Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1233583313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1486LTAFYGLSV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.21
VIR1233602313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1505LVHAGTGGV DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 12 0.27
VIR1233617313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1520LARYWGAEV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR1233625313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1528VFVTASRAK DRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.31
VIR1233626313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1529FVTASRAKW DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.29
VIR1233640313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1543MGFDDIHIS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.28
VIR1233645313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1548IHISDSRSL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.38
VIR1233653313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1556LEFEEAFLR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1233671313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1574VLNSLAGEF DRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.32
VIR1233672313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1575LNSLAGEFT DRB1_0102 1 0.35
VIR1233675313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1578LAGEFTDAS DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.29
VIR1233684313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1587LRLLPSGGR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.25
VIR1233686313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1589LLPSGGRFI DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.20
VIR1233693313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1596FIELGKTDI DRB1_0813 1 0.28
VIR1233716313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1619YRAFDLVEA DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 21 0.23
VIR1233739313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1642LLAAGVLAR DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.31
VIR1233744313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1647VLARLPVKT DRB1_0806 1 0.31
VIR1233745313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1648LARLPVKTF DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.29
VIR1233750313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1653VKTFDARCA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14 0.28
VIR1233762313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1665YRFVSQARH DRB1_0305, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 21 0.28
VIR1233764313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1667FVSQARHIG DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.29
VIR1233793313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1696VVVTGGTGM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR1233794313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1697VVTGGTGMA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
VIR1233806313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1709VATHLVRRH DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.25
VIR1233819313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1722LVLVSRSGE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_1304, DRB1_1321 15 0.28
VIR1233838313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1741LLREGGAQV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR1233848313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1751VVSCDVADR DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 34 0.34
VIR1233870313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1773YPLKGVFHA DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323 12 0.22
VIR1233890313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1793LTPDRVDTV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.46
VIR1233907313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1810WNLHELTED DRB1_1304 1 0.24
VIR1233918313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1821LSAFVVFSS DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 15 0.45
VIR1233921313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1824FVVFSSMAG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 39 0.33
VIR1233930313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1833IVGTPAQGN DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.65
VIR1233949313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1852LVAYRRSRG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 13 0.21
VIR1233950313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1853VAYRRSRGL DRB1_0402, DRB1_0806 2 0.36
VIR1233952313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1855YRRSRGLAG DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.30
VIR1233958313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1861LAGLSVAWG DRB1_0806 1 0.29
VIR1233965313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1868WGLWEQASA DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 5 0.28
VIR1233968313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1871WEQASAMTR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR1233978313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1881LGERDRARM DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.45
VIR1234013313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1916VVVAARLDR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 36 0.99
VIR1234056313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1959MSGLVSRLH DRB1_0402, DRB1_1304 2 0.25
VIR1234078313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1981LVISNAAAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 40 0.26
VIR1234079313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]1982VISNAAAVL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.40
VIR1234109313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]2012LTAVELRNR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR1234112313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]2015VELRNRLKT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 8 0.29
VIR1234114313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]2017LRNRLKTAT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.29
VIR1234118313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]2021LKTATGLTL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.25
VIR1234183313658533 ZP 07815413.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]2086VKAHLRTRL DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.23
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VIR1239134313658869 ZP 07815749.1 permease[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]389VPIALIALA DRB1_0804, DRB1_1307 2 0.27
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