Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1253771313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]262IVNQSAITG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.54
VIR1253788313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]279VGTRVHAGS DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 5 0.23
VIR1253792313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]283VHAGSVVVR DRB1_0301 1 0.23
VIR1253797313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]288VVVRGRVVV DRB1_0301, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 22 0.48
VIR1253798313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]289VVRGRVVVR DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.47
VIR1253799313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]290VRGRVVVRA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 29 0.51
VIR1253803313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]294VVVRAHAVG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.31
VIR1253804313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]295VVRAHAVGN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1304 5 0.28
VIR1253805313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]296VRAHAVGNQ DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 31 0.24
VIR1253810313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]301VGNQTTIGR DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 6 0.27
VIR1253816313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]307IGRIISRVE DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1304 4 0.29
VIR1253840313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]331FSRRFVPTS DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 13 0.31
VIR1253844313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]335FVPTSFIVS DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.30
VIR1253862313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]353VRRAMTMLL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 51 0.27
VIR1253866313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]357MTMLLIACP DRB1_1307 1 0.28
VIR1253868313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]359MLLIACPCA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 12 0.28
VIR1253869313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]360LLIACPCAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 32 0.28
VIR1253877313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]368VGLSTPTAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 10 0.60
VIR1253897313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]388ILIKGGSHL DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1506 5 0.26
VIR1253899313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]390IKGGSHLEQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.28
VIR1253914313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]405IVFDKTGTL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.22
VIR1253916313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]407FDKTGTLTV DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.21
VIR1253928313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]419VVTNIVAMH DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 37 0.20
VIR1253929313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]420VTNIVAMHK DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.21
VIR1253932313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]423IVAMHKDWE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304 3 0.27
VIR1253935313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]426MHKDWEPEQ DRB1_0305, DRB1_1107 2 0.99
VIR1253939313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]430WEPEQVLAY DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.31
VIR1253953313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]444IHSRHPLAE DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 6 0.37
VIR1253964313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]455IRSTEERRI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.36
VIR1253983313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]474LVGLGMRTW DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 4 0.26
VIR1253984313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]475VGLGMRTWA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.28
VIR1253986313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]477LGMRTWADG DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.28
VIR1253997313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]488LLLGSPSLL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301 3 0.26
VIR1253998313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]489LLGSPSLLR DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.27
VIR1254004313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]495LLRAEKVRV DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 16 0.32
VIR1254005313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]496LRAEKVRVS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.39
VIR1254010313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]501VRVSKKASE DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 19 0.47
VIR1254023313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]514LRRQAETPL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.24
VIR1254039313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]530LVGLISLRD DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 23 0.24
VIR1254040313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]531VGLISLRDE DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 3 0.36
VIR1254049313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]540VRPEAAQVL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 7 0.23
VIR1254060313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]551LRANGIRRI DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.24
VIR1254065313660253 ZP 07817133.1 metalcation-transportingP-typeATPaseCCtpC[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]556IRRIVMLTG DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.24
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VIR1258794313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu76LYSQRRFEV DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.28
VIR1258811313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu93MKLAIVSIE DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 9 0.46
VIR1258813313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu95LAIVSIEDK DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.30
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VIR1258858313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu140YVKNYQLLV DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 17 0.22
VIR1258859313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu141VKNYQLLVT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 9 0.22
VIR1258878313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu160VETTPARKL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.53
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VIR1258911313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu193LVSFGNNSF DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 18 0.25
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VIR1259474313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu756VTIQISNGI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 19 0.31
VIR1259476313660684 ZP 07817564.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu758IQISNGIPP DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.25
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VIR1259572313660769 ZP 07817649.1 19kDalipoproteinantigenprecursorlpqH[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]52VVIDGKDQN DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1304 9 0.27
VIR1259650313660769 ZP 07817649.1 19kDalipoproteinantigenprecursorlpqH[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]130YKITGTATG DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 21 0.39
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