Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR009857339630827 YP 004722469.1 PhoPfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]236LRGVGYVLR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.29
VIR009888339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]28LPRSVTAFI DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0703 4 0.25
VIR009907339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]47LRTLNRMHE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 32 0.26
VIR009913339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]53MHEVIPGAR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR009916339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]56VIPGARVEG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.28
VIR009926339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]66VLLDDQDIY DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.27
VIR009951339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]91FQRPNPFPA DRB1_0305, DRB1_1114, DRB1_1323 3 0.51
VIR009960339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]100MSIRNNVVA DRB1_0402, DRB1_0804 2 0.27
VIR009962339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]102IRNNVVAGL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 44 0.36
VIR009970339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]110LKLQGVRNR DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.33
VIR009972339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]112LQGVRNRKV DRB1_0402 1 0.30
VIR009975339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]115VRNRKVLDD DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.24
VIR009989339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]129LRGANLWDE DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.26
VIR010017339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]157LCIARAIAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.27
VIR010029339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]169VLLMDEPCS DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.28
VIR010030339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]170LLMDEPCSS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 23 0.28
VIR010039339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]179LDPISTMAI DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 6 0.37
VIR010054339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]194LKQQYTIVI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1301, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328 18 0.29
VIR010058339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]198YTIVIVTHN DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0813, DRB1_1321 5 0.21
VIR010060339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]200IVIVTHNMQ DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 33 0.28
VIR010061339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]201VIVTHNMQQ DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 13 0.28
VIR010062339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]202IVTHNMQQA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 6 0.28
VIR010067339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]207MQQAARVSD DRB1_1304 1 0.28
VIR010079339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]219FFNLEAVGK DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.50
VIR010080339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]220FNLEAVGKP DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.44
VIR010091339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]231LVEIASTEK DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.27
VIR010092339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]232VEIASTEKI DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 14 0.99
VIR010094339630886 YP 004722528.1 phosphateABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]234IASTEKIFS DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.49
VIR010111339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]1MRTAYHEQL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.27
VIR010115339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]5YHEQLSELS DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.28
VIR010129339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]19MCGLAGIAM DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR010149339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]39LVLAEQVIS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 36 0.27
VIR010162339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]52IATLSARAE DRB1_1304 1 0.40
VIR010174339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]64FVLLALQAP DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 21 0.26
VIR010190339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]80IVSAIQMVA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1506 20 0.28
VIR010194339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]84IQMVADIDR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR010200339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]90IDRMGALAL DRB1_0102 1 0.27
VIR010206339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]96LALHVAKIA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 6 0.28
VIR010210339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]100VAKIARRRH DRB1_1304 1 0.30
VIR010230339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]120YFAEMGRVA DRB1_0101 1 0.37
VIR010249339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]139VLSHDPEKA DRB1_0401, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4 0.27
VIR010277339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]167VLMDREWKH DRB1_0305, DRB1_1107 2 0.28
VIR010283339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]173WKHGVAAAV DRB1_0101 1 0.28
VIR010300339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]190YERFADHAV DRB1_1502 1 0.28
VIR010310339630887 YP 004722529.1 PhoYfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]200VARRVIFQA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 9 0.29
VIR010316339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]1MASKAGLGQ DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5 0.31
VIR010337339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]22FYRGSPGRP DRB1_0309 1 0.30
VIR010338339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]23YRGSPGRPW DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1323 4 0.27
VIR010346339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]31WLIGAVVIP DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 5 0.25
VIR010362339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]47YGAFERPQS DRB1_0305, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 12 0.47
VIR010392339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]77LSLSLLSIS DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.27
VIR010394339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]79LSLLSISRS DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1107, DRB1_1307 7 0.30
VIR010408339630964 YP 004722606.1 outermembraneproteinOmpA[MycobacteriumafricanumGM041182]93LIGDFPDEA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.37
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VIR010831339630993 YP 004722635.1 phosphateABCtransporter[MycobacteriumafricanumGM041182]198VPKWKTIVR DRB1_0402 1 0.28
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VIR012363339631031 YP 004722673.1 ATPaseP[MycobacteriumafricanumGM041182]412LIIACPCAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0410, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 29 0.28
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VIR012879339631044 YP 004722686.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]166LIANPRRVL DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.41
VIR012886339631044 YP 004722686.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]173VLTRSRILE DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 6 0.48
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VIR012897339631044 YP 004722686.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]184WGFDFPTSG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.28
VIR012908339631044 YP 004722686.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumafricanumGM041182]195LEVYVGYLR DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.31
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VIR014257339631302 YP 004722944.1 sugar-bindinglipoprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]407MHAIIRQQL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.38
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VIR014276339631302 YP 004722944.1 sugar-bindinglipoprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]426VYQALSIRL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.26
VIR014280339631302 YP 004722944.1 sugar-bindinglipoprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]430LSIRLAAVL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.22
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VIR014645339631358 YP 004723000.1 hypotheticalproteinMAF 13110[MycobacteriumafricanumGM041182]335FERTLQQDI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
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VIR014655339631358 YP 004723000.1 hypotheticalproteinMAF 13110[MycobacteriumafricanumGM041182]345FGLRQMVDI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0813 4 0.28
VIR014657339631358 YP 004723000.1 hypotheticalproteinMAF 13110[MycobacteriumafricanumGM041182]347LRQMVDIAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.28
VIR014660339631358 YP 004723000.1 hypotheticalproteinMAF 13110[MycobacteriumafricanumGM041182]350MVDIALRAL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.26
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