Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR183206378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]319VIAASAATVDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR183218378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]331FLGMVFTQLDRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 7
VIR183219378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]332LGMVFTQLGDRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 10
VIR183221378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]334MVFTQLGILDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR183222378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]335VFTQLGILKDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR183223378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]336FTQLGILKTDRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 4
VIR183226378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]339LGILKTVGPDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 20
VIR183228378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]341ILKTVGPMLDRB1_0703 1
VIR183229378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]342LKTVGPMLGDRB1_0301, DRB1_0410, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 9
VIR183232378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]345VGPMLGISVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4
VIR183235378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]348MLGISVAVVDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311 20
VIR183236378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]349LGISVAVVFDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703 7
VIR183238378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]351ISVAVVFFADRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3
VIR183242378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]355VVFFAAVTLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 26
VIR183243378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]356VFFAAVTLLDRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 6
VIR183244378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]357FFAAVTLLPDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 9
VIR183245378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]358FAAVTLLPADRB1_1101 1
VIR183248378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]361VTLLPALMVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 11
VIR183251378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]364LPALMVLTGDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 7
VIR183254378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]367LMVLTGRRGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR183255378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]368MVLTGRRGWDRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17
VIR183256378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]369VLTGRRGWIDRB1_0301, DRB1_1107 2
VIR183270378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]383LTRRFWRSSDRB1_0402, DRB1_0804 2
VIR183274378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]387FWRSSGVHIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4
VIR183275378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]388WRSSGVHIVDRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 26
VIR183280378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]393VHIVRRPKTDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 12
VIR183282378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]395IVRRPKTHLDRB1_0301, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 20
VIR183283378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]396VRRPKTHLLDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 9
VIR183290378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]403LLASALVLVDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR183291378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]404LASALVLVIDRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311 9
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VIR183296378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]409VLVILAGCADRB1_0102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR183297378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]410LVILAGCAGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 36
VIR183298378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]411VILAGCAGLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR183309378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]422YNYDDRKTLDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311 7
VIR183334378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]447FPSNLIIPEDRB1_1321 1
VIR183338378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]451LIIPEYLFIDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5
VIR183343378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]456YLFIQSSTDDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1321 8
VIR183344378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]457LFIQSSTDLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 13
VIR183345378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]458FIQSSTDLRDRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4
VIR183361378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]474LEQMVQRVSDRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 8
VIR183364378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]477MVQRVSQVPDRB1_0402, DRB1_0804 2
VIR183374378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]487VAMVRGITRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR183376378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]489MVRGITRPADRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 22
VIR183377378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]490VRGITRPAGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 25
VIR183388378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]501LEQARTSWQDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 6
VIR183395378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]508WQAGEVGSKDRB1_0305, DRB1_0309 2
VIR183421378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]534LAGGANLMADRB1_0402 1
VIR183435378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]548VRAQVNRAIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20
VIR183439378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]552VNRAISTVGDRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 4
VIR183455378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]568YLQDLLGGNDRB1_0305, DRB1_0309 2
VIR183456378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]569LQDLLGGNRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR183459378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]572LLGGNRVLGDRB1_0301 1
VIR183460378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]573LGGNRVLGEDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 5
VIR183469378773604 YP 005173337.1 mmpL8geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]582LEGAEKLIGDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 7
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VIR188941121636262 YP 976485.1 transcriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]192WRETVVDNADRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
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VIR188979121636267 YP 976490.1 heatshockproteintranscriptionalregulatorHspR[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]21LAGMHAQTLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4
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VIR188993121636267 YP 976490.1 heatshockproteintranscriptionalregulatorHspR[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]35LGLVSPRRTDRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR189008121636267 YP 976490.1 heatshockproteintranscriptionalregulatorHspR[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]50YSLHDVELLDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 9
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