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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele HLA-B*5401
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
11.700
1.000
10.890
10.590
11.900
11.500
13.500
13.400
20.000
C:
10.800
1.000
10.310
12.200
10.980
12.100
11.400
12.300
1.000
D:
10.300
1.000
10.250
10.480
10.200
10.140
10.330
10.110
1.000
E:
10.300
1.000
10.250
10.480
10.200
10.140
10.330
10.110
1.000
F:
80.000
1.000
27.000
11.600
11.300
11.100
12.200
13.600
20.000
G:
10.160
1.000
10.200
10.850
10.780
10.610
10.250
11.500
1.000
H:
11.400
1.000
11.100
10.680
10.240
10.540
10.560
10.350
1.000
I:
12.300
1.000
16.200
11.600
15.600
12.000
15.600
10.550
20.000
K:
11.400
1.000
11.100
10.680
10.240
10.540
10.560
10.350
1.000
L:
12.300
1.000
16.200
11.600
15.600
12.000
15.600
10.550
20.000
M:
12.300
1.000
16.200
11.600
15.600
12.000
15.600
10.550
20.000
N:
10.200
1.000
11.500
10.610
10.510
10.810
10.180
10.400
1.000
P:
10.083
20.000
10.380
10.720
12.800
12.700
10.460
15.100
1.000
Q:
10.200
1.000
11.500
10.610
10.510
10.810
10.180
10.400
1.000
R:
11.400
1.000
11.100
10.680
10.240
10.540
10.560
10.350
1.000
S:
10.800
1.000
10.310
12.200
10.980
12.100
11.400
12.300
1.000
T:
10.800
1.000
10.310
12.200
10.980
12.100
11.400
12.300
1.000
V:
12.300
1.000
16.200
11.600
15.600
12.000
15.600
10.550
20.000
W:
80.000
1.000
27.000
11.600
11.300
11.100
12.200
13.600
20.000
Y:
80.000
1.000
27.000
11.600
11.300
11.100
12.200
13.600
20.000
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
131.75
120.17
116.57
113.79
111.54
109.673
108.33
107.22
105.99
101.803

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder