Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1324812392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]100LRALLKQYG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 31 0.28
VIR1324816392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]104LKQYGPLTP DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.32
VIR1324819392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]107YGPLTPARA DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 14 0.40
VIR1324822392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]110LTPARAVAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.45
VIR1324846392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]134VTHRDVKPE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 4 0.99
VIR1324856392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]144ILVTASDFA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.28
VIR1324865392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]153YLVDFGIAR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.28
VIR1324866392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]154LVDFGIARA DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.28
VIR1324869392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]157FGIARAASD DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1321 4 0.28
VIR1324887392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]175VGTYNYMAP DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.29
VIR1324890392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]178YNYMAPERF DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR1324898392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]186FTGDEVTYR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421 4 0.28
VIR1324905392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]193YRADIYALA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 9 0.25
VIR1324909392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]197IYALACVLG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR1324910392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]198YALACVLGE DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1321 11 0.29
VIR1324926392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]214YRADSVERL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 13 0.36
VIR1324949392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]237LRPGRVPPA DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 9 0.28
VIR1324961392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]249VIAKGMAKN DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.23
VIR1325092392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]380WAVVGAAAI DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.29
VIR1325094392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]382VVGAAAIVL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.39
VIR1325102392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]390LVAIVAAAG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0806, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.22
VIR1325105392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]393IVAAAGYLV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.21
VIR1325111392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]399YLVLRPSWS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.26
VIR1325112392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]400LVLRPSWSP DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 20 0.26
VIR1325114392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]402LRPSWSPTQ DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322 25 0.22
VIR1325128392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]416VLPFTGIDF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.32
VIR1325152392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]440YVTSEGMYG DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 9 0.52
VIR1325158392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]446MYGRVVKLA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 12 0.39
VIR1325159392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]447YGRVVKLAT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 12 0.40
VIR1325162392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]450VVKLATGST DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 14 0.99
VIR1325163392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]451VKLATGSTG DRB1_0102 1 0.99
VIR1325195392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]483YVTDFNNRV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1502 13 0.28
VIR1325199392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]487FNNRVVTLA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1323 7 0.32
VIR1325245392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]533VVKLAAGSK DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.27
VIR1325246392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]534VKLAAGSKT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR1325278392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]566YVTDTDNNR DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.27
VIR1325287392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]575VVKLEAESN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0410 4 0.37
VIR1325290392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]578LEAESNNQV DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.36
VIR1325329392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]617VVKLLAGST DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.21
VIR1325330392385641 YP 005307270.1 pknD[MycobacteriumtuberculosisUT205]618VKLLAGSTT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1506 3 0.21
VIR1325369392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]1MKIRLHTLL DRB1_0703, DRB1_0806, DRB1_0813 3 0.28
VIR1325371392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]3IRLHTLLAV DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 37 0.26
VIR1325373392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]5LHTLLAVLT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.24
VIR1325387392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]19LAAAGCGSK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR1325421392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]53LAETGSTLL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.29
VIR1325429392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]61LYPLFNLWG DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 18 0.28
VIR1325432392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]64LFNLWGPAF DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR1325433392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]65FNLWGPAFH DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 19 0.28
VIR1325440392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]72FHERYPNVT DRB1_0813 1 0.25
VIR1325476392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]108YLSEGDMAA DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.27
VIR1325488392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]120LMNIALAIS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322 26 0.29
VIR1325491392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]123IALAISAQQ DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 7 0.29
VIR1325500392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]132VNYNLPGVS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 11 0.45
VIR1325541392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]173VNLPGTAVV DRB1_0423 1 0.37
VIR1325561392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]193FLFTQYLSK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.36
VIR1325563392385644 YP 005307273.1 pstS1[MycobacteriumtuberculosisUT205]195FTQYLSKQD DRB1_0801, DRB1_0817 2 0.30
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VIR1333795392386332 YP 005307961.1 pks10[MycobacteriumtuberculosisUT205]300LTWRSLGEI DRB1_0804 1 0.28
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