Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR303276340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]341WELTKSPAG DRB1_0421 1 0.35
VIR303286340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]351WQYTAKDGA DRB1_0305 1 0.28
VIR303313340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]378LATDLSLRV DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0421 5 0.29
VIR303319340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]384LRVDPIYER DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.28
VIR303324340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]389IYERITRRW DRB1_0402 1 0.29
VIR303325340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]390YERITRRWL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.27
VIR303347340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]412WYKLIHRDM DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 9 0.29
VIR303348340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]413YKLIHRDMG DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1307 3 0.29
VIR303351340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]416IHRDMGPVA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
VIR303358340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]423VARYLGPLV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.28
VIR303361340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]426YLGPLVPKQ DRB1_0305, DRB1_1101 2 0.27
VIR303362340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]427LGPLVPKQT DRB1_0102 1 0.28
VIR303365340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]430LVPKQTLLW DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 29 0.25
VIR303371340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]436LLWQDPVPA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 5 0.28
VIR303372340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]437LWQDPVPAV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.28
VIR303380340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]445VSHDLVGEA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.22
VIR303390340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]455IASLKSQIL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.33
VIR303418340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]483FRGSDKRGG DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.22
VIR303432340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]497IRLQPQVGW DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 8 0.32
VIR303434340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]499LQPQVGWEV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.30
VIR303449340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]514LRKVIRTLE DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 3 0.30
VIR303453340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]518IRTLEEIQE DRB1_1321 1 0.39
VIR303475340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]540FADLVVLGG DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 4 0.22
VIR303478340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]543LVVLGGCAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506 19 0.27
VIR303479340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]544VVLGGCAAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 16 0.27
VIR303481340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]546LGGCAAIEK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR303516340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]581VESFAVLEP DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1506 5 0.38
VIR303519340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]584FAVLEPKAD DRB1_0801, DRB1_1321 2 0.40
VIR303529340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]594FRNYLGKGN DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.28
VIR303533340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]598LGKGNPLPA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.22
VIR303543340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]608YMLLDKANL DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 30 0.29
VIR303544340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]609MLLDKANLL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 13 0.26
VIR303563340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]628VGGLRVLGA DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 34 0.31
VIR303566340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]631LRVLGANYK DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 33 0.34
VIR303569340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]634LGANYKRLP DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.21
VIR303580340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]645VFTEASESL DRB1_0401, DRB1_0421 2 0.27
VIR303593340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]658FVNLLDMGI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 21 0.28
VIR303596340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]661LLDMGITWE DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.28
VIR303631340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]696LVFGSNSEL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.26
VIR303632340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]697VFGSNSELR DRB1_0421 1 0.24
VIR303655340626917 YP 004745369.1 catalase-peroxidase-peroxynitritaseTKATG[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]720FVQDFVAAW DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1107, DRB1_1307 14 0.28
VIR303668340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1MVIVGFPGD DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3 0.26
VIR303670340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]3IVGFPGDPV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.32
VIR303673340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]6FPGDPVDTV DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.33
VIR303698340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]31LIDWVKAVS DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.28
VIR303701340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]34WVKAVSGTA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1307 8 0.42
VIR303702340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]35VKAVSGTAR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.41
VIR303737340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]70LGLCRTFRP DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.29
VIR303743340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]76FRPRISGRS DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 17 0.48
VIR303871340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]204YVERIRTEA DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 4 0.53
VIR303872340626941 YP 004745393.1 putativetranscriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]205VERIRTEAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 12 0.52
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VIR311858340627394 YP 004745846.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1218FVVQYPQRA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.99
VIR311859340627394 YP 004745846.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1219VVQYPQRAD DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.99
VIR311899340627394 YP 004745846.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1259FGHCMGAIV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR311903340627394 YP 004745846.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1263MGAIVAFEF DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.32
VIR311906340627394 YP 004745846.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumcanettiiCIPT140010059]1266IVAFEFARL DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.30
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