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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele HLA-A*0201
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
C:
1.000
0.470
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
D:
0.075
0.100
0.400
4.100
1.000
1.000
0.490
1.000
0.003
E:
0.075
1.400
0.064
4.100
1.000
1.000
0.490
1.000
0.003
F:
4.600
0.050
3.700
1.000
3.800
1.900
5.800
5.500
0.015
G:
1.000
0.470
1.000
1.000
1.000
1.000
0.130
1.000
0.015
H:
0.034
0.050
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
I:
1.700
9.900
1.000
1.000
1.000
2.300
1.000
0.410
2.100
K:
3.500
0.100
0.035
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.003
L:
1.700
72.000
3.700
1.000
1.000
2.300
1.000
1.000
4.300
M:
1.700
52.000
3.700
1.000
1.000
2.300
1.000
1.000
1.000
N:
1.000
0.470
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
P:
0.022
0.470
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.003
Q:
1.000
7.300
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.003
R:
1.000
0.010
0.076
1.000
1.000
1.000
0.200
1.000
0.003
S:
1.000
0.470
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.015
T:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.500
V:
1.700
6.300
1.000
1.000
1.000
2.300
1.000
0.410
14.000
W:
4.600
0.010
8.300
1.000
1.000
1.700
7.500
5.500
0.015
Y:
4.600
0.010
3.200
1.000
1.000
1.500
1.000
5.500
0.015
FINAL CONSTANT0.069
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
80.9094
18.6978658608
6.916077
3.137568
1.60218
0.81310635
0.4197934125
0.13961115
0.0355005
0.0001501302

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder