Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1285042383308691 YP 005361502.1 putativepolyketidesynthase[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]406VQAMRHGVM DRB1_0804, DRB1_0806 2 0.24
VIR1285093383308691 YP 005361502.1 putativepolyketidesynthase[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]457FGISGTNAH DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 26 0.31
VIR1285095383308691 YP 005361502.1 putativepolyketidesynthase[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]459ISGTNAHLI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR1285126383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]1MELGSLIRA DRB1_1107 1 0.25
VIR1285131383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]6LIRATNLWG DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.28
VIR1285132383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]7IRATNLWGY DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR1285137383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]12LWGYTDLMR DRB1_1506 1 0.28
VIR1285138383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]13WGYTDLMRE DRB1_0817, DRB1_1321 2 0.28
VIR1285147383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]22LGADPLPFL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.36
VIR1285155383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]30LRRFDIPPG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33 0.24
VIR1285171383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]46FMSLAGFVR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.25
VIR1285174383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]49LAGFVRMLE DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.28
VIR1285177383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]52FVRMLEASA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 20 0.29
VIR1285178383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]53VRMLEASAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 48 0.28
VIR1285193383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]68FGLRLARWQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323 16 0.28
VIR1285195383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]70LRLARWQGL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.28
VIR1285197383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]72LARWQGLGI DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR1285206383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]81LGPVAVIAR DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.25
VIR1285209383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]84VAVIARNAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.32
VIR1285211383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]86VIARNAATL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.35
VIR1285220383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]95FGGLEAIGR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.29
VIR1285226383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]101IGRYLYVHS DRB1_0804, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.26
VIR1285229383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]104YLYVHSPAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.26
VIR1285230383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]105LYVHSPALT DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.26
VIR1285231383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]106YVHSPALTL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.25
VIR1285252383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]127FGYEVTEPG DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.31
VIR1285265383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]140LQGYELSMA DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.25
VIR1285268383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]143YELSMANAA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0703 6 0.22
VIR1285270383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]145LSMANAARM DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.68
VIR1285272383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]147MANAARMIR DRB1_0301, DRB1_1128, DRB1_1305 3 0.41
VIR1285278383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]153MIRLLGGPQ DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.21
VIR1285305383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]180YREALGCTV DRB1_0101 1 0.28
VIR1285309383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]184LGCTVRFGR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR1285313383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]188VRFGRTWCG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.26
VIR1285322383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]197FEVDHRLAG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
VIR1285385383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]260LDMHPRTLQ DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 4 0.24
VIR1285401383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]276LRCHDLIER DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 16 0.28
VIR1285406383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]281LIERERRAQ DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 11 0.29
VIR1285433383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]308LGYSEQSAL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.22
VIR1285441383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]316LNRSCRRWF DRB1_0301, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.28
VIR1285448383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]323WFGMTPRQY DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.36
VIR1285449383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]324FGMTPRQYR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.33
VIR1285456383308824 YP 005361635.1 AraCfamilytranscriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]331YRAYGGVSG DRB1_0101, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 10 0.22
VIR1285470383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]13LQPEPSEET DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.34
VIR1285486383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]29FERDAIPLL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.28
VIR1285491383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]34IPLLDQLYG DRB1_1128, DRB1_1305 2 0.21
VIR1285498383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]41YGGALRMTR DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.20
VIR1285502383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]45LRMTRNPAD DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1321 6 0.23
VIR1285519383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]62MVKAYAGFR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.21
VIR1285520383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]63VKAYAGFRS DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 10 0.22
VIR1285535383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]78LKAWLYRIL DRB1_0402 1 0.28
VIR1285538383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]81WLYRILTNT DRB1_0813 1 0.28
VIR1285539383308965 YP 005361776.1 RNApolymerasesigmafactorRpoE[MycobacteriumtuberculosisRGTB327]82LYRILTNTY DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.27
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VIR1294906386003840 YP 005922119.1 phosphate-transportsystemtranscriptionalregulatoryproteinPHOY2[Mycobacteriumtuberculos80IVSAIQMVA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1506 20 0.28
VIR1294910386003840 YP 005922119.1 phosphate-transportsystemtranscriptionalregulatoryproteinPHOY2[Mycobacteriumtuberculos84IQMVADIDR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
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