Best Antigenic Epitopes having IL-4 & IFN-Gamma inducing Potential of VLCvirus
Immunomodulation is required for successful anticancer therapy. We have also identified the immunomodulatory potential of identified best antigenic epitopes obtained from the virus proteomes after applying heuristic approach. This page displays epitopes details in terms of Protein identifier, Gene name, its binding affinity with different classes of MHC - I, II and its IL-4 & IFN-Gamma inducing potential. Thus, the displayed epitopes in this page have immune-booster as well as immune-stimulating properties.
| Virus_Name | Protein_Details | Gene | Protein | Seq | MHCI_type | HLA_Freq_MHCI | MHCII_type | HLA_Freq_MHCII | IL4_inducer | IFN_inducer |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Epstein-Barr virus (strain AG876) | P0C763|GB_EBVA8 Envelope glycoprotein B | gB | 3 | FPGLRRRRY | HLA-B*5102:, HLA-B*4403:, MHC-Ld:, HLA-Cw*0702:, HLA-Cw*0401:, HLA-B*51:, HLA-B*5301:, HLA-B62:, HLA-B*5401:, HLA-B*0702:, HLA-B*3501: | 11 | DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1323, DRB1_1302 | 4 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Epstein-Barr virus (strain AG876) | Q69138|EBNA3_EBVA8 Epstein-Barr nuclear antigen 3 | EBNA3 | 3 | IKRTRERWR | HLA-A20 Cattle: | 1 | DRB5_0101, DRB5_0105 | 2 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Epstein-Barr virus (strain AG876) | Q69140|EBNA6_EBVA8 Epstein-Barr nuclear antigen 6 | EBNA6 | 3 | VMFVSRVPV | HLA-B*0702:, HLA-A2.1:, HLA-B*5301:, HLA-A2:, HLA-A*0201:, HLA-B*2702:, HLA-B*5101:, HLA-B*5401:, HLA-B14:, HLA-B*5201:, HLA-B*51:, HLA-B*5103:, HLA-A*0205:, HLA-B*2705:, HLA-B*5102: | 15 | DRB1_1501, DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_1106, DRB1_0301, DRB1_0102, DRB1_1506, DRB1_0701, DRB1_1107, DRB1_0309, DRB1_0703, DRB1_1311, DRB1_1104, DRB1_0308, DRB1_0311 | 15 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Epstein-Barr virus (strain B95-8) | P03204|EBNA6_EBVB9 Epstein-Barr nuclear antigen 6 | EBNA6 | 1 | FVSRVPAKK | HLA-A*1101:, HLA-A3:, HLA-A68.1:, HLA-B*5401: | 4 | DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_1323, DRB1_1120, DRB5_0105, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1302, DRB1_0806, DRB5_0101, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1307 | 15 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Epstein-Barr virus (strain B95-8) | P03204|EBNA6_EBVB9 Epstein-Barr nuclear antigen 6 | EBNA6 | 1 | MFVSRVPAK | HLA-A*3101:, HLA-A*1101: | 2 | DRB1_0311, DRB1_0308, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_0301, DRB1_1107 | 8 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Epstein-Barr virus (strain B95-8) | P03204|EBNA6_EBVB9 Epstein-Barr nuclear antigen 6 | EBNA6 | 1 | VMFVSRVPA | HLA-B*51:, HLA-B*5301:, HLA-B*2702:, HLA-B*0702:, HLA-B*2705:, HLA-A*0205:, HLA-A*0201:, HLA-A2:, HLA-B*5401: | 9 | DRB1_0102, DRB1_1506, DRB1_0301, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1501, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1101, DRB1_0305, DRB1_1102, DRB1_0307, DRB1_0804, DRB1_0802, DRB1_1104, DRB1_0306, DRB1_1307, DRB1_0813, DRB1_1106 | 21 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus 127 | E0YDP9|E0YDP9_9PAPI Minor capsid protein L2 | L2 | 3 | VLKVFVPDY | HLA-A2.1:, HLA-B*3501:, HLA-B62:, HLA-A3:, HLA-Cw*0702:, HLA-B*2702:, HLA-Cw*0602:, HLA-B*51: | 8 | DRB1_0301 | 1 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus 139 | I6MRE1|I6MRE1_9PAPI Protein E6 | E6 | 3 | IKRLRVVLR | HLA-A20 Cattle: | 1 | DRB1_0306, DRB1_0401, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_0307, DRB1_0102, DRB1_1327, DRB1_0404, DRB1_1106, DRB5_0105, DRB1_0101, DRB1_1302, DRB1_1104, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_1121, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1311, DRB1_0421, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB1_1322, DRB1_1301, DRB1_1101, DRB1_1305, DRB1_0423, DRB1_1114, DRB1_0301 | 35 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus 154 | R9QDL4|R9QDL4_9PAPI E4 | Not Available | 4 | LRDLKKRLR | HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle: | 3 | DRB1_1305, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1301, DRB1_1120, DRB1_1328, DRB5_0105, DRB1_1322, DRB1_1307, DRB1_1102, DRB1_1323, DRB1_1114, DRB1_1304, DRB1_1128, DRB5_0101 | 16 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus 172 | V5W3Y1|V5W3Y1_9PAPI Minor capsid protein L2 | L2 | 3 | VPSRPTISR | HLA-A20 Cattle:, HLA-A68.1:, HLA-A*3101:, HLA-B*5301:, HLA-A*3302:, HLA-B*51: | 6 | DRB1_0402 | 1 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus 202 | A0A0H4LNY6|A0A0H4LNY6_9PAPI Regulatory protein E2 | E2 | 3 | IRTPRRRRR | HLA-B14:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle: | 4 | DRB1_1102, DRB1_1301, DRB1_1328, DRB1_1327, DRB1_1302, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1322 | 8 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus 205 | A0A166FK94|A0A166FK94_9PAPI Replication protein E1 | E1 | 3 | WKPISQFLK | HLA-B*5401:, HLA-B*51:, HLA-A20 Cattle: | 3 | DRB1_0305, DRB5_0105, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB1_1101 | 5 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 102 | Q2VJB8|Q2VJB8_9PAPI Replication protein E1 | E1 | 3 | IVKFLRYQR | HLA-A68.1:, HLA-A3:, HLA-A*3101:, HLA-A*1101:, HLA-A*3302:, HLA-A20 Cattle: | 6 | DRB1_1305, DRB1_1101, DRB5_0101, DRB1_1327, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1104, DRB1_1322, DRB1_1506, DRB1_1102, DRB1_1302, DRB5_0105, DRB1_1301, DRB1_1121, DRB1_1502, DRB1_1304, DRB1_1328, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1501, DRB1_1311, DRB1_1323 | 22 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 108 | C0MHS2|C0MHS2_9PAPI Regulatory protein E2 | E2 | 3 | WRYRCKTKY | HLA-B*5301:, HLA-B*2705:, HLA-B*5401:, HLA-B14:, HLA-Cw*0702:, HLA-B*2702:, HLA-B*51: | 7 | DRB1_1327, DRB1_0804, DRB1_1328, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1120, DRB1_0305, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1323, DRB1_0802, DRB1_0309, DRB1_1301, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1321, DRB1_1114 | 20 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 128 | E7BRQ7|E7BRQ7_9PAPI Protein E6 | E6 | 3 | VRGHWRWYC | HLA-B*2705:, HLA-B*2702: | 2 | DRB1_1506, DRB1_1327, DRB1_1304, DRB1_0402, DRB1_1307, DRB1_0305, DRB1_1311, DRB1_1107, DRB1_1104, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1101, DRB1_1501, DRB1_1114, DRB1_1502, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_1106, DRB1_1323, DRB1_1322 | 22 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 144 | I3P6P7|I3P6P7_9PAPI Replication protein E1 | E1 | 3 | VKMYKRHEM | HLA-A2:, HLA-B*3902:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B14:, HLA-B*51: | 5 | DRB1_1114, DRB1_1101, DRB1_1106, DRB1_0817, DRB1_1302, DRB1_1301, DRB1_1502, DRB1_1328, DRB1_1102, DRB1_0306, DRB1_1327, DRB1_0813, DRB1_1305, DRB1_0307, DRB1_1311, DRB1_1304, DRB1_1104, DRB1_1322, DRB1_0802, DRB1_0801, DRB1_1321, DRB1_0308, DRB1_1128, DRB1_1323, DRB1_0311, DRB1_1121, DRB1_1506, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1120, DRB1_1501 | 31 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 150 | D3VNE9|D3VNE9_9PAPI Protein E6 | E6 | 3 | WKGVCRHCR | HLA-A20 