Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR229687121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]309VKKALTSIG DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.99
VIR229691121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]313LTSIGKVIA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.20
VIR229719121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]341ILKTVGPML DRB1_0703 1 0.26
VIR229720121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]342LKTVGPMLG DRB1_0301, DRB1_0410, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 9 0.27
VIR229723121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]345VGPMLGISV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.28
VIR229729121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]351ISVAVVFFA DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3 0.57
VIR229733121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]355VVFFAAVTL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.59
VIR229734121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]356VFFAAVTLL DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 6 0.29
VIR229735121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]357FFAAVTLLP DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 9 0.28
VIR229736121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]358FAAVTLLPA DRB1_1101 1 0.30
VIR229761121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]383LTRRFWRSS DRB1_0402, DRB1_0804 2 0.25
VIR229765121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]387FWRSSGVHI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.27
VIR229766121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]388WRSSGVHIV DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 26 0.26
VIR229771121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]393VHIVRRPKT DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 12 0.23
VIR229773121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]395IVRRPKTHL DRB1_0301, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 20 0.21
VIR229774121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]396VRRPKTHLL DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.22
VIR229787121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]409VLVILAGCA DRB1_0102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.28
VIR229788121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]410LVILAGCAG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 36 0.28
VIR229789121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]411VILAGCAGL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR229825121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]447FPSNLIIPE DRB1_1321 1 0.28
VIR229829121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]451LIIPEYLFI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.23
VIR229836121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]458FIQSSTDLR DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.25
VIR229852121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]474LEQMVQRVS DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.28
VIR229855121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]477MVQRVSQVP DRB1_0402, DRB1_0804 2 0.34
VIR229868121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]490VRGITRPAG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 25 0.42
VIR229879121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]501LEQARTSWQ DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 6 0.28
VIR229886121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]508WQAGEVGSK DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.28
VIR229926121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]548VRAQVNRAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.39
VIR229930121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]552VNRAISTVG DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 4 0.41
VIR229950121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]572LLGGNRVLG DRB1_0301 1 0.27
VIR229951121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]573LGGNRVLGE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 5 0.32
VIR229960121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]582LEGAEKLIG DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 7 0.36
VIR229970121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]592MRALGDTID DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.25
VIR229983121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]605FVANNTEWA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323 16 0.28
VIR230055121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]677LRGALATVI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.24
VIR230063121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]685IRAMGSLGM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 49 0.24
VIR230069121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]691LGMSSPGGV DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.22
VIR230077121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]699VRSKINLVN DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1506 12 0.27
VIR230081121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]703INLVNKGVN DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1307, DRB1_1321 4 0.28
VIR230083121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]705LVNKGVNDL DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 26 0.27
VIR230102121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]724VQLLVDQVK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR230104121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]726LLVDQVKKM DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.28
VIR230105121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]727LVDQVKKMG DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.28
VIR230144121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]766LLSYATGES DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.43
VIR230174121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]796LKKVAAAFI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR230231121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]853VVGLPVVLK DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 41 0.25
VIR230232121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]854VGLPVVLKD DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 4 0.24
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VIR230425121639741 YP 979965.1 integralmembranetransportproteinmmpL8[MycobacteriumbovisBCGstr.Pasteur1173P2]1047LGRRRGRAQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 11 0.25
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VIR235409224988734 YP 002643421.1 transcriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]169LALASTHTG DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0421 3 0.28
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VIR235432224988734 YP 002643421.1 transcriptionalregulatoryprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]192WRETVVDNA DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.27
VIR235462224988739 YP 002643426.1 heatshockproteintranscriptionalregulator[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]13FLISVAAEL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.41
VIR235470224988739 YP 002643426.1 heatshockproteintranscriptionalregulator[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]21LAGMHAQTL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.26
VIR235499224988739 YP 002643426.1 heatshockproteintranscriptionalregulator[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]50YSLHDVELL DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 9 0.26
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VIR239145224988878 YP 002643565.1 twocomponentsensorhistidinekinase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]325FERFFRGDK DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1307 3 0.37
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VIR239149224988878 YP 002643565.1 twocomponentsensorhistidinekinase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]329FRGDKARSR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.48
VIR239169224988878 YP 002643565.1 twocomponentsensorhistidinekinase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]349VKHVAANHD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.24
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VIR239192224988878 YP 002643565.1 twocomponentsensorhistidinekinase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]372FTLALPALI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.21
VIR239203224988878 YP 002643565.1 twocomponentsensorhistidinekinase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]383YHDDERPEQ DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.28
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