Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR196503121636908 YP 977131.1 twocomponentresponsetranscriptionalregulatoryproteinMprA[MycobacteriumbovisBCGstr.Pas218VRGVGYVLRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR196511121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]4LARVVGLVQDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1321 5
VIR196514121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]7VVGLVQEEQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322 13
VIR196578121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]71LGGTRPGLIDRB1_0703 1
VIR196585121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]78LIPGVIPTMDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
VIR196599121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]92MVRQRPRAGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 16
VIR196600121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]93VRQRPRAGMDRB1_0301, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28
VIR196608121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]101MLAIGAVTIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 5
VIR196609121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]102LAIGAVTIADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 8
VIR196614121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]107VTIAVVSAGDRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 5
VIR196618121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]111VVSAGIGGADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 11
VIR196623121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]116IGGAAASLVDRB1_0102 1
VIR196630121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]123LVGFNRAPADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33
VIR196633121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]126FNRAPAGPSDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 9
VIR196666121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]159VAAKVVPSVDRB1_0804 1
VIR196670121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]163VVPSVVMLEDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 29
VIR196674121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]167VVMLETDLGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 29
VIR196675121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]168VMLETDLGRDRB1_0421 1
VIR196692121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]185ILSAEGLILDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR196698121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]191LILTNNHVIDRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 13
VIR196700121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]193LTNNHVIAADRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 5
VIR196735121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]228VVGADPTSDDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1304 3
VIR196736121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]229VGADPTSDIDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR196746121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]239VVRVQGVSGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR196747121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]240VRVQGVSGLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 32
VIR196752121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]245VSGLTPISLDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR196755121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]248LTPISLGSSDRB1_1307 1
VIR196766121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]259LRVGQPVLADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 11
VIR196773121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]266LAIGSPLGLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 10
VIR196779121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]272LGLEGTVTTDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR196781121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]274LEGTVTTGIDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703 4
VIR196789121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]282IVSALNRPVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 13
VIR196790121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]283VSALNRPVSDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 5
VIR196813121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]306IQTDAAINPDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR196828121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]321LVNMNAQLVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 33
VIR196829121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]322VNMNAQLVGDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 11
VIR196835121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]328LVGVNSAIADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1506 22
VIR196836121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]329VGVNSAIATDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR196845121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]338LGADSADAQDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6
VIR196857121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]350IGLGFAIPVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4
VIR196859121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]352LGFAIPVDQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 11
VIR196875121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]368LISTGKASHDRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 9
VIR196886121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]379LGVQVTNDKDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 15
VIR196919121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]412VVVTKVDDRDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR196929121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]422INSADALVADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 7
VIR196935121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]428LVAAVRSKADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 15
VIR196939121636910 YP 977133.1 serineprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]432VRSKAPGATDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5
VIR196969121636917 YP 977140.1 hypotheticalproteinBCG 1045c[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]6LNPSLVSRIDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 10
VIR196973121636917 YP 977140.1 hypotheticalproteinBCG 1045c[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]10LVSRISAFLDRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 11
VIR196974121636917 YP 977140.1 hypotheticalproteinBCG 1045c[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]11VSRISAFLRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR196981121636917 YP 977140.1 hypotheticalproteinBCG 1045c[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]18LRPDWTRTVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 24
VIR196989121636917 YP 977140.1 hypotheticalproteinBCG 1045c[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]26VRARRFAAADRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 6
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