Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1212425297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]21ISGDLKTQI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.39
VIR1212443297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]39LQGQWRGAA DRB1_1107 1 0.39
VIR1212447297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]43WRGAAGTAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.47
VIR1212459297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]55VVRFQEAAN DRB1_0806, DRB1_1304 2 0.25
VIR1212460297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]56VRFQEAANK DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 34 0.51
VIR1212462297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]58FQEAANKQK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.62
VIR1212480297733554 ZP 06962672.1 10kDaculturefiltrateantigenesxB[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]76IRQAGVQYS DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 41 0.38
VIR1212502297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]6WNFAGIEAA DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1323 5 0.94
VIR1212504297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]8FAGIEAAAS DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307 10 0.93
VIR1212514297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]18IQGNVTSIH DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1304 15 0.48
VIR1212518297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]22VTSIHSLLD DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3 0.41
VIR1212539297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]43WGGSGSEAY DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.28
VIR1212547297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]51YQGVQQKWD DRB1_1321 1 0.37
VIR1212565297733555 ZP 06962673.1 6kDaearlysecretoryantigenictargetesxA[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]69LQNLARTIS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 30 0.58
VIR1212589297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]6WSVLGVHRI DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 14 0.27
VIR1212591297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]8VLGVHRIFL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.26
VIR1212592297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]9LGVHRIFLI DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 17 0.25
VIR1212594297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]11VHRIFLITV DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.26
VIR1212607297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]24LTASPASAI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.32
VIR1212663297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]80LGVADAHKF DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.39
VIR1212679297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]96VAVIDTGVD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.30
VIR1212700297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]117FVDQAGNGL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.29
VIR1212732297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]149FVGVAPDAR DRB1_0309, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.32
VIR1212751297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]168FEPVGSQAN DRB1_0405 1 0.30
VIR1212772297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]189IRSLARAVV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 36 0.34
VIR1212775297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]192LARAVVHAA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4 0.22
VIR1212787297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]204VGVINISEA DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1107 4 0.50
VIR1212790297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]207INISEAACY DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0421 3 0.31
VIR1212798297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]215YKVSRPIDE DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1321 6 0.41
VIR1212815297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]232YAVNVKGVV DRB1_0309, DRB1_1307 2 0.35
VIR1212817297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]234VNVKGVVVV DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 18 0.36
VIR1212819297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]236VKGVVVVVA DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 17 0.32
VIR1212852297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]269WNNVQTVVT DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.23
VIR1212883297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]300FSMHGPWVD DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1323 5 0.26
VIR1212889297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]306WVDVAAPAE DRB1_1321 1 0.57
VIR1212919297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]336VPIAGTSFA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 8 0.43
VIR1212950297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]367IIHRITATA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 12 0.38
VIR1212951297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]368IHRITATAR DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.34
VIR1212968297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]385LVGAGVIDA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 42 0.28
VIR1212980297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]397LTWDIPPGP DRB1_0301, DRB1_1107 2 0.28
VIR1213028297733564 ZP 06962682.1 membrane-anchoredmycosinmycP1[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]445LGALARRAL DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.25
VIR1213074313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]43WFKHAVFYE DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 9 0.99
VIR1213075313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]44FKHAVFYEV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.99
VIR1213080313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]49FYEVLVRAF DRB1_1120, DRB1_1302 2 0.25
VIR1213081313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]50YEVLVRAFF DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 10 0.24
VIR1213099313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]68LRGLIDRLD DRB1_1304 1 0.23
VIR1213108313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]77YLQWLGIDC DRB1_1502 1 0.23
VIR1213111313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]80WLGIDCIWL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR1213112313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]81LGIDCIWLP DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
VIR1213134313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]103IRDFYKVLP DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3 0.35
VIR1213138313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]107YKVLPEFGT DRB1_0101 1 0.53
VIR1213150313656902 ZP 07813782.1 trehalosesynthase[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]119FVALVDAAH DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1307 5 0.26
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VIR1217039313657196 ZP 07814076.1 serine/threonine-proteinkinasepknG[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]297VSRINSFGY DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.28
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VIR1219787313657274 ZP 07814154.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZNV2475]222LMLGMRRFA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 15 0.26
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