Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR115548449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]176VIGVLVLAVDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 25
VIR115549449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]177IGVLVLAVADRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311 6
VIR115551449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]179VLVLAVAMLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 26
VIR115552449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]180LVLAVAMLLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 45
VIR115553449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]181VLAVAMLLLDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 4
VIR115554449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]182LAVAMLLLMDRB1_1128, DRB1_1305 2
VIR115556449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]184VAMLLLMRADRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 24
VIR115558449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]186MLLLMRAKTDRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 22
VIR115559449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]187LLLMRAKTDDRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 8
VIR115560449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]188LLMRAKTDADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20
VIR115561449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]189LMRAKTDADDRB1_0405, DRB1_0410 2
VIR115575449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]203IMLMSAIMPDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18
VIR115576449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]204MLMSAIMPVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28
VIR115578449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]206MSAIMPVTVDRB1_0102 1
VIR115581449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]209IMPVTVAAADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 19
VIR115602449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]230VLGFGVLTVDRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33
VIR115605449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]233FGVLTVAAADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323 27
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VIR115608449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]236LTVAAALALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4
VIR115614449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]242LALRFTGRRDRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 3
VIR115616449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]244LRFTGRRLGDRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 21
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VIR115625449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]253IYTTIVIIDDRB1_1321 1
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VIR115630449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]258VIIDALTMLDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1506 9
VIR115631449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]259IIDALTMLADRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 5
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VIR115637449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]265MLAALARMVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402 3
VIR115638449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]266LAALARMVADRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1506 10
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VIR115645449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]273VAATSAVTLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR115651449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]279VTLLSSLLLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 21
VIR115653449063855 YP 007430938.1 conservedmembraneprotein[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]281LLSSLLLICDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 9
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