Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1202261297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]33LVIRAAELM DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 28 0.28
VIR1202263297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]35IRAAELMGI DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 29 0.31
VIR1202273297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]45IPRFCDHPL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR1202292297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]64LVEVEGQRK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.99
VIR1202315297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]87VRTQLTSEI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 30 0.28
VIR1202331297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]103VMELLLINH DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1321 4 0.27
VIR1202379297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]151INISAQVLL DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.27
VIR1202386297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]158LLDRERCIL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.28
VIR1202394297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]166LCARCTRFS DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.28
VIR1202413297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]185MQERGALQQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 7 0.27
VIR1202424297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]196IYADEPFES DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.32
VIR1202433297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]205YFSGNTVQI DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.34
VIR1202439297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]211VQICPVGAL DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 21 0.22
VIR1202447297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]219LTGTAYRFR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.32
VIR1202452297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]224YRFRARPFD DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 17 0.33
VIR1202461297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]233LVSSPSVCE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1304 7 0.28
VIR1202486297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]258VLRRLAGDD DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 4 0.21
VIR1202523297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]295LIRDGGDPK DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.28
VIR1202539297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]311WSHAMAVAA DRB1_0101 1 0.21
VIR1202559297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]331VLVGGRVTW DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.28
VIR1202560297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]332LVGGRVTWE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.28
VIR1202561297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]333VGGRVTWED DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 5 0.28
VIR1202573297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]345YAKFARITL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 8 0.28
VIR1202586297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]358IDFRARPHS DRB1_0802, DRB1_0804 2 0.99
VIR1202588297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]360FRARPHSAE DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 5 0.21
VIR1202600297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]372FLAARIAGR DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307 5 0.28
VIR1202601297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]373LAARIAGRH DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.33
VIR1202617297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]389LESAPVVLL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.30
VIR1202622297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]394VVLLVGFEP DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.27
VIR1202625297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]397LVGFEPEDE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1304, DRB1_1321 4 0.28
VIR1202636297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]408IVFLRLRKA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 33 0.34
VIR1202637297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]409VFLRLRKAA DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 15 0.34
VIR1202638297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]410FLRLRKAAR DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 23 0.31
VIR1202639297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]411LRLRKAARR DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.29
VIR1202652297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]424VYTIAPFAT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.27
VIR1202663297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]435LHKMSGRLI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.21
VIR1202701297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]473IMVGERLAT DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 8 0.27
VIR1202714297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]486LSAAARLAD DRB1_1321 1 0.29
VIR1202760297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]532VARAQVCAA DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1322 5 0.28
VIR1202769297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]541WHIAELPAA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.31
VIR1202797297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]569LLVGGIEPA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.27
VIR1202799297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]571VGGIEPADF DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1202822297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]594FVVSLELRH DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1321 6 0.30
VIR1202823297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]595VVSLELRHS DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 31 0.37
VIR1202826297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]598LELRHSAVT DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 5 0.34
VIR1202839297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]611VVFPVAPTT DRB1_0102 1 0.29
VIR1202853297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]625FVNWEGRYR DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR1202856297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]628WEGRYRTFE DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817 3 0.28
VIR1202860297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]632YRTFEPALR DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 20 0.28
VIR1202908297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]680LGIWDGKHA DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4 0.28
VIR1202935297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]707ILTGWRMLL DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.27
VIR1202939297732791 ZP 06961909.1 NADHdehydrogenasesubunitG[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]711WRMLLDEGR DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.26
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VIR1207246297733211 ZP 06962329.1 cytochromeP450125cyp125[MycobacteriumtuberculosisKZNR506]323MFYRSANFD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304 5 0.36
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VIR1209035297733353 ZP 06962471.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu218LNWQQAALL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
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VIR1209575297733353 ZP 06962471.1 bifunctionalmembrane-associatedpenicillin-bindingprotein1A/1BponA2[Mycobacteriumtubercu758IQISNGIPP DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.25
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