Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1346014392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]396YSRGPLMVS DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.29
VIR1346019392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]401LMVSDTFDH DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 21 0.30
VIR1346025392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]407FDHTSQLKL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.29
VIR1346031392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]413LKLIRARFG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.40
VIR1346034392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]416IRARFGVPV DRB1_0102, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.37
VIR1346048392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]430WRDGVVGDM DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.27
VIR1346052392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]434VVGDMTSAF DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 16 0.31
VIR1346053392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]435VGDMTSAFN DRB1_0410 1 0.27
VIR1346078392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]460LGALPKLPQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 25 0.22
VIR1346103392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]485IPYRVPYPQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 7 0.28
VIR1346105392386997 YP 005308626.1 plcA[MycobacteriumtuberculosisUT205]487YRVPYPQVM DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.28
VIR1346123392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]1MVHATACSE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 6 0.29
VIR1346124392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]2VHATACSEI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR1346162392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]40IRMMSLVGR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 46 0.26
VIR1346164392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]42MMSLVGRWR DRB1_0102, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR1346165392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]43MSLVGRWRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR1346167392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]45LVGRWRRKG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.27
VIR1346168392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]46VGRWRRKGI DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.28
VIR1346171392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]49WRRKGIAVD DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.21
VIR1346176392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]54IAVDFATLA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.33
VIR1346180392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]58FATLAATPT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.26
VIR1346183392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]61LAATPTIEA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0426 3 0.58
VIR1346189392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]67IEAWSQLVS DRB1_0402 1 0.29
VIR1346232392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]110WVGRHDHQQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 5 0.28
VIR1346233392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]111VGRHDHQQL DRB1_0703 1 0.28
VIR1346249392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]127YVEFDGARV DRB1_0101, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.31
VIR1346269392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]147LALRHPMLR DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.28
VIR1346271392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]149LRHPMLRVQ DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 7 0.28
VIR1346275392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]153MLRVQFLPD DRB1_1321 1 0.29
VIR1346276392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]154LRVQFLPDG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.34
VIR1346280392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]158FLPDGTQRI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 14 0.21
VIR1346347392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]225LHVDLDMQA DRB1_1107 1 0.28
VIR1346359392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]237MSYRILLAD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.28
VIR1346361392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]239YRILLADLA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 28 0.26
VIR1346364392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]242LLADLAALY DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.21
VIR1346382392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]260YTYREYRQA DRB1_0802 1 0.28
VIR1346384392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]262YREYRQAIE DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817 4 0.28
VIR1346387392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]265YRQAIEAEE DRB1_0801 1 0.33
VIR1346391392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]269IEAEETLPQ DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 4 0.23
VIR1346450392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]328LFARARARG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.29
VIR1346451392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]329FARARARGI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.29
VIR1346469392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]347FANVLARWS DRB1_0101, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.24
VIR1346472392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]350VLARWSASS DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 10 0.21
VIR1346501392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]379LVGDFTSSL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 16 0.27
VIR1346515392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]393LTGARTAAA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.46
VIR1346574392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]452FCPDVTEQF DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.48
VIR1346587392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]465WIISQGPQV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502 7 0.43
VIR1346588392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]466IISQGPQVL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.44
VIR1346609392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]487LVNWDVREG DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.28
VIR1346610392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]488VNWDVREGV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
VIR1346635392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]513LLRLAAGDD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.24
VIR1346700392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]578LSYAQLRDQ DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 6 0.26
VIR1346716392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]594LRAAGLRVG DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.28
VIR1346721392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]599LRVGDTVAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 16 0.32
VIR1346751392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]629YLPIGVDQP DRB1_0421 1 0.21
VIR1346772392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]650VNLALVCGP DRB1_0804, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1327, DRB1_1328 5 0.22
VIR1346774392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]652LALVCGPPC DRB1_0102 1 0.28
VIR1346776392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]654LVCGPPCQV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 9 0.28
VIR1346832392387024 YP 005308653.1 mbtB[MycobacteriumtuberculosisUT205]710VAHDAAMNT DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.26
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