Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1305350386005268 YP 005923547.1 membrane-associatedphospholipaseC2PLCB[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]438VGDMTSTFN DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.27
VIR1305375386005268 YP 005923547.1 membrane-associatedphospholipaseC2PLCB[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]463LNALPKLPQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 29 0.24
VIR1305389386005268 YP 005923547.1 membrane-associatedphospholipaseC2PLCB[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]477VLGTVTKTA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.23
VIR1305398386005268 YP 005923547.1 membrane-associatedphospholipaseC2PLCB[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]486IPYRVPFPQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 11 0.29
VIR1305400386005268 YP 005923547.1 membrane-associatedphospholipaseC2PLCB[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]488YRVPFPQSM DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.34
VIR1305434386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]18FLMDWAAPV DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 12 0.28
VIR1305447386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]31YGAGPCPGH DRB1_0305 1 0.30
VIR1305459386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]43IEHIVLLMQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 10 0.28
VIR1305462386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]46IVLLMQENR DRB1_0301, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR1305463386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]47VLLMQENRS DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.28
VIR1305464386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]48LLMQENRSF DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.28
VIR1305485386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]69FNAASPAFQ DRB1_0305, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 10 0.20
VIR1305492386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]76FQQMGWNPM DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421 3 0.28
VIR1305535386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]119WVGMHLAWN DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 20 0.27
VIR1305536386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]120VGMHLAWNG DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.22
VIR1305538386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]122MHLAWNGGA DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.23
VIR1305551386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]135LPAQATTRA DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.63
VIR1305567386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]151MGYYTRQDI DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.99
VIR1305570386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]154YTRQDIPIH DRB1_0305, DRB1_1114, DRB1_1321, DRB1_1323 4 0.27
VIR1305575386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]159IPIHYLLAD DRB1_1304 1 0.28
VIR1305585386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]169FTICDGYHC DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.28
VIR1305604386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]188LYWLSANID DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.29
VIR1305605386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]189YWLSANIDP DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.26
VIR1305630386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]214LQQFSWRIM DRB1_0402, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.26
VIR1305635386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]219WRIMPENLE DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 17 0.28
VIR1305649386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]233WKVYQNKGL DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.99
VIR1305652386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]236YQNKGLGRF DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1302 8 0.39
VIR1305657386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]241LGRFINTPI DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 12 0.29
VIR1305697386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]281FAADVRANR DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.45
VIR1305701386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]285VRANRLPKV DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.28
VIR1305709386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]293VSWLVPNIL DRB1_0102 1 0.26
VIR1305711386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]295WLVPNILQS DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 14 0.24
VIR1305731386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]315VSMVTALRI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.22
VIR1305733386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]317MVTALRILL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 25 0.24
VIR1305734386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]318VTALRILLS DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 21 0.23
VIR1305737386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]321LRILLSNPA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 48 0.28
VIR1305753386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]337IVSYDENGG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.30
VIR1305754386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]338VSYDENGGF DRB1_0301 1 0.29
VIR1305779386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]363FVTVPNIDA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 25 0.29
VIR1305794386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]378IRGPLGLGF DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.22
VIR1305798386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]382LGLGFRVPC DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.28
VIR1305800386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]384LGFRVPCIV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 5 0.28
VIR1305802386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]386FRVPCIVIS DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 21 0.28
VIR1305807386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]391IVISPYSRG DRB1_0301, DRB1_1506 2 0.36
VIR1305809386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]393ISPYSRGPL DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.41
VIR1305812386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]396YSRGPLMVS DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.29
VIR1305817386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]401LMVSDTFDH DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 21 0.30
VIR1305823386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]407FDHTSQLKL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.29
VIR1305829386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]413LKLIRARFG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.40
VIR1305832386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]416IRARFGVPV DRB1_0102, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.37
VIR1305846386005269 YP 005923548.1 membrane-associatedphospholipaseC1plcA[MycobacteriumtuberculosisRGTB423]430WRDGVVGDM DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.27
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VIR1307147386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube190VVVEGVELV DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 8 0.28
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VIR1307169386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube212LNSYPGWIQ DRB1_0804, DRB1_0806 2 0.25
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VIR1307176386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube219IQPFVAHQP DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.29
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VIR1307189386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube232IAAMRGFAM DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.28
VIR1307192386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube235MRGFAMGGP DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.26
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VIR1307206386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube249IGMLVWTAG DRB1_0410 1 0.26
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VIR1307221386005801 YP 005924080.1 daunorubicin-DIM-transportintegralmembraneproteinABCtransporterDRRC[Mycobacteriumtube264VPLAIGYRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
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