964489395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]107FVDQAGNGL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.29
VIR964521395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]139FVGVAPDAR DRB1_0309, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.32
VIR964540395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]158FEPVGSQAN DRB1_0405 1 0.30
VIR964561395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]179IRSLARAVV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 36 0.34
VIR964564395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]182LARAVVHAA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4 0.22
VIR964576395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]194VGVINISEA DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1107 4 0.50
VIR964579395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]197INISEAACY DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0421 3 0.31
VIR964587395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]205YKVSRPIDE DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1321 6 0.41
VIR964604395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]222YAVNVKGVV DRB1_0309, DRB1_1307 2 0.35
VIR964606395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]224VNVKGVVVV DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 18 0.36
VIR964608395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]226VKGVVVVVA DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 17 0.32
VIR964641395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]259WNNVQTVVT DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.23
VIR964672395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]290FSMHGPWVD DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1323 5 0.26
VIR964678395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]296WVDVAAPAE DRB1_1321 1 0.57
VIR964708395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]326VPIAGTSFA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 8 0.43
VIR964739395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]357IIHRITATA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 12 0.38
VIR964740395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]358IHRITATAR DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.34
VIR964757395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]375LVGAGVIDA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 42 0.28
VIR964769395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]387LTWDIPPGP DRB1_0301, DRB1_1107 2 0.28
VIR964817395140753 AFN51912.1 typeVIIsecretion-associatedserineproteasemycosin[MycobacteriumtuberculosisH37Rv]435LGALARRAL DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.25
VIR964863253797045 YP 003030046.1 trehalosesynthasetreS[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]43WFKHAVFYE DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 9 0.99
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