Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR107859449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst564LGIAYGLGGDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR107868449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst573LRTGLLAARDRB1_0301, DRB1_0309 2
VIR107880449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst585VTLDETELADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR107887449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst592LAVREHPREDRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3
VIR107905449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst610VVFDHVTFGDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 15
VIR107906449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst611VFDHVTFGYDRB1_0402, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4
VIR107910449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst615VTFGYRPGVDRB1_0301, DRB1_1107 2
VIR107912449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst617FGYRPGVPVDRB1_0802, DRB1_0813 2
VIR107914449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst619YRPGVPVIQDRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 16
VIR107920449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst625VIQDVSLTLDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 14
VIR107928449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst633LRPGTVTALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 13
VIR107937449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst642VGPSGSGKSDRB1_1107 1
VIR107947449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst652LATLLARFHDRB1_1304 1
VIR107964449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst669VGGQDIRSLDRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 9
VIR107969449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst674IRSLAADELDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR107977449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst682LYTRVGFVLDRB1_1501, DRB1_1506 2
VIR107983449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst688FVLQEAQLVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 22
VIR107991449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst696VHGTAAENIDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR108011449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst716VQVAAREAQDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 10
VIR108013449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst718VAAREAQIHDRB1_0402, DRB1_0806 2
VIR108025449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst730LRLPDGYDTDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4
VIR108034449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst739VLGANSGLSDRB1_0423 1
VIR108049449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst754LTIARAILGDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR108055449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst760ILGDTPVLIDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR108056449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst761LGDTPVLILDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR108061449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst766VLILDEATADRB1_0102, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311 7
VIR108062449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst767LILDEATAFDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9
VIR108063449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst768ILDEATAFADRB1_0401, DRB1_0426 2
VIR108077449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst782YLVQQALNRDRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 13
VIR108078449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst783LVQQALNRLDRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 8
VIR108079449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst784VQQALNRLTDRB1_0402 1
VIR108086449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst791LTRDRTVLVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR108092449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst797VLVIAHRLHDRB1_0402, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 10
VIR108093449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst798LVIAHRLHTDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 40
VIR108094449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst799VIAHRLHTIDRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 13
VIR108099449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst804LHTITRADQDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 16
VIR108108449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst813IVVLDHGRIDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 17
VIR108109449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst814VVLDHGRIVDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 9
VIR108110449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst815VLDHGRIVEDRB1_1304 1
VIR108116449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst821IVERGTHEEDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 5
VIR108125449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst830LLAAGGRYCDRB1_0102 1
VIR108132449063422 YP 007430505.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[MycobacteriumbovisBCGst837YCRLWDTGQDRB1_0405, DRB1_0408 2
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