Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
RD10141415843519 NP 338556.1 hypothetica295MPFDPHLAK DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.26
RD10143215843519 NP 338556.1 hypothetica313LNKKSRLRL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 15 0.33
RD10143815843519 NP 338556.1 hypothetica319LRLFEITAG DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 28 0.32
RD10144115843519 NP 338556.1 hypothetica322FEITAGLAD DRB1_1321 1 0.41
RD101452385996993 YP 005915291.1 unnamed1MKRLSGWDA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 7 0.28
RD101462385996993 YP 005915291.1 unnamed11LLYSETPNV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0703, DRB1_1107 8 0.25
RD101463385996993 YP 005915291.1 unnamed12LYSETPNVH DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.28
RD101470385996993 YP 005915291.1 unnamed19VHMHTLKVA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 17 0.30
RD101498385996993 YP 005915291.1 unnamed47IAGRLHKLE DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.35
RD101502385996993 YP 005915291.1 unnamed51LHKLEPLGY DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.38
RD101510385996993 YP 005915291.1 unnamed59YQLVDVPLK DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0408, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.25
RD101515385996993 YP 005915291.1 unnamed64VPLKFHHPM DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.28
RD101517385996993 YP 005915291.1 unnamed66LKFHHPMWR DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 32 0.28
RD101524385996993 YP 005915291.1 unnamed73WREHCQVDL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
RD101532385996993 YP 005915291.1 unnamed81LNYHIRPWR DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14 0.28
RD101534385996993 YP 005915291.1 unnamed83YHIRPWRLR DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.28
RD101536385996993 YP 005915291.1 unnamed85IRPWRLRAP DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.28
RD101539385996993 YP 005915291.1 unnamed88WRLRAPGGR DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.25
RD101554385996993 YP 005915291.1 unnamed103VGEIASTPL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.32
RD101562385996993 YP 005915291.1 unnamed111LNRDHPLWE DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_0817, DRB1_1107 10 0.28
RD101569385996993 YP 005915291.1 unnamed118WEMYFVEGL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1502 7 0.30
RD101571385996993 YP 005915291.1 unnamed120MYFVEGLAN DRB1_1321, DRB1_1506 2 0.31
RD101572385996993 YP 005915291.1 unnamed121YFVEGLANH DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0801 3 0.31
RD101573385996993 YP 005915291.1 unnamed122FVEGLANHR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
RD101582385996993 YP 005915291.1 unnamed131IAVVAKIHH DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311, DRB1_1321 8 0.28
RD101584385996993 YP 005915291.1 unnamed133VVAKIHHAL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.28
RD101617385996993 YP 005915291.1 unnamed166YVPDPAPTK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.67
RD101633385996993 YP 005915291.1 unnamed182FIDHLRHLG DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 4 0.28
RD101637385996993 YP 005915291.1 unnamed186LRHLGRIPA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 38 0.27
RD101640385996993 YP 005915291.1 unnamed189LGRIPATIR DRB1_0102, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.33
RD101654385996993 YP 005915291.1 unnamed203LGRVRRSSR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.45
RD101696385996993 YP 005915291.1 unnamed245LIDVKATAK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.99
RD101705385996993 YP 005915291.1 unnamed254LLGATINDM DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.24
RD101710385996993 YP 005915291.1 unnamed259INDMVLAMS DRB1_0804 1 0.28
RD101722385996993 YP 005915291.1 unnamed271LRTLLLRYD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14 0.28
RD101726385996993 YP 005915291.1 unnamed275LLRYDGKAE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 4 0.28
RD101737385996993 YP 005915291.1 unnamed286LASVPVSYD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.25
RD101742385996993 YP 005915291.1 unnamed291VSYDFSPER DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.28
RD101771385996993 YP 005915291.1 unnamed320LQRVRVCHE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 11 0.28
RD101774385996993 YP 005915291.1 unnamed323VRVCHENAV DRB1_0102 1 0.28
RD101795385996993 YP 005915291.1 unnamed344LISRWAAYW DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.28
RD101799385996993 YP 005915291.1 unnamed348WAAYWPPAG DRB1_0801, DRB1_0817 2 0.28
RD101803385996993 YP 005915291.1 unnamed352WPPAGAEAL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.27
RD101812385996993 YP 005915291.1 unnamed361FRWLSERDG DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.22
RD101824385996993 YP 005915291.1 unnamed373VLNLNISNV DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 3 0.38
RD101825385996993 YP 005915291.1 unnamed374LNLNISNVP DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.44
RD101827385996993 YP 005915291.1 unnamed376LNISNVPGP DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.58
RD101849385996993 YP 005915291.1 unnamed398IYSVGPLTA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 17 0.26
RD101861385996993 YP 005915291.1 unnamed410LNITVWSYV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.30
RD101866385996993 YP 005915291.1 unnamed415WSYVDQLNI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305 5 0.26
RD101868385996993 YP 005915291.1 unnamed417YVDQLNISV DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426 5 0.42
RD101872385996993 YP 005915291.1 unnamed421LNISVLTDG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.27
RD101893385996993 YP 005915291.1 unnamed442MIADFIEIR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
RD101897385996993 YP 005915291.1 unnamed446FIEIRRAAG DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307 3 0.29
RD101898385996993 YP 005915291.1 unnamed447IEIRRAAGL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.34
RD101900385996993 YP 005915291.1 unnamed449IRRAAGLSV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 24 0.25
RD101906385996993 YP 005915291.1 unnamed455LSVELTVVE DRB1_0421 1 0.30
RD101908385996993 YP 005915291.1 unnamed457VELTVVESA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.30
RD101910385996993 YP 005915291.1 unnamed459LTVVESAMA DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.24
RD101927385996994 YP 005915292.1 echA1g16VEQRDRILI DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 7 0.36
RD101947385996994 YP 005915292.1 echA1g36VNAAVSRGL DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.63
RD101986385996994 YP 005915292.1 echA1g75LKAFARGEN DRB1_0806, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.40
RD101995385996994 YP 005915292.1 echA1g84VVVEGRGLG DRB1_0301, DRB1_0806 2 0.40
RD102014385996994 YP 005915292.1 echA1g103IAAVEGYAL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.22
RD102020385996994 YP 005915292.1 echA1g109YALAGGTEL DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.27
RD102034385996994 YP 005915292.1 echA1g123LIVAARDSA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.41
RD102036385996994 YP 005915292.1 echA1g125VAARDSAFG DRB1_0806 1 0.40
RD102048385996994 YP 005915292.1 echA1g137VKRGLVAGG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.28
RD102052385996994 YP 005915292.1 echA1g141LVAGGGGLL DRB1_1506 1 0.28
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