Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR167431378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]263FKRDVMPNP DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.29
VIR167440378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]272VANNSVNVF DRB1_0421, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.29
VIR167445378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]277VNVFQIEEI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.42
VIR167447378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]279VFQIEEITK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.44
VIR167448378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]280FQIEEITKT DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.43
VIR167459378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]291FVGHCAEMC DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323 13 0.28
VIR167470378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]302YHSMMNFEV DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 17 0.28
VIR167473378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]305MMNFEVRVV DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 24 0.29
VIR167476378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]308FEVRVVTPN DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817 3 0.29
VIR167478378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]310VRVVTPNDF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0813, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.30
VIR167486378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]318FKAYLQQRI DRB1_0802, DRB1_0813 2 0.99
VIR167503378771930 YP 005171663.1 ctaCgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]335LRAINQPPL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 6 0.27
VIR167526378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]3MRLSRRDKI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 18 0.32
VIR167528378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]5LSRRDKIAR DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817 4 0.30
VIR167534378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]11IARMLLIWA DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.28
VIR167537378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]14MLLIWAALA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 24 0.28
VIR167538378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]15LLIWAALAA DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 35 0.28
VIR167541378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]18WAALAAVAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.28
VIR167547378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]24VALVLVGCI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1307 4 0.28
VIR167549378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]26LVLVGCIRV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 33 0.28
VIR167551378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]28LVGCIRVVG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.28
VIR167552378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]29VGCIRVVGG DRB1_0410 1 0.28
VIR167555378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]32IRVVGGRAR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.31
VIR167557378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]34VVGGRARMA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 6 0.26
VIR167558378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]35VGGRARMAE DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 8 0.26
VIR167573378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]50VEWTPCRSS DRB1_0402 1 0.28
VIR167614378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]91LIRFPATGD DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1304 3 0.45
VIR167615378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]92IRFPATGDK DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1107, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.39
VIR167624378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]101IGSLVINPG DRB1_0410 1 0.29
VIR167627378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]104LVINPGGPG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1506 7 0.28
VIR167643378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]120LGVFQTLPK DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 24 0.39
VIR167660378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]137VGFDPRGVA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.34
VIR167662378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]139FDPRGVASS DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817 5 0.21
VIR167708378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]185FVGRCVDKM DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 11 0.28
VIR167721378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]198LAHVGTVNV DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.34
VIR167747378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]224YLGYSYGTR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.31
VIR167748378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]225LGYSYGTRI DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.99
VIR167750378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]227YSYGTRIGS DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1107 4 0.99
VIR167764378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]241FPQRVRAMI DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813 3 0.28
VIR167768378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]245VRAMILDGA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0423 5 0.26
VIR167771378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]248MILDGAVDP DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.29
VIR167788378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]265LRQAKGFQD DRB1_1304 1 0.22
VIR167821378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]298VEVYHSLVD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 5 0.28
VIR167858378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]335VGTIMALYS DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 20 0.22
VIR167895378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]372YMRRDSHGR DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.23
VIR167938378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]415IAPFMSYGK DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.30
VIR167941378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]418FMSYGKFTG DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB1_1506 17 0.28
VIR167958378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]435FWPVPPTSQ DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.27
VIR167979378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]456VVVSTTHDP DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.27
VIR168006378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]483LTFDGTQHT DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 9 0.26
VIR168015378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]492VVFQGDSCI DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.38
VIR168017378771955 YP 005171688.1 putativeexportedprotease[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]494FQGDSCIDE DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421 3 0.30
VIR168040378771966 YP 005171699.1 ptpAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]5LHVTFVCTG DRB1_0421 1 0.28
VIR168044378771966 YP 005171699.1 ptpAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]9FVCTGNICR DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.28
VIR168059378771966 YP 005171699.1 ptpAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]24MFAQQLRHR DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.27
VIR168060378771966 YP 005171699.1 ptpAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]25FAQQLRHRG DRB1_1120, DRB1_1302 2 0.28
VIR168073378771966 YP 005171699.1 ptpAgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]38VRVTSAGTG DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.41
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