Best Antigenic Epitopes having IFN-Gamma inducing Potential of VLCvirus

Immunomodulation is required for successful anticancer therapy. We have also identified the immunomodulatory potential of identified best antigenic epitopes obtained from the virus proteomes after applying heuristic approach. This page displays epitopes details in terms of Protein identifier, Gene name, its binding affinity with different classes of MHC - I, II and its IFN-Gamma inducing potential. Thus, the displayed epitopes in this page have immune-booster as well as immune-stimulating properties.

Virus_Name Protein_Details Gene Protein Seq MHCI_type HLA_Freq_MHCI MHCII_type HLA_Freq_MHCII IFN-gamma_Inducing_Potential
Epstein-Barr virus (strain AG876) P0C763|GB_EBVA8 Envelope glycoprotein B gB 3 FPGLRRRRY HLA-B*5102:, HLA-B*4403:, MHC-Ld:, HLA-Cw*0702:, HLA-Cw*0401:, HLA-B*51:, HLA-B*5301:, HLA-B62:, HLA-B*5401:, HLA-B*0702:, HLA-B*3501: 11 DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1323, DRB1_1302 4 IFN gamma Inducer
Epstein-Barr virus (strain AG876) Q69138|EBNA3_EBVA8 Epstein-Barr nuclear antigen 3 EBNA3 3 IKRTRERWR HLA-A20 Cattle: 1 DRB5_0101, DRB5_0105 2 IFN gamma Inducer
Epstein-Barr virus (strain AG876) Q69140|EBNA6_EBVA8 Epstein-Barr nuclear antigen 6 EBNA6 3 VMFVSRVPV HLA-B*0702:, HLA-A2.1:, HLA-B*5301:, HLA-A2:, HLA-A*0201:, HLA-B*2702:, HLA-B*5101:, HLA-B*5401:, HLA-B14:, HLA-B*5201:, HLA-B*51:, HLA-B*5103:, HLA-A*0205:, HLA-B*2705:, HLA-B*5102: 15 DRB1_1501, DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_1106, DRB1_0301, DRB1_0102, DRB1_1506, DRB1_0701, DRB1_1107, DRB1_0309, DRB1_0703, DRB1_1311, DRB1_1104, DRB1_0308, DRB1_0311 15 IFN gamma Inducer
Epstein-Barr virus (strain B95-8) P03204|EBNA6_EBVB9 Epstein-Barr nuclear antigen 6 EBNA6 1 FVSRVPAKK HLA-A*1101:, HLA-A3:, HLA-A68.1:, HLA-B*5401: 4 DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_1323, DRB1_1120, DRB5_0105, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1302, DRB1_0806, DRB5_0101, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1307 15 IFN gamma Inducer
Epstein-Barr virus (strain B95-8) P03189|ITP_EBVB9 Inner tegument protein BOLF1 3 LPLARRRAV HLA-B61:, HLA-B*5103:, HLA-B*5301:, HLA-B*5102:, HLA-B14:, HLA-Cw*0401:, HLA-B*0702:, HLA-B7:, HLA-B*3501:, MHC-Ld:, HLA-B*5201:, HLA-B*5401:, HLA-B8:, HLA-B*51:, HLA-B*5101: 15 DRB1_1322, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1102 6 IFN gamma Inducer
Epstein-Barr virus (strain B95-8) P03204|EBNA6_EBVB9 Epstein-Barr nuclear antigen 6 EBNA6 1 MFVSRVPAK HLA-A*3101:, HLA-A*1101: 2 DRB1_0311, DRB1_0308, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_0301, DRB1_1107 8 IFN gamma Inducer
