Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1356077392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]95VFSIIDGQK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.39
VIR1356078392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]96FSIIDGQKV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.39
VIR1356088392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]106VTIHEIDDQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 13 0.28
VIR1356103392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]121IAQRECAIE DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.28
VIR1356110392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]128IESWDSSGS DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 4 0.28
VIR1356120392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]138YARLMDIER DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.37
VIR1356126392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]144IERELVLEH DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1304 5 0.28
VIR1356130392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]148LVLEHFDAI DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.28
VIR1356154392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]172LNLKKDFEQ DRB1_0402 1 0.28
VIR1356160392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]178FEQLRRLDL DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1502 7 0.29
VIR1356168392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]186LNERGTFGH DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.27
VIR1356174392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]192FGHFLNRLR DRB1_0402, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.30
VIR1356178392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]196LNRLRALTH DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 34 0.23
VIR1356189392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]207FRNAWFVDA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0426 5 0.28
VIR1356193392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]211WFVDASGRK DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 5 0.31
VIR1356194392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]212FVDASGRKV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.32
VIR1356202392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]220VFVRVVLEP DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 16 0.29
VIR1356203392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]221FVRVVLEPE DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1321 5 0.29
VIR1356204392388011 YP 005309640.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]222VRVVLEPEK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.41
VIR1356222392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]14FGGSVTALR DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.23
VIR1356229392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]21LRLTEKGYR DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.28
VIR1356236392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]28YRVGVLEAG DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.32
VIR1356238392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]30VGVLEAGRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.42
VIR1356240392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]32VLEAGRRFS DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.38
VIR1356259392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]51LRKFLWAPR DRB1_1506 1 0.28
VIR1356262392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]54FLWAPRLGC DRB1_0305, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 17 0.28
VIR1356264392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]56WAPRLGCYG DRB1_0801 1 0.27
VIR1356268392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]60LGCYGIQRI DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.25
VIR1356271392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]63YGIQRIHPL DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.28
VIR1356273392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]65IQRIHPLRN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 24 0.28
VIR1356276392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]68IHPLRNVMI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1501, DRB1_1506 12 0.28
VIR1356279392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]71LRNVMILAG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 40 0.27
VIR1356282392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]74VMILAGAGV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 15 0.28
VIR1356308392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]100FFADQQWSH DRB1_0305 1 0.24
VIR1356320392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]112WRGELMPHY DRB1_0421 1 0.28
VIR1356324392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]116LMPHYQQAQ DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 7 0.28
VIR1356357392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]149MGFGDTWVP DRB1_0402 1 0.22
VIR1356363392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]155WVPTPVGVF DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 16 0.23
VIR1356368392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]160VGVFFGPDG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.22
VIR1356389392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]181FGGAGPART DRB1_0101 1 0.23
VIR1356418392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]210VKNYLGLAE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.23
VIR1356422392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]214LGLAESAGA DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 6 0.29
VIR1356432392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]224VIPMTTVKG DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 21 0.26
VIR1356433392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]225IPMTTVKGF DRB1_0703 1 0.29
VIR1356435392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]227MTTVKGFER DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.30
VIR1356438392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]230VKGFERRSD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14 0.30
VIR1356449392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]241WEVRTVRTG DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.22
VIR1356459392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]251WLRRDRRTF DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 19 0.25
VIR1356472392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]264LVLAAGTWG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.28
VIR1356473392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]265VLAAGTWGT DRB1_0402 1 0.28
VIR1356479392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]271WGTQHLLFK DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323 3 0.28
VIR1356484392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]276LLFKMRDRG DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 4 0.28
VIR1356485392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]277LFKMRDRGR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1356486392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]278FKMRDRGRL DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB1_1506 16 0.28
VIR1356488392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]280MRDRGRLPG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 11 0.37
VIR1356504392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]296LTRTNSESI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.21
VIR1356512392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]304IVGAATLKV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 46 0.41
VIR1356518392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]310LKVNPDLDL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.34
VIR1356530392388016 YP 005309645.1 choD[MycobacteriumtuberculosisUT205]322VAITSSIHP DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.26
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