Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR322923340628506 YP 004746958.1 hypotheticalproteinMCAN 35531[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]261FVIALVELE DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 29 0.28
VIR322924340628506 YP 004746958.1 hypotheticalproteinMCAN 35531[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]262VIALVELEE DRB1_1321 1 0.27
VIR322928340628506 YP 004746958.1 hypotheticalproteinMCAN 35531[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]266VELEEGVRM DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.47
VIR322934340628506 YP 004746958.1 hypotheticalproteinMCAN 35531[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]272VRMLGELRG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 26 0.26
VIR322940340628506 YP 004746958.1 hypotheticalproteinMCAN 35531[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]278LRGADPARV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 27 0.29
VIR322952340628506 YP 004746958.1 hypotheticalproteinMCAN 35531[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]290MPVRATYID DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0806 3 0.27
VIR322966340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1MDFDPTAEQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 8 0.31
VIR322984340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]19VLERDISWE DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.31
VIR322985340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]20LERDISWEA DRB1_1107 1 0.32
VIR322991340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]26WEALVCGGV DRB1_0101 1 0.26
VIR322994340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]29LVCGGVTAL DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 11 0.24
VIR323040340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]75LGVVPLLEL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 8 0.32
VIR323042340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]77VVPLLELAS DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28 0.32
VIR323043340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]78VPLLELASA DRB1_1307 1 0.32
VIR323045340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]80LLELASAEQ DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.36
VIR323086340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]121FVGGRLSGT DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.30
VIR323106340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]141WMLVTADNA DRB1_0408 1 0.24
VIR323157340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]192VAAHRVNQL DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.68
VIR323188340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]223YVANRKQFG DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 14 0.30
VIR323199340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]234LSTFQTVAA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 4 0.23
VIR323212340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]247VYIASRTID DRB1_1304 1 0.36
VIR323213340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]248YIASRTIDL DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.41
VIR323221340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]256LVAKSVIWR DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.28
VIR323222340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]257VAKSVIWRL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR323242340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]277VLGYWVTSQ DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 18 0.35
VIR323243340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]278LGYWVTSQA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 9 0.39
VIR323255340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]290MQICHHLHG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 25 0.28
VIR323261340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]296LHGGMGMDV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.24
VIR323265340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]300MGMDVTYPM DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 16 0.28
VIR323273340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]308MHRYYSTIK DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.99
VIR323294340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]329LELLGARCS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 24 0.28
VIR323296340628508 YP 004746960.1 putativeacyl-CoAdehydrogenaseFADE28[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]331LLGARCSLT DRB1_0102 1 0.29
VIR323297340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1MSIRSLGYL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.29
VIR323299340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]3IRSLGYLRI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.28
VIR323304340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]8YLRIEATDM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0813, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.28
VIR323305340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]9LRIEATDMA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1322 17 0.28
VIR323315340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]19WREYGLKVL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1502 4 0.24
VIR323337340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]41YLRMDDFPA DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.28
VIR323338340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]42LRMDDFPAR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.28
VIR323362340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]66WECANAEGL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
VIR323373340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]77IRNRLDLEG DRB1_0402, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 5 0.37
VIR323384340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]88YKEATAAEL DRB1_0101 1 0.25
VIR323400340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]104MIRFADPSG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.32
VIR323401340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]105IRFADPSGN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1304 11 0.45
VIR323411340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]115LEVFHGTAL DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.22
VIR323413340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]117VFHGTALEH DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.23
VIR323428340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]132YGHRFVTGE DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817 3 0.32
VIR323432340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]136FVTGEQGMG DRB1_0309 1 0.30
VIR323453340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]157LHFYRDVLG DRB1_1506 1 0.29
VIR323455340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]159FYRDVLGFR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.31
VIR323456340628534 YP 004746986.1 putativebiphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]160YRDVLGFRL DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.30
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