Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR135453449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]443WCVVNAGNYDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR135455449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]445VVNAGNYRGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1506 9
VIR135461449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]451YRGSMNVTDDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426 6
VIR135465449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]455MNVTDALATDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR135479449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]469FAKLISQVGDRB1_0405 1
VIR135482449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]472LISQVGVGRDRB1_0102 1
VIR135486449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]476VGVGRAVDMDRB1_0102 1
VIR135488449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]478VGRAVDMAIDRB1_1506 1
VIR135494449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]484MAIKLGLRSDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 22
VIR135496449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]486IKLGLRSYADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 10
VIR135500449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]490LRSYANPGTDRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5
VIR135503449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]493YANPGTARDDRB1_0405 1
VIR135512449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]502YNPDSNESLDRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4
VIR135520449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]510LADFVKRQNDRB1_1304 1
VIR135523449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]513FVKRQNLGSDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 30
VIR135524449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]514VKRQNLGSFDRB1_0301 1
VIR135529449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]519LGSFTLGPIDRB1_1501, DRB1_1506 2
VIR135534449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]524LGPIELNALDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR135537449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]527IELNALELSDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4
VIR135589449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]579LANTLANAMDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR135597449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]587MSKDAVGSGDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3
VIR135635449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]625FVGFTNRYADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 26
VIR135638449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]628FTNRYAAANDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817 4
VIR135647449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]637YIYDDSSSPDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 5
VIR135663449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]653LRHCGSGDLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR135672449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]662YGGNEPSRTDRB1_0101 1
VIR135681449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]671WFAAMKPIADRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 6
VIR135682449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]672FAAMKPIANDRB1_0405, DRB1_0817, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 5
VIR135685449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]675MKPIANNFGDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 9
VIR135704449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]694YVDGAPGSRDRB1_0309, DRB5_0101, DRB5_0105 3
VIR135733449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]723FQVADQTNSDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0408, DRB1_0813 4
VIR135742449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]732VNSSAKYGEDRB1_1304 1
VIR135751449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]741VVGTSPSGQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB5_0101, DRB5_0105 15
VIR135765449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]755IVTIQISNGDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1107 12
VIR135766449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]756VTIQISNGIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 19
VIR135768449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]758IQISNGIPPDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR135800449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]790IPGLPPITIDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR135813449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]1MKRGLTVAVDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 9
VIR135819449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]7VAVAGAAILDRB1_0102 1
VIR135821449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]9VAGAAILVADRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4
VIR135827449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]15LVAGLSGCSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
VIR135831449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]19LSGCSSNKSDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 4
VIR135864449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]52VVIDGKDQNDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1304 9
VIR135886449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]74VNIAIGGAADRB1_0102 1
VIR135900449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]88VLTDGNPPEDRB1_0301 1
VIR135912449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]100VGLGNVNGVDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR135914449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]102LGNVNGVTLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4
VIR135942449065877 YP 007432960.1 19kDalipoproteinantigenprecursorLPQH[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]130YKITGTATGDRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 21
VIR135964449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]1MRPNMHGCVDRB1_0301 1
VIR135972449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]9VEMRMREARDRB1_0813 1
VIR135974449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]11MRMREARMQDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 27
VIR135981449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]18MQLVDRVRGDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0806, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 17
VIR135983449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]20LVDRVRGAVDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4
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VIR135991449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]28VTGMSRRLVDRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11
VIR135994449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]31MSRRLVVGADRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 6
VIR135998449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]35LVVGAVGAADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1107, DRB1_1307 11
VIR135999449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]36VVGAVGAALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR136000449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]37VGAVGAALVDRB1_0102 1
VIR136007449065921 YP 007433004.1 esterase,,antigen85-A[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]44LVSGLVGAVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
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