Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
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VIR190269121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]219YRSIITVVLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 31
VIR190272121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]222IITVVLLLIDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 10
VIR190275121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]225VVLLLITVGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 38
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VIR190277121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]227LLLITVGVEDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 15
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VIR190292121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]242VVAVLGHSGDRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3
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VIR190307121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]257FAVSLLTSLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR190309121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]259VSLLTSLAIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 21
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VIR190432121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]382VRWPLPVLVDRB1_0102 1
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VIR190439121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]389LVATCAIALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR190445121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]395IALVGLLALDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 8
VIR190447121636364 YP 976587.1 transmembranetransportproteinmmpL4[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]397LVGLLALPGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 35
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