Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR163111378771639 YP 005171372.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]85YPLYGVQQVDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813 3
VIR163136378771639 YP 005171372.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]110LPMLCLGARDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR163139378771639 YP 005171372.1 hypotheticalprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]113LCLGARGWQDRB1_0305, DRB1_1107 2
VIR163175378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]22VVGHMKYPVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 18
VIR163192378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]39WPNRLNLKVDRB1_0817 1
VIR163196378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]43LNLKVLHQNDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 6
VIR163198378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]45LKVLHQNPADRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 6
VIR163200378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]47VLHQNPAVADRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 6
VIR163233378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]80IEEVMTTSQDRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5
VIR163248378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]95YGHYGPLFIDRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 18
VIR163251378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]98YGPLFIRMADRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 13
VIR163254378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]101LFIRMAWHADRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 17
VIR163255378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]102FIRMAWHAADRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 10
VIR163256378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]103IRMAWHAAGDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 31
VIR163260378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]107WHAAGTYRIDRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR163266378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]113YRIHDGRGGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 23
VIR163279378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]126MQRFAPLNSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 41
VIR163282378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]129FAPLNSWPDDRB1_0405 1
VIR163285378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]132LNSWPDNASDRB1_0402 1
VIR163302378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]149WPVKKKYGKDRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1323 4
VIR163308378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]155YGKKLSWADDRB1_0801, DRB1_0817 2
VIR163317378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]164LIVFAGNCADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 10
VIR163318378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]165IVFAGNCALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 15
VIR163320378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]167FAGNCALESDRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 11
VIR163344378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]191WEPDEVYWGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309 3
VIR163351378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]198WGKEATWLGDRB1_0401, DRB1_0421 2
VIR163357378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]204WLGDERYSGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
VIR163376378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]223VQMGLIYVNDRB1_0301, DRB1_1107 2
VIR163378378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]225MGLIYVNPEDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 14
VIR163399378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]246VDIRETFRRDRB1_0402 1
VIR163401378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]248IRETFRRMADRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3
VIR163405378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]252FRRMAMNDVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 27
VIR163408378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]255MAMNDVETADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 8
VIR163419378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]266IVGGHTFGKDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 14
VIR163446378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]293LEQMGLGWKDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR163449378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]296MGLGWKSSYDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR163453378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]300WKSSYGTGTDRB1_0101 1
VIR163470378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]317IEVVWTNTPDRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 4
VIR163472378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]319VVWTNTPTKDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB5_0101, DRB5_0105 9
VIR163481378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]328WDNSFLEILDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR163486378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]333LEILYGYEWDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR163492378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]339YEWELTKSPDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR163494378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]341WELTKSPAGDRB1_0421 1
VIR163504378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]351WQYTAKDGADRB1_0305 1
VIR163506378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]353YTAKDGAGADRB1_0802 1
VIR163531378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]378LATDLSLRVDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0421 5
VIR163537378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]384LRVDPIYERDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9
VIR163542378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]389IYERITRRWDRB1_0402 1
VIR163543378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]390YERITRRWLDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 13
VIR163565378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]412WYKLIHRDMDRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 9
VIR163566378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]413YKLIHRDMGDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1307 3
VIR163569378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]416IHRDMGPVADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR163576378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]423VARYLGPLVDRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3
VIR163579378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]426YLGPLVPKQDRB1_0305, DRB1_1101 2
VIR163580378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]427LGPLVPKQTDRB1_0102 1
VIR163583378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]430LVPKQTLLWDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 29
VIR163589378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]436LLWQDPVPADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 5
VIR163590378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]437LWQDPVPAVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
VIR163598378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]445VSHDLVGEADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR163608378771657 YP 005171390.1 katGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]455IASLKSQILDRB1_0101, DRB1_0102 2
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