Epstein-Barr virus (strain B95-8) P03204|EBNA6_EBVB9 Epstein-Barr nuclear antigen 6 EBNA6 1 VMFVSRVPA HLA-B*51:, HLA-B*5301:, HLA-B*2702:, HLA-B*0702:, HLA-B*2705:, HLA-A*0205:, HLA-A*0201:, HLA-A2:, HLA-B*5401: 9 DRB1_0102, DRB1_1506, DRB1_0301, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1501, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1101, DRB1_0305, DRB1_1102, DRB1_0307, DRB1_0804, DRB1_0802, DRB1_1104, DRB1_0306, DRB1_1307, DRB1_0813, DRB1_1106 21 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 127 E0YDP9|E0YDP9_9PAPI Minor capsid protein L2 L2 3 VLKVFVPDY HLA-A2.1:, HLA-B*3501:, HLA-B62:, HLA-A3:, HLA-Cw*0702:, HLA-B*2702:, HLA-Cw*0602:, HLA-B*51: 8 DRB1_0301 1 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 139 I6MRE1|I6MRE1_9PAPI Protein E6 E6 3 IKRLRVVLR HLA-A20 Cattle: 1 DRB1_0306, DRB1_0401, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_0307, DRB1_0102, DRB1_1327, DRB1_0404, DRB1_1106, DRB5_0105, DRB1_0101, DRB1_1302, DRB1_1104, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_1121, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1311, DRB1_0421, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB1_1322, DRB1_1301, DRB1_1101, DRB1_1305, DRB1_0423, DRB1_1114, DRB1_0301 35 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 148 E7BQC4|E7BQC4_9PAPI Replication protein E1 E1 3 VRLYKRQEL HLA-B*2702:, HLA-Cw*0301:, HLA-B*3901:, HLA-B*2705:, HLA-B14:, HLA-B*51:, HLA-B*3902:, HLA-Cw*0602: 8 DRB1_1328, DRB1_1301, DRB5_0105, DRB1_1506, DRB1_0701, DRB1_1121, DRB1_1120, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB1_0802, DRB1_1107, DRB1_0308, DRB1_0102, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1501, DRB1_0306, DRB1_0801, DRB1_1322, DRB1_1302, DRB1_0301, DRB1_1502, DRB1_0307, DRB1_1327, DRB1_0806, DRB1_1114, DRB1_1323, DRB1_0311, DRB1_0817, DRB1_0703, DRB1_1304 31 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 154 R9QDL4|R9QDL4_9PAPI E4 Not Available 4 LRDLKKRLR HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle: 3 DRB1_1305, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1301, DRB1_1120, DRB1_1328, DRB5_0105, DRB1_1322, DRB1_1307, DRB1_1102, DRB1_1323, DRB1_1114, DRB1_1304, DRB1_1128, DRB5_0101 16 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 172 V5W3Y1|V5W3Y1_9PAPI Minor capsid protein L2 L2 3 VPSRPTISR HLA-A20 Cattle:, HLA-A68.1:, HLA-A*3101:, HLA-B*5301:, HLA-A*3302:, HLA-B*51: 6 DRB1_0402 1 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 202 A0A0H4LNY6|A0A0H4LNY6_9PAPI Regulatory protein E2 E2 3 IRTPRRRRR HLA-B14:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle: 4 DRB1_1102, DRB1_1301, DRB1_1328, DRB1_1327, DRB1_1302, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1322 8 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 204 A0A0F7GHA1|A0A0F7GHA1_9PAPI Minor capsid protein L2 L2 3 VPVRPTIPV HLA-B*5102:, HLA-B*3501:, HLA-B*5101:, HLA-B*51:, HLA-B7:, HLA-Cw*0401:, MHC-Ld:, HLA-B*5301:, HLA-B*5103:, HLA-B61:, HLA-B*5201:, HLA-B*0702:, HLA-B*5401: 13 DRB1_0804, DRB1_0402 2 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus 205 A0A166FK94|A0A166FK94_9PAPI Replication protein E1 E1 3 WKPISQFLK HLA-B*5401:, HLA-B*51:, HLA-A20 Cattle: 3 DRB1_0305, DRB5_0105, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB1_1101 5 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 102 Q2VJB8|Q2VJB8_9PAPI Replication protein E1 E1 3 IVKFLRYQR HLA-A68.1:, HLA-A3:, HLA-A*3101:, HLA-A*1101:, HLA-A*3302:, HLA-A20 Cattle: 6 DRB1_1305, DRB1_1101, DRB5_0101, DRB1_1327, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1104, DRB1_1322, DRB1_1506, DRB1_1102, DRB1_1302, DRB5_0105, DRB1_1301, DRB1_1121, DRB1_1502, DRB1_1304, DRB1_1328, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1501, DRB1_1311, DRB1_1323 22 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 108 C0MHS2|C0MHS2_9PAPI Regulatory protein E2 E2 3 WRYRCKTKY HLA-B*5301:, HLA-B*2705:, HLA-B*5401:, HLA-B14:, HLA-Cw*0702:, HLA-B*2702:, HLA-B*51: 7 DRB1_1327, DRB1_0804, DRB1_1328, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1120, DRB1_0305, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1323, DRB1_0802, DRB1_0309, DRB1_1301, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1321, DRB1_1114 20 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 128 E7BRQ7|E7BRQ7_9PAPI Protein E6 E6 3 VRGHWRWYC HLA-B*2705:, HLA-B*2702: 2 DRB1_1506, DRB1_1327, DRB1_1304, DRB1_0402, DRB1_1307, DRB1_0305, DRB1_1311, DRB1_1107, DRB1_1104, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1101, DRB1_1501, DRB1_1114, DRB1_1502, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_1106, DRB1_1323, DRB1_1322 22 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 144 I3P6P7|I3P6P7_9PAPI Replication protein E1 E1 3 VKMYKRHEM HLA-A2:, HLA-B*3902:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B14:, HLA-B*51: 5 DRB1_1114, DRB1_1101, DRB1_1106, DRB1_0817, DRB1_1302, DRB1_1301, DRB1_1502, DRB1_1328, DRB1_1102, DRB1_0306, DRB1_1327, DRB1_0813, DRB1_1305, DRB1_0307, DRB1_1311, DRB1_1304, DRB1_1104, DRB1_1322, DRB1_0802, DRB1_0801, DRB1_1321, DRB1_0308, DRB1_1128, DRB1_1323, DRB1_0311, DRB1_1121, DRB1_1506, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1120, DRB1_1501 31 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 150 D3VNE9|D3VNE9_9PAPI Protein E6 E6 3 WKGVCRHCR HLA-A20 Cattle:, HLA-B*51:, HLA-B*5401: 3 DRB1_1128, DRB1_1120, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB5_0105, DRB1_1302, DRB1_1101, DRB5_0101 8 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 156 K7QR99|K7QR99_9PAPI Protein E6 E6 3 VRGHWRNCC HLA-B*2705:, HLA-B*2702: 2 DRB1_0305, DRB1_1501, DRB1_1323, DRB1_1304, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_0301, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1107, DRB1_0308, DRB1_1327, DRB1_0306, DRB1_1120, DRB1_1506, DRB1_1502, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1322, DRB1_0813, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0307 23 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 156 K7R1G7|K7R1G7_9PAPI Replication protein E1 E1 3 WVIFVHAIR HLA-A*3302:, HLA-A3:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*5401:, HLA-A*1101:, HLA-A68.1:, HLA-B*51:, HLA-A*3101: 8 DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1328, DRB1_1114, DRB1_1101, DRB1_1121, DRB1_0804, DRB1_0309, DRB1_1128, DRB1_1322, DRB1_1305, DRB5_0105, DRB1_0408, DRB1_1102, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB1_0405, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB1_0801, DRB1_1506, DRB1_1307, DRB1_0817, DRB1_1302, DRB1_0101, DRB1_1327, DRB1_0802, DRB1_1120, DRB1_1301 29 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 194 A0A2S0BI27|A0A2S0BI27_9PAPI Regulatory protein E2 E2 3 WRYRKFQNA HLA-Cw*0301:, HLA-B14:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-B*5401:, HLA-B*5301:, HLA-B*51:, MHC-Kb:, HLA-A2: 9 DRB1_0804, DRB1_1114, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0402, DRB1_1323, DRB1_0817, DRB1_0813 8 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 2 A3F905|A3F905_9PAPI Protein E6 E6 3 LRLLCVWCK HLA-B*2705:, HLA-B*2702: 2 DRB1_0806, DRB1_1322, DRB1_1120, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0401, DRB1_1304, DRB1_1114, DRB1_1302, DRB1_0309, DRB1_0301, DRB1_0426, DRB1_0306, DRB1_0423, DRB1_1301, DRB1_0402, DRB1_0102, DRB1_0813, DRB1_1323, DRB1_1307, DRB1_0307, DRB1_0305, DRB1_1128, DRB1_1101, DRB1_1121, DRB1_0421, DRB1_0801, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB1_1106, DRB1_1104, DRB1_0308, DRB1_0410, DRB1_0802, DRB1_1311, DRB1_1107, DRB1_0804, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB5_0105, DRB1_1328, DRB1_1321, DRB1_1102, DRB1_0101, DRB1_1327 45 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 200 A0A0H4LMI3|A0A0H4LMI3_9PAPI Regulatory protein E2 E2 3 LEYWKAVRA HLA-A2:, HLA-B61:, HLA-B*5301:, HLA-B*5401:, HLA-B60:, HLA-B*51:, MHC-Kk:, HLA-B40:, HLA-B*4403:, HLA-B*2702: 10 DRB1_0402 1 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 21 P50787|VL1_HPV21 Major capsid protein L1 L1 3 VSTRGIKRK HLA-A68.1: 1 DRB1_0804 1 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 29 P50800|VL2_HPV29 Minor capsid protein L2 L2 3 WPFVPVAPA HLA-B*5101:, MHC-Ld:, HLA-B40:, HLA-B*51:, HLA-B*0702:, HLA-B*3501:, HLA-B*5401:, HLA-B*5103:, HLA-B61:, HLA-B*5102:, HLA-B*5301: 11 DRB1_0802, DRB1_0408, DRB1_1101, DRB1_0801, DRB1_1307 5 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 32 P36724|VE1_HPV32 Replication protein E1 E1 3 WRPIVKFIR HLA-B*5401:, HLA-B*51:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle: 5 DRB1_0101, DRB1_1121, DRB1_1120, DRB1_0309, DRB1_0301, DRB1_1114, DRB1_0813, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB5_0101, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_0802, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_0801, DRB1_0305, DRB5_0105, DRB1_1305, DRB1_1104, DRB1_1311, DRB1_1307, DRB1_1301, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1106 28 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 48 Q80922|VE1_HPV48 Replication protein E1 E1 3 WVITAIGIR HLA-A68.1:, HLA-A*3302:, HLA-A20 Cattle:, HLA-A*1101:, HLA-A*3101:, HLA-B*5401:, HLA-B*51: 7 DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1302, DRB5_0105, DRB1_0801, DRB1_1305, DRB1_0401, DRB1_0305, DRB1_1128, DRB5_0101, DRB1_1321, DRB1_0802, DRB1_0421, DRB1_0309, DRB1_0426, DRB1_1120 16 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 59 B9UPE2|B9UPE2_HPV59 Regulatory protein E2 E2 3 WKLVRMENV HLA-A20 Cattle:, HLA-B*51:, HLA-A2:, HLA-B*5301:, HLA-B*5401:, HLA-B14: 6 DRB1_0701, DRB1_0703 2 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 67 A4U7F0|A4U7F0_HPV67 Minor capsid protein L2 L2 3 FLRRRRKRF HLA-B*5401:, HLA-B*0702:, HLA-B*5301:, HLA-B62:, HLA-B*51:, HLA-B*3501:, HLA-B8: 7 