Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR313341340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]94WKRVAVLFA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 36 0.28
VIR313346340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]99VLFAGPGMN DRB1_0806 1 0.42
VIR313347340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]100LFAGPGMNL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.45
VIR313357340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]110ICLVLIYAI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.24
VIR313359340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]112LVLIYAIAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 37 0.20
VIR313361340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]114LIYAIALVW DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1321 7 0.23
VIR313363340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]116YAIALVWGL DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.28
VIR313367340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]120LVWGLPNLH DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 7 0.28
VIR313411340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]164IRSGDVVVK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 9 0.49
VIR313418340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]171VKVGDTPVS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 9 0.44
VIR313446340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]199VERDGTAIV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.26
VIR313453340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]206IVTYVDIES DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.31
VIR313456340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]209YVDIESTQR DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.31
VIR313457340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]210VDIESTQRW DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.28
VIR313465340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]218WIPNGQGGE DRB1_0801 1 0.26
VIR313474340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]227LQPATVGAI DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 9 0.58
VIR313479340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]232VGAIGVGAA DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 6 0.27
VIR313494340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]247YGVFSAMPA DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 17 0.26
VIR313496340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]249VFSAMPATV DRB1_0102 1 0.21
VIR313497340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]250FSAMPATVA DRB1_0101, DRB1_0408 2 0.20
VIR313525340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]278VGALVRAIG DRB1_0806, DRB1_1307 2 0.23
VIR313528340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]281LVRAIGGGQ DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR313532340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]285IGGGQRDPQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.23
VIR313560340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]313LWVAFWFFL DRB1_0703 1 0.25
VIR313593340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]346VAVFERIRN DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.30
VIR313595340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]348VFERIRNMV DRB1_0813 1 0.28
VIR313596340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]349FERIRNMVR DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.28
VIR313599340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]352IRNMVRSAR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 35 0.30
VIR313602340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]355MVRSARGKV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 17 0.38
VIR313603340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]356VRSARGKVA DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.47
VIR313630340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]383LVVGYMLLT DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.26
VIR313631340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]384VVGYMLLTV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 26 0.29
VIR313634340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]387YMLLTVTAD DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1321 18 0.30
VIR313643340627862 YP 004746314.1 hypotheticalproteinMCAN 28911[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]396LVNPIRLFQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506 28 0.29
VIR313673340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]30YGSDPKGFA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.28
VIR313689340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]46VYSRACIIA DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.29
VIR313690340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]47YSRACIIAE DRB1_0817, DRB1_1321 2 0.29
VIR313700340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]57LKLCGLPGD DRB1_1304, DRB1_1321 2 0.26
VIR313705340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]62LPGDRVAVL DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.46
VIR313718340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]75LEYVLAFLG DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.39
VIR313742340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]99YGIHDDRVS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323 9 0.28
VIR313744340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]101IHDDRVSAV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.28
VIR313767340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]124VVGDVTKYA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 14 0.37
VIR313785340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]142VVIEVDLLD DRB1_0401, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.29
VIR313786340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]143VIEVDLLDL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.29
VIR313812340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]169YLQYTSGST DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1502 3 0.36
VIR313813340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]170LQYTSGSTR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.37
VIR313826340627921 YP 004746373.1 fatty-acid-CoAligaseFADD26[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]183VIVSHTNVI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 19 0.28
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VIR321999340628392 YP 004746844.1 putativealternativeRNApolymerasesigma-DfactorSIGD[MycobacteriumcanettiiCIPT1400100513FVTLEISPS DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 37 0.27
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VIR322008340628392 YP 004746844.1 putativealternativeRNApolymerasesigma-DfactorSIGD[MycobacteriumcanettiiCIPT1400100522MTMQGERLD DRB1_1304 1 0.28
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