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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele HLA-A2
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
C:
0.597
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.010
D:
0.041
0.500
0.726
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.010
E:
0.578
2.840
0.054
1.000
0.756
3.246
0.820
1.000
0.015
F:
1.000
0.500
11.383
0.027
6.044
4.369
6.383
1.000
0.009
G:
0.578
0.500
0.088
1.000
0.804
1.060
0.105
1.000
0.009
H:
0.044
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.010
I:
1.000
10.151
1.849
0.078
1.000
1.000
1.000
1.000
0.534
K:
3.465
20.524
0.024
1.000
2.085
0.239
0.603
1.000
0.015
L:
1.000
103.183
3.685
0.646
1.000
1.000
1.000
1.000
2.357
M:
1.000
57.920
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.501
N:
1.000
0.542
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.009
P:
1.000
0.500
1.261
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.010
Q:
1.000
10.006
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.010
R:
1.000
0.500
0.033
1.000
1.000
1.000
0.277
1.000
0.010
S:
1.000
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.009
T:
1.000
6.080
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.009
V:
1.000
5.919
2.173
1.000
1.000
2.588
1.120
0.293
4.884
W:
1.000
0.500
12.978
1.000
2.680
0.251
5.951
1.000
0.010
Y:
1.000
0.500
7.613
1.000
8.002
3.470
1.000
1.000
0.009
FINAL CONSTANT0.151
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
79.7541714122769
23.5421561856927
9.38208086738472
4.72517978820895
2.59169577216
1.38407938464
0.78539464806
0.458928411
0.266194234324
0.0046463455

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder