Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1314990392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]324FPISEIIAQ DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1321 9 0.34
VIR1315008392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]342WGIFLRNHD DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB1_1506 12 0.28
VIR1315012392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]346LRNHDELTL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.27
VIR1315035392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]369YAKDPRMKA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.30
VIR1315062392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]396IELFTALLL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 10 0.24
VIR1315079392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]413YYGDEIGMG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.31
VIR1315084392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]418IGMGDVIWL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 14 0.28
VIR1315100392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]434IPMQWTPDR DRB1_0421 1 0.28
VIR1315104392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]438WTPDRNAGF DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.26
VIR1315129392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]463VYGYQAVNV DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.38
VIR1315130392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]464YGYQAVNVE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.36
VIR1315132392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]466YQAVNVEAQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1321 13 0.23
VIR1315194392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]528VLCVNNLSR DRB1_0404, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.22
VIR1315197392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]531VNNLSRFPQ DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.49
VIR1315220392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]554VELTGHVEF DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
VIR1315245392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]579FYWFQLTTH DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0813 3 0.23
VIR1315246392384846 YP 005306475.1 treS[MycobacteriumtuberculosisUT205]580YWFQLTTHE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.22
VIR1315320392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]61VARRGPGRV DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.39
VIR1315334392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]75VHLLPFPDL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.26
VIR1315357392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]98FKRLLTNDG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 25 0.27
VIR1315389392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]130YRQFPTRNG DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 30 0.30
VIR1315402392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]143LHRVVTLLA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 30 0.21
VIR1315420392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]161FAGKDRTGF DRB1_0813 1 0.36
VIR1315428392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]169FVVALVLEA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB1_1506 48 0.27
VIR1315429392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]170VVALVLEAV DRB1_0102 1 0.20
VIR1315455392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]196VPQLRARIS DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3 0.33
VIR1315458392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]199LRARISEMI DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0813 5 0.29
VIR1315478392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]219VVTFTKARL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 28 0.40
VIR1315479392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]220VTFTKARLS DRB1_0402 1 0.39
VIR1315497392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]238YLAAARQTI DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 7 0.24
VIR1315515392384873 YP 005306502.1 ptbB[MycobacteriumtuberculosisUT205]256YLRDAGISQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 9 0.30
VIR1315555392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]28WVNQLERHA DRB1_0101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323 8 0.80
VIR1315556392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]29VNQLERHAM DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.28
VIR1315565392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]38MQPDAPALR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.28
VIR1315572392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]45LRFVGNTMT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1501, DRB1_1506 10 0.28
VIR1315574392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]47FVGNTMTWA DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0426 3 0.28
VIR1315575392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]48VGNTMTWAD DRB1_0402 1 0.28
VIR1315581392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]54WADLRRRVA DRB1_1114, DRB1_1323 2 0.28
VIR1315584392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]57LRRRVAALA DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 25 0.29
VIR1315600392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]73VGFGDRVMI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 10 0.28
VIR1315606392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]79VMILMLNRT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 19 0.26
VIR1315607392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]80MILMLNRTE DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 19 0.25
VIR1315608392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]81ILMLNRTEF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 27 0.27
VIR1315609392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]82LMLNRTEFV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.99
VIR1315610392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]83MLNRTEFVE DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.99
VIR1315625392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]98MIGAIAVPL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.22
VIR1315635392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]108FRLTPTEIA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 22 0.27
VIR1315644392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]117VLVEDCVAH DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0426 3 0.25
VIR1315645392384886 YP 005306515.1 fadD5[MycobacteriumtuberculosisUT205]118LVEDCVAHV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_1107 10 0.26
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