Cattle:, HLA-B*51:, HLA-B*5401: | 3 | DRB1_1128, DRB1_1120, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB5_0105, DRB1_1302, DRB1_1101, DRB5_0101 | 8 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 156 | K7QR99|K7QR99_9PAPI Protein E6 | E6 | 3 | VRGHWRNCC | HLA-B*2705:, HLA-B*2702: | 2 | DRB1_0305, DRB1_1501, DRB1_1323, DRB1_1304, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_0301, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1107, DRB1_0308, DRB1_1327, DRB1_0306, DRB1_1120, DRB1_1506, DRB1_1502, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1322, DRB1_0813, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0307 | 23 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 156 | K7R1G7|K7R1G7_9PAPI Replication protein E1 | E1 | 3 | WVIFVHAIR | HLA-A*3302:, HLA-A3:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*5401:, HLA-A*1101:, HLA-A68.1:, HLA-B*51:, HLA-A*3101: | 8 | DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1328, DRB1_1114, DRB1_1101, DRB1_1121, DRB1_0804, DRB1_0309, DRB1_1128, DRB1_1322, DRB1_1305, DRB5_0105, DRB1_0408, DRB1_1102, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB1_0405, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB1_0801, DRB1_1506, DRB1_1307, DRB1_0817, DRB1_1302, DRB1_0101, DRB1_1327, DRB1_0802, DRB1_1120, DRB1_1301 | 29 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 194 | A0A2S0BI27|A0A2S0BI27_9PAPI Regulatory protein E2 | E2 | 3 | WRYRKFQNA | HLA-Cw*0301:, HLA-B14:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-B*5401:, HLA-B*5301:, HLA-B*51:, MHC-Kb:, HLA-A2: | 9 | DRB1_0804, DRB1_1114, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0402, DRB1_1323, DRB1_0817, DRB1_0813 | 8 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 2 | A3F905|A3F905_9PAPI Protein E6 | E6 | 3 | LRLLCVWCK | HLA-B*2705:, HLA-B*2702: | 2 | DRB1_0806, DRB1_1322, DRB1_1120, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0401, DRB1_1304, DRB1_1114, DRB1_1302, DRB1_0309, DRB1_0301, DRB1_0426, DRB1_0306, DRB1_0423, DRB1_1301, DRB1_0402, DRB1_0102, DRB1_0813, DRB1_1323, DRB1_1307, DRB1_0307, DRB1_0305, DRB1_1128, DRB1_1101, DRB1_1121, DRB1_0421, DRB1_0801, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB1_1106, DRB1_1104, DRB1_0308, DRB1_0410, DRB1_0802, DRB1_1311, DRB1_1107, DRB1_0804, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB5_0105, DRB1_1328, DRB1_1321, DRB1_1102, DRB1_0101, DRB1_1327 | 45 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 200 | A0A0H4LMI3|A0A0H4LMI3_9PAPI Regulatory protein E2 | E2 | 3 | LEYWKAVRA | HLA-A2:, HLA-B61:, HLA-B*5301:, HLA-B*5401:, HLA-B60:, HLA-B*51:, MHC-Kk:, HLA-B40:, HLA-B*4403:, HLA-B*2702: | 10 | DRB1_0402 | 1 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 29 | P50800|VL2_HPV29 Minor capsid protein L2 | L2 | 3 | WPFVPVAPA | HLA-B*5101:, MHC-Ld:, HLA-B40:, HLA-B*51:, HLA-B*0702:, HLA-B*3501:, HLA-B*5401:, HLA-B*5103:, HLA-B61:, HLA-B*5102:, HLA-B*5301: | 11 | DRB1_0802, DRB1_0408, DRB1_1101, DRB1_0801, DRB1_1307 | 5 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 32 | P36724|VE1_HPV32 Replication protein E1 | E1 | 3 | WRPIVKFIR | HLA-B*5401:, HLA-B*51:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle: | 5 | DRB1_0101, DRB1_1121, DRB1_1120, DRB1_0309, DRB1_0301, DRB1_1114, DRB1_0813, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB5_0101, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_0802, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_0801, DRB1_0305, DRB5_0105, DRB1_1305, DRB1_1104, DRB1_1311, DRB1_1307, DRB1_1301, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1106 | 28 