Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
SEC017066433632962 YP 007266590.1 ESXcon113YCIDLGGGG DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.28
SEC017075433632962 YP 007266590.1 ESXcon122LIYLENLPH DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 32 0.99
SEC017096433632962 YP 007266590.1 ESXcon143VNRVVAEMQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423 7 0.28
SEC017103433632962 YP 007266590.1 ESXcon150MQAVMRQRE DRB1_0806 1 0.28
SEC017107433632962 YP 007266590.1 ESXcon154MRQRETTFK DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 9 0.28
SEC017122433632962 YP 007266590.1 ESXcon169IGMYRQLRD DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 8 0.26
SEC017125433632962 YP 007266590.1 ESXcon172YRQLRDDPS DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.27
SEC017128433632962 YP 007266590.1 ESXcon175LRDDPSQPV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 9 0.22
SEC017145433632962 YP 007266590.1 ESXcon192FLIIDGWPG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.28
SEC017146433632962 YP 007266590.1 ESXcon193LIIDGWPGF DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.28
SEC017154433632962 YP 007266590.1 ESXcon201FVGEFPDLE DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.29
SEC017175433632962 YP 007266590.1 ESXcon222FGVHVIIST DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502 5 0.29
SEC017177433632962 YP 007266590.1 ESXcon224VHVIISTPR DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.29
SEC017179433632962 YP 007266590.1 ESXcon226VIISTPRWT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 16 0.32
SEC017180433632962 YP 007266590.1 ESXcon227IISTPRWTE DRB1_1304 1 0.37
SEC017186433632962 YP 007266590.1 ESXcon233WTELKSRVR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.31
SEC017193433632962 YP 007266590.1 ESXcon240VRDYLGTKI DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.48
SEC017196433632962 YP 007266590.1 ESXcon243YLGTKIEFR DRB1_0421 1 0.29
SEC017203433632962 YP 007266590.1 ESXcon250FRLGDVNET DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502 24 0.49
SEC017236433632962 YP 007266590.1 ESXcon283LMIGVPRFD DRB1_0402, DRB1_0806, DRB1_1304 3 0.24
SEC017237433632962 YP 007266590.1 ESXcon284MIGVPRFDG DRB1_0301, DRB1_1506 2 0.21
SEC017240433632962 YP 007266590.1 ESXcon287VPRFDGVHS DRB1_1506 1 0.22
SEC017246433632962 YP 007266590.1 ESXcon293VHSAENLVE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3 0.27
SEC017252433632962 YP 007266590.1 ESXcon299LVEAITAGV DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.25
SEC017263433632962 YP 007266590.1 ESXcon310IASQHTEQA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.26
SEC017274433632962 YP 007266590.1 ESXcon321VRVLPERIH DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.30
SEC017276433632962 YP 007266590.1 ESXcon323VLPERIHLH DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.29
SEC017281433632962 YP 007266590.1 ESXcon328IHLHELDPN DRB1_1304 1 0.28
SEC017297433632962 YP 007266590.1 ESXcon344YRTRWEIPI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1502 7 0.28
SEC017338433632962 YP 007266590.1 ESXcon385IAHAIARAI DRB1_0102 1 0.34
SEC017355433632962 YP 007266590.1 ESXcon402VRFMLADYR DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.25
SEC017357433632962 YP 007266590.1 ESXcon404FMLADYRSG DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.23
SEC017358433632962 YP 007266590.1 ESXcon405MLADYRSGL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.22
SEC017375433632962 YP 007266590.1 ESXcon422LLGAGAINR DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.23
SEC017424433632962 YP 007266590.1 ESXcon471VVLLVDDWH DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.28
SEC017426433632962 YP 007266590.1 ESXcon473LLVDDWHMI DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.28
SEC017427433632962 YP 007266590.1 ESXcon474LVDDWHMIV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
SEC017431433632962 YP 007266590.1 ESXcon478WHMIVGAAG DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.27
SEC017433433632962 YP 007266590.1 ESXcon480MIVGAAGGM DRB1_0301 1 0.24
SEC017444433632962 YP 007266590.1 ESXcon491MAPLAPLLP DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.23
SEC017459433632962 YP 007266590.1 ESXcon506LHIIVTCQM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 46 0.28
SEC017461433632962 YP 007266590.1 ESXcon508IIVTCQMSQ DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1321 5 0.28
SEC017491433632962 YP 007266590.1 ESXcon538FLSGEKQEF DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.39
SEC017504433632962 YP 007266590.1 ESXcon551FKVKRRPPG DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 14 0.28
SEC017541433632966 YP 007266594.1 6kDae6WNFAGIEAA DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1323 5 0.94
SEC017543433632966 YP 007266594.1 6kDae8FAGIEAAAS DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307 10 0.93
SEC017553433632966 YP 007266594.1 6kDae18IQGNVTSIH DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1304 15 0.48
SEC017557433632966 YP 007266594.1 6kDae22VTSIHSLLD DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3 0.41
SEC017578433632966 YP 007266594.1 6kDae43WGGSGSEAY DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.28
SEC017586433632966 YP 007266594.1 6kDae51YQGVQQKWD DRB1_1321 1 0.37
SEC017604433632966 YP 007266594.1 6kDae69LQNLARTIS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 30 0.58
SEC017658433632968 YP 007266596.1 ESXcon37VLPAAVPME DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 3 0.25
SEC017668433632968 YP 007266596.1 ESXcon47YIDDTVAVL DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.21
SEC017693433632968 YP 007266596.1 ESXcon72FTAQGLWAF DRB1_1120, DRB1_1302 2 0.25
SEC017698433632968 YP 007266596.1 ESXcon77LWAFARPGS DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 5 0.27
SEC017729433632968 YP 007266596.1 ESXcon108VSVSRTERY DRB1_0421 1 0.51
SEC017740433632968 YP 007266596.1 ESXcon119LVEDVIDAI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.29
SEC017762433632968 YP 007266596.1 ESXcon141LNRFVGAAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.28
SEC017765433632968 YP 007266596.1 ESXcon144FVGAAIPLL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 17 0.27
SEC017778433632968 YP 007266596.1 ESXcon157IGMAMRAWW DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322 8 0.24
SEC017803433632968 YP 007266596.1 ESXcon182IAVLVGSFV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
SEC017806433632968 YP 007266596.1 ESXcon185LVGSFVANR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 22 0.28
SEC017807433632968 YP 007266596.1 ESXcon186VGSFVANRF DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.30
SEC017810433632968 YP 007266596.1 ESXcon189FVANRFYQS DRB1_0101, DRB1_1114, DRB1_1323 3 0.29
SEC017825433632968 YP 007266596.1 ESXcon204LLVTTYLLI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.23
SEC017847433632968 YP 007266596.1 ESXcon226VNSLGAPQV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.35
SEC017879433632968 YP 007266596.1 ESXcon258LASFAVITA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.20
SEC017882433632968 YP 007266596.1 ESXcon261FAVITAIAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.26
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SEC019136433636983 YP 007270610.1 Membran357IIHRITATA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 12 0.38
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SEC019154433636983 YP 007270610.1 Membran375LVGAGVIDA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 42 0.28
SEC019166433636983 YP 007270610.1 Membran387LTWDIPPGP DRB1_0301, DRB1_1107 2 0.28
SEC019214433636983 YP 007270610.1 Membran435LGALARRAL DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.25
SEC019235433636967 YP 007270594.1 ESX-1s19FSAAHTNEA DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426 4 0.26
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