Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR849318148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]203MQALPAGGA DRB1_0102, DRB1_1307 2 0.28
VIR849350148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]235INAPESVVI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.40
VIR849356148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]241VVISGAQAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 32 0.60
VIR849372148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]257FAAQGRRVH DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 8 0.23
VIR849400148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]285FARVAARVQ DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR849403148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]288VAARVQARE DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.27
VIR849434148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]319YWVDHVRRP DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.31
VIR849435148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]320WVDHVRRPV DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.31
VIR849443148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]328VRFADSARH DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 37 0.47
VIR849452148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]337LQTLGATHF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.35
VIR849487148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]372MLGKDRPEL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5 0.20
VIR849512148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]397VQWSAVFAG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.35
VIR849531148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]416YAFQRRRFW DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 4 0.21
VIR849575148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]460VVLTGRLSL DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 37 0.33
VIR849588148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]473WLADHVVNG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.28
VIR849605148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]490FVELVIRAG DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.28
VIR849606148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]491VELVIRAGD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.30
VIR849608148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]493LVIRAGDEV DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.29
VIR849620148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]505LIEELVLAA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.29
VIR849624148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]509LVLAAPLVM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 51 0.28
VIR849632148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]517MHPGVGVQV DRB1_0102 1 0.36
VIR849638148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]523VQVQVVVGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 27 0.29
VIR849642148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]527VVVGAADES DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.45
VIR849655148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]540VSVYSRGDQ DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5 0.23
VIR849657148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]542VYSRGDQSQ DRB1_0402 1 0.21
VIR849674148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]559MLGVAAAET DRB1_0102 1 0.25
VIR849717148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]602FQGLVAIWR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.28
VIR849720148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]605LVAIWRRGS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 35 0.28
VIR849721148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]606VAIWRRGSE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 4 0.28
VIR849724148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]609WRRGSELFA DRB1_0305, DRB1_1101, DRB1_1502 3 0.99
VIR849730148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]615LFAEVVAPG DRB1_0421 1 0.22
VIR849747148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]632MGMHPAVLD DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.25
VIR849778148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]663FCWRGVSLH DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 5 0.20
VIR849780148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]665WRGVSLHAG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.32
VIR849793148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]678VRARFASAG DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 6 0.51
VIR849824148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]709VTRPITAEQ DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423 4 0.54
VIR849849148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]734LEVVWSPIS DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.33
VIR849851148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]736VVWSPISVV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 10 0.39
VIR849853148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]738WSPISVVSG DRB1_0405 1 0.45
VIR849887148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]772VVVWELESA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 6 0.38
VIR849890148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]775WELESAGGQ DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.31
VIR849907148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]792YAATHTALE DRB1_0405, DRB1_0421 2 0.25
VIR849929148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]814LVVLTHGGV DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311 9 0.23
VIR849947148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]832LAAAAVWGM DRB1_0402, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.29
VIR849952148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]837VWGMARSAQ DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 3 0.29
VIR849953148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]838WGMARSAQA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 16 0.29
VIR849967148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]852IVLIDTDAA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322 27 0.23
VIR849989148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]874LLVRGGTVH DRB1_0813 1 0.27
VIR849990148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]875LVRGGTVHA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1322 19 0.27
VIR849991148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]876VRGGTVHAP DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402 6 0.24
VIR850017148662793 YP 001284316.1 polyketidesynthasePks1[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]902WRLAAGGGG DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.27
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VIR854032148663099 YP 001284622.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]361VMAIVGPIL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.26
VIR854033148663099 YP 001284622.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]362MAIVGPILA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.36
VIR854036148663099 YP 001284622.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumtuberculosisH37Ra]365VGPILARYT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.29
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