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 48 | Q80922|VE1_HPV48 Replication protein E1 | E1 | 3 | WVITAIGIR | HLA-A68.1:, HLA-A*3302:, HLA-A20 Cattle:, HLA-A*1101:, HLA-A*3101:, HLA-B*5401:, HLA-B*51: | 7 | DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1302, DRB5_0105, DRB1_0801, DRB1_1305, DRB1_0401, DRB1_0305, DRB1_1128, DRB5_0101, DRB1_1321, DRB1_0802, DRB1_0421, DRB1_0309, DRB1_0426, DRB1_1120 | 16 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 59 | B9UPE2|B9UPE2_HPV59 Regulatory protein E2 | E2 | 3 | WKLVRMENV | HLA-A20 Cattle:, HLA-B*51:, HLA-A2:, HLA-B*5301:, HLA-B*5401:, HLA-B14: | 6 | DRB1_0701, DRB1_0703 | 2 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 67 | A4U7F4|A4U7F4_HPV67 Replication protein E1 | E1 | 3 | WRTIVKLLR | HLA-B*2702:, HLA-B*51:, HLA-B*5401:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*2705: | 5 | DRB1_0309, DRB1_1104, DRB1_0802, DRB1_1120, DRB1_1307, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1302, DRB1_0301, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB1_0308, DRB5_0101, DRB1_1327, DRB1_0311, DRB1_1321, DRB1_1301, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_1328, DRB1_1101, DRB1_1311, DRB1_1106, DRB1_1502, DRB1_0801, DRB5_0105, DRB1_0305, DRB1_1128 | 30 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 71 | Q6EGP3|Q6EGP3_9PAPI Replication protein E1 | E1 | 3 | WRTIVKYLR | HLA-B*2702:, HLA-B*51:, HLA-B*5401:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*2705: | 5 | DRB1_1106, DRB1_0305, DRB1_0802, DRB5_0101, DRB1_1104, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_0301, DRB1_1321, DRB5_0105, DRB1_1307, DRB1_1305, DRB1_1120, DRB1_1101, DRB1_1311, DRB1_0813, DRB1_1323, DRB1_0309, DRB1_0101 | 20 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 72b | A0A059UAS1|A0A059UAS1_HPV72 Replication protein E1 | E1 | 3 | WRPIAKYLR | HLA-B*51:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*5401:, HLA-B*2702: | 5 | DRB1_0309, DRB1_1104, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB1_0813, DRB1_0101, DRB1_0801, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1114, DRB5_0105, DRB1_1106, DRB1_1302, DRB1_1321, DRB1_1307, DRB1_0305, DRB1_0802, DRB1_1311, DRB1_0301, DRB1_1323 | 22 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 81 | A0A159DX61|A0A159DX61_9PAPI Minor capsid protein L2 | L2 | 3 | VPVRDPAFV | HLA-B7:, HLA-A2.1:, HLA-B*5101:, HLA-B61:, MHC-Ld:, HLA-B*0702:, HLA-B*5401:, HLA-B*5103:, HLA-A*0201:, HLA-B*5301:, HLA-Cw*0401:, HLA-B*5102:, HLA-B*5201:, HLA-B*3501:, HLA-B*51: | 15 | DRB1_0806, DRB1_0802, DRB1_0804 | 3 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Human papillomavirus type 87 | Q9DIH7|Q9DIH7_9PAPI Protein E6 | e6 | 3 | LRLLCIFCK | HLA-B*2705:, HLA-B*2702: | 2 | DRB1_0401, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1114, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB5_0105, DRB1_0402, DRB1_1121, DRB1_1120, DRB1_0309, DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB1_0301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1321, DRB1_1101, DRB1_0308, DRB1_0307, DRB1_0423, DRB1_1128, DRB1_1506, DRB1_1307, DRB1_1104, DRB1_0804, DRB1_1311, DRB1_0802, DRB1_1107, DRB1_0404, DRB1_1106, DRB1_0311, DRB1_0410, DRB1_0306, DRB1_1323, DRB1_0408, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_1302, DRB1_1501, DRB1_1328, DRB1_0305 | 44 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |
| Measles virus (strain Ichinose-B95a) | Q9WMB5|NCAP_MEASC Nucleoprotein | N | 3 | WIKYTQQRR | HLA-A20 Cattle:, HLA-A*3302:, HLA-A68.1:, HLA-A*3101:, HLA-B*5401: | 5 | DRB5_0101, DRB5_0105 | 2 | IL4 inducer | IFN gamma Inducer |