Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR985513253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1331FGARSGEPQ DRB1_0813 1 0.40
VIR985522253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1340LVVRRGRVY DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.25
VIR985523253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1341VVRRGRVYA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 32 0.44
VIR985524253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1342VRRGRVYAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506 24 0.44
VIR985551253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1369WRLVAGGGG DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.28
VIR985553253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1371LVAGGGGTL DRB1_1506 1 0.28
VIR985572253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1390VELATGQVR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.32
VIR985574253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1392LATGQVRVA DRB1_0402 1 0.38
VIR985579253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1397VRVAVGAVG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.31
VIR985583253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1401VGAVGVNFR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.49
VIR985594253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1412LVALGMYPG DRB1_0102 1 0.21
VIR985617253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1435VGPGVTGLA DRB1_1107 1 0.30
VIR985631253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1449MGLLGLVGS DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 30 0.23
VIR985633253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1451LLGLVGSEA DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.23
VIR985634253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1452LGLVGSEAV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.21
VIR985647253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1465LVTMVPAGW DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.22
VIR985648253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1466VTMVPAGWS DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.28
VIR985655253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1473WSLVEAAAV DRB1_0101 1 0.25
VIR985668253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1486LTAFYGLSV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.21
VIR985687253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1505LVHAGTGGV DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 12 0.27
VIR985702253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1520LARYWGAEV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR985710253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1528VFVTASRAK DRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.31
VIR985711253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1529FVTASRAKW DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.29
VIR985725253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1543MGFDDIHIS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.28
VIR985730253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1548IHISDSRSL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.38
VIR985738253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1556LEFEEAFLR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR985756253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1574VLNSLAGEF DRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.32
VIR985757253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1575LNSLAGEFT DRB1_0102 1 0.35
VIR985760253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1578LAGEFTDAS DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.29
VIR985769253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1587LRLLPSGGR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.25
VIR985771253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1589LLPSGGRFI DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.20
VIR985778253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1596FIELGKTDI DRB1_0813 1 0.28
VIR985801253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1619YRAFDLVEA DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 21 0.23
VIR985824253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1642LLAAGVLAR DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.31
VIR985829253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1647VLARLPVKT DRB1_0806 1 0.31
VIR985830253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1648LARLPVKTF DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.29
VIR985835253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1653VKTFDARCA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14 0.28
VIR985847253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1665YRFVSQARH DRB1_0305, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 21 0.28
VIR985849253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1667FVSQARHIG DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.29
VIR985878253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1696VVVTGGTGM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR985879253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1697VVTGGTGMA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
VIR985891253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1709VATHLVRRH DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.25
VIR985904253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1722LVLVSRSGE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_1304, DRB1_1321 15 0.28
VIR985923253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1741LLREGGAQV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR985933253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1751VVSCDVADR DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 34 0.34
VIR985955253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1773YPLKGVFHA DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323 12 0.22
VIR985975253799299 YP 003032300.1 polyketidesynthasepks7[MycobacteriumtuberculosisKZN1435]1793LTPDRVDTV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.46
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