DRB1_0813, DRB1_0801, DRB1_1323, DRB1_0804, DRB1_0802, DRB1_1327, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1328, DRB1_1120, DRB1_1305, DRB1_0806, DRB1_0817 15 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 67 A4U7F4|A4U7F4_HPV67 Replication protein E1 E1 3 WRTIVKLLR HLA-B*2702:, HLA-B*51:, HLA-B*5401:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*2705: 5 DRB1_0309, DRB1_1104, DRB1_0802, DRB1_1120, DRB1_1307, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1302, DRB1_0301, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB1_0308, DRB5_0101, DRB1_1327, DRB1_0311, DRB1_1321, DRB1_1301, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_1328, DRB1_1101, DRB1_1311, DRB1_1106, DRB1_1502, DRB1_0801, DRB5_0105, DRB1_0305, DRB1_1128 30 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 71 Q6EGP3|Q6EGP3_9PAPI Replication protein E1 E1 3 WRTIVKYLR HLA-B*2702:, HLA-B*51:, HLA-B*5401:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*2705: 5 DRB1_1106, DRB1_0305, DRB1_0802, DRB5_0101, DRB1_1104, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_0301, DRB1_1321, DRB5_0105, DRB1_1307, DRB1_1305, DRB1_1120, DRB1_1101, DRB1_1311, DRB1_0813, DRB1_1323, DRB1_0309, DRB1_0101 20 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 72b A0A059UAS1|A0A059UAS1_HPV72 Replication protein E1 E1 3 WRPIAKYLR HLA-B*51:, HLA-B*2705:, HLA-A20 Cattle:, HLA-B*5401:, HLA-B*2702: 5 DRB1_0309, DRB1_1104, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB1_0813, DRB1_0101, DRB1_0801, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1114, DRB5_0105, DRB1_1106, DRB1_1302, DRB1_1321, DRB1_1307, DRB1_0305, DRB1_0802, DRB1_1311, DRB1_0301, DRB1_1323 22 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 81 A0A159DX61|A0A159DX61_9PAPI Minor capsid protein L2 L2 3 VPVRDPAFV HLA-B7:, HLA-A2.1:, HLA-B*5101:, HLA-B61:, MHC-Ld:, HLA-B*0702:, HLA-B*5401:, HLA-B*5103:, HLA-A*0201:, HLA-B*5301:, HLA-Cw*0401:, HLA-B*5102:, HLA-B*5201:, HLA-B*3501:, HLA-B*51: 15 DRB1_0806, DRB1_0802, DRB1_0804 3 IFN gamma Inducer
Human papillomavirus type 87 Q9DIH7|Q9DIH7_9PAPI Protein E6 e6 3 LRLLCIFCK HLA-B*2705:, HLA-B*2702: 2 DRB1_0401, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1114, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB5_0105, DRB1_0402, DRB1_1121, DRB1_1120, DRB1_0309, DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB1_0301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1321, DRB1_1101, DRB1_0308, DRB1_0307, DRB1_0423, DRB1_1128, DRB1_1506, DRB1_1307, DRB1_1104, DRB1_0804, DRB1_1311, DRB1_0802, DRB1_1107, DRB1_0404, DRB1_1106, DRB1_0311, DRB1_0410, DRB1_0306, DRB1_1323, DRB1_0408, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_1302, DRB1_1501, DRB1_1328, DRB1_0305 44 IFN gamma Inducer
Measles virus (strain Ichinose-B95a) Q9WMB5|NCAP_MEASC Nucleoprotein N 3 FRLGQEMVR HLA-A20 Cattle:, HLA-B*2702:, HLA-B*2705:, HLA-B*5401:, HLA-B*51: 5 DRB5_0105, DRB1_0309, DRB1_0305, DRB5_0101 4 IFN gamma Inducer
Measles virus (strain Ichinose-B95a) Q9WMB5|NCAP_MEASC Nucleoprotein N 3 WIKYTQQRR HLA-A20 Cattle:, HLA-A*3302:, HLA-A68.1:, HLA-A*3101:, HLA-B*5401: 5 DRB5_0101, DRB5_0105 2 IFN gamma Inducer