Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
SEC140048449065993 YP 007433076.1 hypothe303IERYRAATLDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1501, DRB1_1506 6
SEC140051449065993 YP 007433076.1 hypothe306YRAATLMARDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 17
SEC140056449065993 YP 007433076.1 hypothe311LMARVRAAKDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 8
SEC140060449065993 YP 007433076.1 hypothe315VRAAKGMKVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 11
SEC140066449065993 YP 007433076.1 hypothe321MKVAQPSKHDRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1107 5
SEC140088449065993 YP 007433076.1 hypothe343IARVVANILDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6
SEC140095449065993 YP 007433076.1 hypothe350ILAGLGVIADRB1_0102 1
SEC140096449065993 YP 007433076.1 hypothe351LAGLGVIAEDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 6
SEC140101449065993 YP 007433076.1 hypothe356VIAEPKLVEDRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 4
SEC140119449065993 YP 007433076.1 hypothe374YEGQSAVKTDRB1_0101 1
SEC140125449065993 YP 007433076.1 hypothe380VKTAKTIDQDRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322 27
SEC140139449065993 YP 007433076.1 hypothe394LFIDEAYALDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1506 12
SEC140167449065993 YP 007433076.1 hypothe422LARMENDRDDRB1_0405, DRB1_0410 2
SEC140177449065993 YP 007433076.1 hypothe432LVVIIAGYSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 31
SEC140178449065993 YP 007433076.1 hypothe433VVIIAGYSSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 47
SEC140179449065993 YP 007433076.1 hypothe434VIIAGYSSDDRB1_0410 1
SEC140198449065993 YP 007433076.1 hypothe453LRSRFATRIDRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 9
SEC140216449065993 YP 007433076.1 hypothe471LLEIANVIADRB1_0404, DRB1_0423 2
SEC140217449065993 YP 007433076.1 hypothe472LEIANVIAADRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 28
SEC140239449065993 YP 007433076.1 hypothe494FLQAAKQLEDRB1_0801, DRB1_1321 2
SEC140240449065993 YP 007433076.1 hypothe495LQAAKQLEQDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322 13
SEC140250449065993 YP 007433076.1 hypothe505MLRGRRALDDRB1_0806 1
SEC140251449065993 YP 007433076.1 hypothe506LRGRRALDVDRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 30
SEC140265449065993 YP 007433076.1 hypothe520YARQLVEASDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 10
SEC140279449065993 YP 007433076.1 hypothe534MRLAQVLDIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 51
SEC140284449065993 YP 007433076.1 hypothe539VLDIDTLDEDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3
SEC140295449065993 YP 007433076.1 hypothe550LREINGSDMDRB1_0102 1
SEC140310378773653 YP 005173386.1 putativ1MHRIFLITVDRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 11
SEC140313378773653 YP 005173386.1 putativ4IFLITVALADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 37
SEC140314378773653 YP 005173386.1 putativ5FLITVALALDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18
SEC140320378773653 YP 005173386.1 putativ11LALLTASPADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 5
SEC140322378773653 YP 005173386.1 putativ13LLTASPASADRB1_0102 1
SEC140323378773653 YP 005173386.1 putativ14LTASPASAIDRB1_0701, DRB1_0703 2
SEC140356378773653 YP 005173386.1 putativ47VLCASPTTLDRB1_0101, DRB1_0102 2
SEC140378378773653 YP 005173386.1 putativ69YLGVADAHKDRB5_0101, DRB5_0105 2
SEC140379378773653 YP 005173386.1 putativ70LGVADAHKFDRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3
SEC140395378773653 YP 005173386.1 putativ86VAVIDTGVDDRB1_0405, DRB1_0410 2
SEC140416378773653 YP 005173386.1 putativ107FVDQAGNGLDRB1_0101, DRB1_0102 2
SEC140448378773653 YP 005173386.1 putativ139FVGVAPDARDRB1_0309, DRB5_0101, DRB5_0105 3
SEC140451378773653 YP 005173386.1 putativ142VAPDARLLSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
SEC140458378773653 YP 005173386.1 putativ149LSLRQTSEADRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 5
SEC140467378773653 YP 005173386.1 putativ158FEPVGSQANDRB1_0405 1
SEC140488378773653 YP 005173386.1 putativ179IRSLARAVVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 36
SEC140491378773653 YP 005173386.1 putativ182LARAVVHAADRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4
SEC140495378773653 YP 005173386.1 putativ186VVHAANLGVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 22
SEC140501378773653 YP 005173386.1 putativ192LGVGVINISDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 7
SEC140503378773653 YP 005173386.1 putativ194VGVINISEADRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1107 4
SEC140506378773653 YP 005173386.1 putativ197INISEAACYDRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0421 3
SEC140514378773653 YP 005173386.1 putativ205YKVSRPIDEDRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1321 6
SEC140531378773653 YP 005173386.1 putativ222YAVNVKGVVDRB1_0309, DRB1_1307 2
SEC140533378773653 YP 005173386.1 putativ224VNVKGVVVVDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 18
SEC140535378773653 YP 005173386.1 putativ226VKGVVVVVADRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 17
SEC140538378773653 YP 005173386.1 putativ229VVVVVAAGNDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 11
SEC140539378773653 YP 005173386.1 putativ230VVVVAAGNTDRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4
SEC140540378773653 YP 005173386.1 putativ231VVVAAGNTGDRB1_0101, DRB1_0102 2
SEC140541378773653 YP 005173386.1 putativ232VVAAGNTGGDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423 7
SEC140568378773653 YP 005173386.1 putativ259WNNVQTVVTDRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703 5
SEC140579378773653 YP 005173386.1 putativ270WYAPLVLSVDRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305 4
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