Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR170350378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]9LFSMKTLLTDRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 26
VIR170351378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]10FSMKTLLTLDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 14
VIR170353378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]12MKTLLTLAMDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 41
VIR170357378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]16LTLAMAAASDRB1_0102, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1307 4
VIR170359378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]18LAMAAASSTDRB1_0102 1
VIR170369378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]28LTTVGVSGADRB1_0404, DRB1_0423 2
VIR170372378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]31VGVSGARLIDRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3
VIR170379378772187 YP 005171920.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]38LITYCVGVEDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5
VIR170395378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]14VKRTATKSPDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426 4
VIR170453378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]72IPKRKTRAADRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804 3
VIR170524378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]143LNLDDLEDDDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR170583378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]202FVWDEDESEDRB1_0421 1
VIR170593378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]212LRQARKDAEDRB1_0806, DRB1_1304 2
VIR170609378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]228VRAYLKQIGDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 19
VIR170612378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]231YLKQIGKVADRB1_0101 1
VIR170613378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]232LKQIGKVALDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 5
VIR170616378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]235IGKVALLNADRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4
VIR170619378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]238VALLNAEEEDRB1_0410 1
VIR170628378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]247VELAKRIEADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 11
VIR170643378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]262LMTELSERGDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR170654378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]273LPAAQRRDMDRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3
VIR170677378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]296LEANLRLVVDRB1_1506 1
VIR170681378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]300LRLVVSLAKDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 41
VIR170683378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]302LVVSLAKRYDRB1_0102, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR170684378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]303VVSLAKRYTDRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 24
VIR170687378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]306LAKRYTGRGDRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806 3
VIR170696378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]315MAFLDLIQEDRB1_0817, DRB1_1321 2
VIR170701378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]320LIQEGNLGLDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1501, DRB1_1506 5
VIR170707378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]326LGLIRAVEKDRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR170710378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]329IRAVEKFDYDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 28
VIR170716378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]335FDYTKGYKFDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR170724378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]343FSTYATWWIDRB1_0802, DRB1_1502 2
VIR170727378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]346YATWWIRQADRB1_0402, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 5
VIR170730378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]349WWIRQAITRDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR170731378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]350WIRQAITRADRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 12
VIR170732378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]351IRQAITRAMDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 34
VIR170747378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]366IRIPVHMVEDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 9
VIR170751378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]370VHMVEVINKDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 26
VIR170754378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]373VEVINKLGRDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 14
VIR170756378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]375VINKLGRIQDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 15
VIR170757378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]376INKLGRIQRDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR170760378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]379LGRIQRELLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR170771378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]390LGREPTPEEDRB1_0421 1
VIR170786378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]405ITPEKVLEIDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR170791378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]410VLEIQQYARDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR170794378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]413IQQYAREPIDRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5
VIR170802378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]421ISLDQTIGDDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 8
VIR170826378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]445VVAVDAVSFDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 7
VIR170827378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]446VAVDAVSFTDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR170834378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]453FTLLQDQLQDRB1_0405, DRB1_0408 2
VIR170836378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]455LLQDQLQSVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR170841378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]460LQSVLDTLSDRB1_0404, DRB1_0423 2
VIR170856378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]475VRLRFGLTDDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 11
VIR170858378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]477LRFGLTDGQDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 14
VIR170860378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]479FGLTDGQPRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR170873378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]492IGQVYGVTRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR170876378772433 YP 005172166.1 sigAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]495VYGVTRERIDRB1_0701, DRB1_0703 2
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