Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR142656378770100 YP 005169833.1 hspRgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]113VPKSTALVVDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR142688378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]27VRPLSTQAVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 40
VIR142697378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]36FRPDFGDEDDRB1_0305, DRB1_0309 2
VIR142728378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]67VRPPVRRLGDRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 9
VIR142732378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]71VRRLGGGLVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 14
VIR142739378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]78LVEIPRAPDDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3
VIR142751378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]90LEALMTNPVDRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 8
VIR142754378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]93LMTNPVVPEDRB1_0806, DRB1_1304 2
VIR142755378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]94MTNPVVPESDRB1_1107 1
VIR142759378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]98VVPESKRFCDRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 13
VIR142768378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]107WNCGRPVGRDRB1_0309 1
VIR142774378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]113VGRSDSETKDRB1_0401, DRB1_0426 2
VIR142791378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]130YCGSPYSFLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR142796378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]135YSFLPQLNPDRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305 3
VIR142798378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]137FLPQLNPGDDRB1_0405 1
VIR142812378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]151YEVKGCIAHDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1321 6
VIR142826378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]165IYLALDRNVDRB1_0402 1
VIR142827378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]166YLALDRNVNDRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_1321 3
VIR142828378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]167LALDRNVNGDRB1_0301, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4
VIR142834378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]173VNGRPVVLKDRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 8
VIR142839378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]178VVLKGLVHSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 33
VIR142845378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]184VHSGDAEAQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4
VIR142862378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]201FLAEVVHPSDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 8
VIR142866378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]205VVHPSIVQIDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR142867378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]206VHPSIVQIFDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703 5
VIR142871378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]210IVQIFNFVEDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1304, DRB1_1321 8
VIR142872378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]211VQIFNFVEHDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 12
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VIR142890378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]229YIVMEYVGGDRB1_0101, DRB1_0405, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR142891378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]230IVMEYVGGQDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 34
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VIR142901378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]240LKRSKGQKLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4
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VIR142935378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]274YNDLKPENIDRB1_0101 1
VIR142943378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]282IMLTEEQLKDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR142950378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]289LKLIDLGAVDRB1_0301, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1506 8
VIR142955378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]294LGAVSRINSDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 15
VIR142958378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]297VSRINSFGYDRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR142961378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]300INSFGYLYGDRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3
VIR142964378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]303FGYLYGTPGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4
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VIR142979378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]318VRTGPTVATDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 8
VIR142990378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]329YTVGRTLAADRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_1101 3
VIR142999378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]338LTLDLPTRNDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6
VIR143021378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]360LKTYDSYGRDRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR143024378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]363YDSYGRLLRDRB1_1502 1
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VIR143030378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]369LLRRAIDPDDRB1_0801, DRB1_0806 2
VIR143035378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]374IDPDPRQRFDRB1_0301 1
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VIR143057378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]396LREVVAQDTDRB1_0102 1
VIR143083378770158 YP 005169891.1 pknGgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]422FGVDLLVAHDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
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