Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1222574313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]118VNVIDQIHV DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 6 0.29
VIR1222580313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]124IHVDPVVRS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 12 0.31
VIR1222585313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]129VVRSLDFSS DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1506 3 0.34
VIR1222586313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]130VRSLDFSSA DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.34
VIR1222611313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]155VERDTVTLT DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.23
VIR1222616313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]160VTLTGTAPS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1307 9 0.23
VIR1222631313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]175VKRAATSTW DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 7 0.99
VIR1222642313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]186MKIVNNIEV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.30
VIR1222645313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]189VNNIEVTGQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311, DRB1_1321 20 0.43
VIR1222671313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]215INAVTGGPI DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.23
VIR1222693313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]237YEILNRVAD DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 10 0.28
VIR1222696313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]240LNRVADKLK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.31
VIR1222740313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]284YLVARGVAG DRB1_0101 1 0.26
VIR1222741313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]285LVARGVAGD DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 15 0.25
VIR1222746313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]290VAGDHIATV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.31
VIR1222754313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]298VGLGSVNPI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 11 0.31
VIR1222756313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]300LGSVNPIAS DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.29
VIR1222759313657730 ZP 07814610.1 hypotheticalproteinMtubKV 04886[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]303VNPIASNAT DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 6 0.48
VIR1222788313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]14VKPVVFRPL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.31
VIR1222796313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]22LTLRRRIKN DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.26
VIR1222798313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]24LRRRIKNSV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 26 0.27
VIR1222811313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]37FFTSFVVAL DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703 7 0.30
VIR1222812313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]38FTSFVVALI DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 12 0.28
VIR1222815313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]41FVVALIPLV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 18 0.27
VIR1222816313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]42VVALIPLVW DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 32 0.25
VIR1222817313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]43VALIPLVWL DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.28
VIR1222820313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]46IPLVWLLWV DRB1_1506 1 0.27
VIR1222822313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]48LVWLLWVVI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1506 6 0.27
VIR1222827313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]53WVVIARGWF DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.30
VIR1222828313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]54VVIARGWFA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.33
VIR1222842313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]68WWTHSLRGV DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 4 0.23
VIR1222843313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]69WTHSLRGVL DRB1_0703 1 0.24
VIR1222880313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]106LGLMTAVYL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.21
VIR1222887313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]113YLVEYGTGR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.22
VIR1222888313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]114LVEYGTGRM DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 7 0.22
VIR1222896313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]122MSRVTTFTV DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.29
VIR1222907313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]133LAGVPSIVA DRB1_0423 1 0.25
VIR1222913313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]139IVAALFVFS DRB1_0402 1 0.28
VIR1222917313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]143LFVFSLWIA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 13 0.29
VIR1222918313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]144FVFSLWIAT DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502 5 0.29
VIR1222927313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]153LGFQQSAFA DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 10 0.30
VIR1222934313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]160FAVALALVL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.30
VIR1222955313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]181MLRLVPDEL DRB1_0102 1 0.26
VIR1222956313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]182LRLVPDELR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1222958313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]184LVPDELREA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 13 0.26
VIR1222968313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]194YALGVPKWK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1222972313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]198VPKWKTIVR DRB1_0402 1 0.28
VIR1222975313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]201WKTIVRIVA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.28
VIR1222978313657765 ZP 07814645.1 phosphateABCtransporter,innermembranesubunitPstA[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]204IVRIVAPIA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 30 0.39
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VIR1227768313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis371LSKLSRLPL DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.21
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VIR1227821313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis424VYLFVVDWR DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3 0.28
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VIR1227970313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis573LRTGLLAAR DRB1_0301, DRB1_0309 2 0.31
VIR1227982313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis585VTLDETELA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.41
VIR1227989313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis592LAVREHPRE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.27
VIR1228007313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis610VVFDHVTFG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 15 0.31
VIR1228008313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis611VFDHVTFGY DRB1_0402, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.30
VIR1228012313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis615VTFGYRPGV DRB1_0301, DRB1_1107 2 0.34
VIR1228014313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis617FGYRPGVPV DRB1_0802, DRB1_0813 2 0.33
VIR1228016313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis619YRPGVPVIQ DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 16 0.26
VIR1228039313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis642VGPSGSGKS DRB1_1107 1 0.25
VIR1228049313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis652LATLLARFH DRB1_1304 1 0.24
VIR1228071313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis674IRSLAADEL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.29
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VIR1228085313658222 ZP 07815102.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis688FVLQEAQLV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.24
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