Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR08780631794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]78LEVAQSIESDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 7
VIR08781831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]90VNYRITVKPDRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 5
VIR08782031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]92YRITVKPGWDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323 21
VIR08782431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]96VKPGWKFTDDRB1_0301, DRB1_1304 2
VIR08782831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]100WKFTDGSPVDRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703 3
VIR08784131794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]113FVDAWNYGADRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0408 3
VIR08784731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]119YGALSTNAQDRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 18
VIR08788231794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]154MSGLRVVNDDRB1_0410 1
VIR08788531794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]157LRVVNDLEFDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR08788731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]159VVNDLEFTVDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4
VIR08789131794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]163LEFTVRLKADRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR08789331794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]165FTVRLKAPTDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6
VIR08789531794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]167VRLKAPTIDDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 14
VIR08790431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]176FTLRLGHSSDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1323 6
VIR08790631794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]178LRLGHSSFYDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1506 10
VIR08790831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]180LGHSSFYPLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR08792131794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]193FRDMAAFGRDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 9
VIR08792431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]196MAAFGRNPIDRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3
VIR08792731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]199FGRNPIGNGDRB1_0309 1
VIR08793731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]209YKLADGPAGDRB1_0101, DRB1_0309 2
VIR08794831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]220WEHNVRIDLDRB1_1101 1
VIR08795231794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]224VRIDLVPNPDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 14
VIR08796231794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]234YHGNRKPRNDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0817, DRB1_1321 4
VIR08797331794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]245LRFEFYANLDRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3
VIR08797531794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]247FEFYANLDTDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 6
VIR08797831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]250YANLDTAYADRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 18
VIR08800631794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]278VYQRDLGDHDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5
VIR08800731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]279YQRDLGDHADRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401 7
VIR08803531794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]307FGGEEGRLRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR08804231794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]314LRRLALSAADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 34
VIR08804531794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]317LALSAAINRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR08804731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]319LSAAINRPQDRB1_0402 1
VIR08805131794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]323INRPQICQQDRB1_0804, DRB1_0806 2
VIR08806031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]332IFAGTRSPADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5
VIR08810631794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]378ISPWSGRYADRB1_0402 1
VIR08810931794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]381WSGRYAIAYDRB1_0817 1
VIR08811331794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]385YAIAYNADADRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1307 10
VIR08812631794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]398WVDAVANSIDRB1_0101, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR08813031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]402VANSIKNVLDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703 6
VIR08813431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]406IKNVLGIDADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 10
VIR08813731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]409VLGIDAVAADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 5
VIR08813831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]410LGIDAVAAPDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR08815031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]422FAGFRTQITDRB1_0405, DRB1_0408 2
VIR08815331794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]425FRTQITNRADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 31
VIR08816631794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]438FRAGWQGDYDRB1_0309 1
VIR08817031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]442WQGDYPSMIDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR08817431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]446YPSMIGFLADRB1_0101, DRB5_0101, DRB5_0105 3
VIR08817731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]449MIGFLAPLFDRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3
VIR08817831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]450IGFLAPLFTDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 11
VIR08818131794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]453LAPLFTAGADRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311 13
VIR08819431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]466VGYINPEFDDRB1_0410 1
VIR08822031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]492LVNDAQRILDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR08822731794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]499ILFHDMPVVDRB1_1501, DRB1_1506 2
VIR08822831794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]500LFHDMPVVPDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR08822931794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]501FHDMPVVPLDRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0701, DRB1_0703 4
VIR08823431794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]506VVPLWDYISDRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 6
VIR08823531794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]507VPLWDYISVDRB1_1506 1
VIR08824031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]512YISVVGWSSDRB1_0101, DRB1_1101, DRB5_0101, DRB5_0105 4
VIR08824331794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]515VVGWSSQVSDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 21
VIR08825031794836 NP 857329.1 periplasmicdipeptide-bindinglipoproteinDppA[MycobacteriumbovisAF2122/97]522VSNVTVTWNDRB1_0410 1
VIR08826231794841 NP 857334.1 membrane-associatedserineprotease[MycobacteriumbovisAF2122/97]1MTPSQWLDIDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR08826731794841 NP 857334.1 membrane-associatedserineprotease[MycobacteriumbovisAF2122/97]6WLDIAVLAVDRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 9
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VIR08842131794841 NP 857334.1 membrane-associatedserineprotease[MycobacteriumbovisAF2122/97]160LSALLNTSGDRB1_0410 1
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VIR08843731794841 NP 857334.1 membrane-associatedserineprotease[MycobacteriumbovisAF2122/97]176FSRTPVIPVDRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101 4
VIR08845231794841 NP 857334.1 membrane-associatedserineprotease[MycobacteriumbovisAF2122/97]191LVNNPVVAADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 41
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VIR09125331794997 NP 857490.1 integralmembranetransportprotein[MycobacteriumbovisAF2122/97]1044WWPLGRRRGDRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 8
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VIR09245531795051 NP 857544.1 transmembraneprotein[MycobacteriumbovisAF2122/97]27ILTGRRMTDDRB1_0301 1
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