Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR149103378770693 YP 005170426.1 pstS1geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]361VVKLSDALIDRB1_0102, DRB1_0423 2
VIR149104378770693 YP 005170426.1 pstS1geneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]362VKLSDALIADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 25
VIR149109378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]1MRVCVTGFNDRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321 12
VIR149116378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]8FNVDAVRAVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 11
VIR149124378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]16VAIEETVSQDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 9
VIR149133378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]25VTGVHAVHADRB1_0102 1
VIR149136378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]28VHAVHAYPRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR149139378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]31VHAYPRTASDRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 8
VIR149142378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]34YPRTASVVIDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 5
VIR149148378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]40VVIWYSPELDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33
VIR149162378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]54VLSAITKAQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323 25
VIR149163378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]55LSAITKAQHDRB1_0806, DRB1_1307, DRB1_1321 3
VIR149176378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]68LVPARAPHSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 30
VIR149187378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]79VRGVGVVRKDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 30
VIR149190378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]82VGVVRKITGDRB1_0301, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 8
VIR149192378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]84VVRKITGGIDRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 28
VIR149193378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]85VRKITGGIRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR149200378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]92IRRMLSRPPDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 30
VIR149203378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]95MLSRPPGVDDRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 4
VIR149214378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]106LKASRCGGRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR149227378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]119VRGSASWPGDRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703 3
VIR149245378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]137WLPRVWLALDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1502 5
VIR149249378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]141VWLALPLGLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1506 5
VIR149250378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]142WLALPLGLLDRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 3
VIR149251378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]143LALPLGLLADRB1_1506 1
VIR149255378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]147LGLLALGSSDRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311 11
VIR149257378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]149LLALGSSMFDRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423 7
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VIR149275378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]167LAFAATLPVDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311 14
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VIR149289378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]181WPILRGAVQDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1321 5
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VIR149296378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]188VQQARALTSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 30
VIR149309378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]201LIALGTLTADRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 38
VIR149312378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]204LGTLTAFVYDRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3
VIR149318378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]210FVYSTYQLFDRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR149323378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]215YQLFAGGPLDRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR149331378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]223LFFDTSALIDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR149332378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]224FFDTSALIIDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR149338378770729 YP 005170462.1 putativemetalcationtransporterP-typeatpase[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]230LIIAFVVLGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 40
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