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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele HLA-Cw*0401
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.100
1.000
1.200
1.000
1.000
C:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
D:
1.000
0.100
1.500
1.200
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
E:
1.000
0.100
1.000
1.200
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
F:
1.000
50.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
20.000
G:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
H:
1.000
0.100
1.500
1.000
1.100
1.000
1.000
1.100
0.100
I:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
5.000
K:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.100
0.100
L:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
40.000
M:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.100
1.200
1.000
1.000
20.000
N:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.200
P:
0.100
20.000
1.000
1.200
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
Q:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
R:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.100
1.000
1.000
1.000
0.100
S:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.100
0.200
T:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.200
1.000
1.000
1.000
1.000
V:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
5.000
W:
1.000
10.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
Y:
1.000
50.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
5.000
FINAL CONSTANT0.100
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
100
9.6
8
4.84
4.4
4
4
0.8
0.44
0.0264

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder