Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR129193449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]600LRHSAVTERDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 18
VIR129204449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]611VVFPVAPTTDRB1_0102 1
VIR129205449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]612VFPVAPTTQDRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 7
VIR129206449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]613FPVAPTTQKDRB1_0401, DRB1_0408 2
VIR129218449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]625FVNWEGRYRDRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 13
VIR129221449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]628WEGRYRTFEDRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817 3
VIR129225449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]632YRTFEPALRDRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 20
VIR129232449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]639LRGSTLQAGDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR129273449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]680LGIWDGKHADRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4
VIR129300449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]707ILTGWRMLLDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 9
VIR129304449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]711WRMLLDEGRDRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB5_0101, DRB5_0105 7
VIR129306449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]713MLLDEGRLQDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6
VIR129328449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]735VVRLSPDTADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1322 20
VIR129329449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]736VRLSPDTAADRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0426 4
VIR129347449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]754VTVSTSRGSDRB1_0402 1
VIR129369449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]776VVWLPLNSADRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28
VIR129371449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]778WLPLNSAGSDRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323 26
VIR129374449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]781LNSAGSTVHDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 6
VIR129381449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]788VHRQLRVTIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 19
VIR129385449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]792LRVTIGSIVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR129387449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]794VTIGSIVKIDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7
VIR129389449065245 YP 007432328.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]796IGSIVKIGADRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 14
VIR129392449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]1MEVSRALLFDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR129394449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]3VSRALLFELDRB1_0703 1
VIR129398449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]7LLFELGVLLDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR129399449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]8LFELGVLLADRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 10
VIR129400449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]9FELGVLLAVDRB1_1502 1
VIR129402449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]11LGVLLAVLADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423 4
VIR129405449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]14LLAVLAVLGDRB1_0102 1
VIR129406449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]15LAVLAVLGADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 27
VIR129409449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]18LAVLGAVARDRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3
VIR129411449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]20VLGAVARRFDRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 9
VIR129412449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]21LGAVARRFADRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3
VIR129419449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]28FALSPIPVYDRB1_0305, DRB1_0309 2
VIR129421449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]30LSPIPVYLLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR129424449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]33IPVYLLAGLDRB1_0806, DRB1_1506 2
VIR129426449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]35VYLLAGLSLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 16
VIR129427449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]36YLLAGLSLGDRB1_0309 1
VIR129434449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]43LGNGGILGVDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR129439449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]48ILGVAAAGEDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806 4
VIR129455449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]64IGVVLLLLADRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR129457449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]66VVLLLLALGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 38
VIR129458449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]67VLLLLALGLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 33
VIR129459449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]68LLLLALGLEDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1321 4
VIR129460449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]69LLLALGLEFDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 13
VIR129461449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]70LLALGLEFSDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4
VIR129464449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]73LGLEFSATEDRB1_0410, DRB1_0421 2
VIR129466449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]75LEFSATEFADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 8
VIR129473449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]82FASSLRHHLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR129477449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]86LRHHLPSAGDRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14
VIR129488449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]97IVLNATPGADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 44
VIR129501449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]110LLGLDGVAIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1506 3
VIR129502449065340 YP 007432423.1 cation/protonantiporter[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]111LGLDGVAILDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
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