Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1336437392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]479FGSDFQPQE DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.32
VIR1336463392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]505VGAEPTAIS DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 5 0.72
VIR1336496392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]538FNASGTPFV DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0703 6 0.33
VIR1336503392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]545FVWDGSMVV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 18 0.28
VIR1336509392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]551MVVNYQDPS DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.24
VIR1336510392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]552VVNYQDPSW DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.26
VIR1336511392386416 YP 005308045.1 pknE[MycobacteriumtuberculosisUT205]553VNYQDPSWL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.26
VIR1336561392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]45VMTDPLLKV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1506 9 0.28
VIR1336566392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]50LLKVVNSRL DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 7 0.25
VIR1336567392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]51LKVVNSRLR DRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.28
VIR1336569392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]53VVNSRLREL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.25
VIR1336590392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]74WALCLVDGA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.28
VIR1336592392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]76LCLVDGAPL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR1336594392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]78LVDGAPLRA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.29
VIR1336611392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]95VYDGDRLWI DRB1_1506 1 0.22
VIR1336617392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]101LWIRFIADT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.28
VIR1336618392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]102WIRFIADTE DRB1_0405 1 0.29
VIR1336619392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]103IRFIADTER DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.31
VIR1336632392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]116IEHISTAVA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311 12 0.48
VIR1336643392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]127LSKRFARID DRB1_0806 1 0.30
VIR1336647392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]131FARIDPIVA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.29
VIR1336653392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]137IVAVQVGAS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 27 0.29
VIR1336656392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]140VQVGASMVA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 10 0.30
VIR1336673392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]157VLGWWRWHH DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.28
VIR1336677392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]161WRWHHNTWL DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.28
VIR1336698392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]182LAVAMLLLM DRB1_1128, DRB1_1305 2 0.27
VIR1336700392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]184VAMLLLMRA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 24 0.27
VIR1336702392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]186MLLLMRAKT DRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 22 0.26
VIR1336703392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]187LLLMRAKTD DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 8 0.26
VIR1336719392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]203IMLMSAIMP DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.28
VIR1336720392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]204MLMSAIMPV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28 0.27
VIR1336722392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]206MSAIMPVTV DRB1_0102 1 0.26
VIR1336725392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]209IMPVTVAAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 19 0.27
VIR1336773392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]257IVIIGALTM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 51 0.28
VIR1336774392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]258VIIGALTML DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 8 0.26
VIR1336775392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]259IIGALTMLA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322 28 0.21
VIR1336776392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]260IGALTMLAA DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.22
VIR1336779392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]263LTMLAALAR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.25
VIR1336781392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]265MLAALARMV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402 3 0.24
VIR1336782392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]266LAALARMVA DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1506 10 0.20
VIR1336785392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]269LARMVAATS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 23 0.24
VIR1336803392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]287LICVVAYHA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.28
VIR1336806392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]290VVAYHAAPA DRB1_0102, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 16 0.26
VIR1336809392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]293YHAAPALSR DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.27
VIR1336824392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]308LPVFPSATS DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.28
VIR1336826392386453 YP 005308082.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisUT205]310VFPSATSRW DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 5 0.35
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