Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR176443378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]340FIVSAIALLDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1307 5
VIR176444378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]341IVSAIALLIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 42
VIR176448378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]345IALLITGDVDRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1307 3
VIR176451378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]348LITGDVRRADRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4
VIR176452378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]349ITGDVRRAMDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3
VIR176456378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]353VRRAMTMLLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 51
VIR176460378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]357MTMLLIACPDRB1_1307 1
VIR176462378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]359MLLIACPCADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 12
VIR176463378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]360LLIACPCAVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 32
VIR176471378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]368VGLSTPTAIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 10
VIR176491378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]388ILIKGGSHLDRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1506 5
VIR176493378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]390IKGGSHLEQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5
VIR176508378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]405IVFDKTGTLDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR176510378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]407FDKTGTLTVDRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703 3
VIR176522378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]419VVTNIVAMHDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 37
VIR176523378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]420VTNIVAMHKDRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR176526378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]423IVAMHKDWEDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304 3
VIR176529378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]426MHKDWEPEQDRB1_0305, DRB1_1107 2
VIR176533378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]430WEPEQVLAYDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
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VIR176558378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]455IRSTEERRIDRB1_0701, DRB1_0703 2
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VIR176599378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]496LRAEKVRVSDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25
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VIR176617378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]514LRRQAETPLDRB1_0101, DRB1_0102 2
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VIR176633378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]530LVGLISLRDDRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 23
VIR176634378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]531VGLISLRDEDRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 3
VIR176643378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]540VRPEAAQVLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 7
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VIR176651378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]548LTKLRANGIDRB1_0101, DRB1_0102 2
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VIR176659378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]556IRRIVMLTGDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 27
VIR176662378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]559IVMLTGDHPDRB1_0102 1
VIR176665378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]562LTGDHPEIADRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6
VIR176675378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]572VVADELGIDDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
VIR176689378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]586VMPEDKLAADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322 11
VIR176706378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]603YVVGMVGDGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1107, DRB1_1307 7
VIR176707378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]604VVGMVGDGIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR176710378773018 YP 005172751.1 ctpCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]607MVGDGINDADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 13
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