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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele HLA-A2.1
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
12.600
1.000
10.900
10.900
10.700
10.900
14.400
10.300
1.000
C:
10.700
1.000
11.900
14.800
10.900
11.200
11.200
11.100
1.000
D:
10.100
1.000
10.000
10.700
10.300
10.700
10.100
10.900
1.000
E:
10.100
1.000
10.000
10.700
10.300
10.700
10.100
10.900
1.000
F:
17.000
1.000
15.200
10.900
18.700
12.000
12.300
12.600
1.000
G:
13.500
1.000
10.400
11.100
11.100
11.300
10.400
10.400
1.000
H:
13.100
1.000
10.200
11.000
10.900
10.100
10.000
11.300
1.000
I:
13.100
1.000
11.800
10.500
10.900
11.300
11.200
11.700
20.000
K:
13.100
1.000
10.200
11.000
10.900
10.100
10.000
11.300
1.000
L:
13.100
20.000
11.800
10.500
10.900
11.300
11.200
11.700
20.000
M:
13.100
20.000
11.800
10.500
10.900
11.300
11.200
11.700
1.000
N:
10.500
1.000
10.400
11.200
10.900
11.000
10.700
10.300
1.000
P:
10.100
1.000
10.700
10.700
12.600
11.700
12.900
10.000
1.000
Q:
10.500
1.000
10.400
11.200
10.900
11.000
10.700
10.300
1.000
R:
13.100
1.000
10.200
11.000
10.900
10.100
10.000
11.300
1.000
S:
10.700
1.000
11.900
14.800
10.900
11.200
11.200
11.100
1.000
T:
10.700
1.000
11.900
14.800
10.900
11.200
11.200
11.100
1.000
V:
13.100
1.000
11.800
10.500
10.900
11.300
11.200
11.700
20.000
W:
17.000
1.000
15.200
10.900
18.700
12.000
12.300
12.600
1.000
Y:
17.000
1.000
15.200
10.900
18.700
12.000
12.300
12.600
1.000
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
119.8
109.3
106.8
105.1
103.9
102.9
102
101.2
99.8
96.6

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder