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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele HLA-A*0205
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
C:
1.000
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
D:
0.100
0.100
0.400
3.000
1.000
1.000
0.500
1.000
0.003
E:
0.100
1.400
0.400
3.000
1.000
1.000
0.500
1.000
0.003
F:
3.000
0.050
3.000
1.000
2.000
2.000
1.200
1.000
0.015
G:
1.000
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
H:
1.000
0.050
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
I:
1.700
10.000
1.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
2.000
K:
3.000
0.100
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.003
L:
1.700
10.000
3.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
14.000
M:
1.700
10.000
3.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
1.000
N:
1.000
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
P:
0.100
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.003
Q:
1.000
8.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.003
R:
1.000
0.010
0.100
1.000
1.000
1.000
0.200
1.000
0.003
S:
1.000
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
T:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
2.000
V:
1.700
20.000
1.000
1.000
1.000
2.000
1.000
1.000
4.000
W:
3.000
0.010
3.000
1.000
1.000
2.000
1.200
1.000
0.015
Y:
3.000
0.010
3.000
1.000
1.200
2.000
1.000
1.000
0.015
FINAL CONSTANT0.050
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
21
8.4
3.57
1.68
0.98
0.595
0.3
0.105
0.035
0.0003

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder