Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR776965148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]88LSMIPVKSG DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 6 0.30
VIR776967148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]90MIPVKSGTL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.30
VIR776970148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]93VKSGTLIDK DRB1_1107 1 0.30
VIR776979148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]102LMFQGTPGD DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_1304, DRB1_1321 5 0.42
VIR776981148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]104FQGTPGDAR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.31
VIR776992148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]115LIVVSATMI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.26
VIR776993148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]116IVVSATMIT DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 28 0.26
VIR776994148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]117VVSATMITT DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.31
VIR776999148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]122MITTIGIVF DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.21
VIR777021148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]144FSVRLLRTF DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1120, DRB1_1302 4 0.36
VIR777023148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]146VRLLRTFLR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 43 0.32
VIR777026148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]149LRTFLRDVP DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.30
VIR777029148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]152FLRDVPNQV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.22
VIR777030148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]153LRDVPNQVV DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.22
VIR777033148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]156VPNQVVLAI DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 9 0.22
VIR777037148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]160VVLAIFACT DRB1_0102 1 0.28
VIR777038148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]161VLAIFACTF DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.28
VIR777039148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]162LAIFACTFA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.28
VIR777065148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]188FIPKVAVTG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1302 6 0.31
VIR777066148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]189IPKVAVTGS DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.99
VIR777075148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]198LALAFVSIA DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1107 4 0.27
VIR777079148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]202FVSIAALIY DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 30 0.29
VIR777085148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]208LIYFLHHLM DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.27
VIR777086148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]209IYFLHHLMH DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 25 0.27
VIR777087148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]210YFLHHLMHS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 37 0.27
VIR777088148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]211FLHHLMHSI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502 7 0.27
VIR777096148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]219IQIDTIMDK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 18 0.28
VIR777101148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]224IMDKVRLRT DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.23
VIR777105148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]228VRLRTLGLV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 8 0.20
VIR777107148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]230LRTLGLVDQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 30 0.24
VIR777165148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]288YTALLVTFV DRB1_0101, DRB1_0408 2 0.27
VIR777169148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]292LVTFVGDYV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.27
VIR777172148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]295FVGDYVTAG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1107 14 0.30
VIR777182148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]305LLGWCWRRG DRB1_0402 1 0.22
VIR777187148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]310WRRGTAPGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1107 7 0.23
VIR777205148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]328LRHVHIGFE DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1321 5 0.28
VIR777210148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]333IGFERTLQQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322 23 0.39
VIR777212148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]335FERTLQQDI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
VIR777220148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]343IRFGLRQMV DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.28
VIR777222148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]345FGLRQMVDI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0813 4 0.28
VIR777224148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]347LRQMVDIAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.28
VIR777227148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]350MVDIALRAL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.26
VIR777228148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]351VDIALRALS DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1322 5 0.26
VIR777230148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]353IALRALSPA DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813 3 0.26
VIR777232148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]355LRALSPALN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 20 0.26
VIR777243148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]366YTAIQVVHH DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1321 8 0.28
VIR777246148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]369IQVVHHLSA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 15 0.28
VIR777248148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]371VVHHLSAVE DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 16 0.28
VIR777249148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]372VHHLSAVES DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322 15 0.28
VIR777268148822507 YP 001287261.1 hypotheticalproteinTBFG 11316[MycobacteriumtuberculosisF11]391VRRDRAGEL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
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VIR778717148822569 YP 001287323.1 drugABCtransporterATP-bindingprotein[MycobacteriumtuberculosisF11]814VVLDHGRIV DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 9 0.30
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